DNA Marker II

Benzonase核酸酶是一种来自粘质沙雷氏菌(Serratiamarcescens)的非特异性核酸内切酶，它能够高效降解所有形式的DNA和RNA，包括单链、双链、线性和环状核酸，将其消化成2至5个碱基长度的5'-单磷酸寡核苷酸。这种酶在生物技术领域有着广泛的应用，包括：1.**降低粘度**：在蛋白样品制备过程中，Benzonase核酸酶可以降低由于核酸引起的高粘度，从而便于样品处理和提高蛋白产量。2.**去除核酸污染**：在蛋白提取、疫苗生产、生物制药等领域，Benzonase核酸酶用于去除样品中的核酸污染，确保产品质量。3.**提高蛋白质分离效果**：在双向SDS-PAGE蛋白样品制备中，Benzonase核酸酶可以去除带负电荷的核酸，改善蛋白质的分离效果，增强2-DE分辨率。4.**促进蛋白质复性**：在高质量包涵体制备中，Benzonase核酸酶有助于降解核酸，从而促进不可溶性蛋白的复性。5.**稳定性和兼容性**：Benzonase核酸酶在多种条件下稳定，包括高浓度的尿素，且与蛋白酶抑制剂兼容，但需注意EDTA对其活性的抑制作用。此外，Benzonase核酸酶的活性单位定义为在30分钟内使△A260值降低1.0的酶量，相当于完全消化37μgDNA。将合成的gRNA与Cas9 NLS蛋白混合，形成复合物。由于Cas9 NLS蛋白两端都有NLS，有助于复合物快速进入细胞核。DNA Marker II

磁珠本身并不直接参与电泳过程，但它们可以用于电泳后的样品处理，特别是在核酸（DNA或RNA）的提取和纯化过程中。以下是使用磁珠进行电泳后样品处理的一般步骤：1.**凝胶电泳**：-首先，将DNA或RNA样品通过凝胶电泳进行分离。凝胶通常是琼脂糖或聚丙烯酰胺凝胶，根据样品的大小和类型选择合适的凝胶浓度和缓冲体系。2.**观察和切割**：-电泳完成后，使用紫外线照射凝胶并使用适当的染料（如EB或SYBRGreen）对DNA或RNA进行染色，以在紫外光下观察到DNA或RNA的条带。3.**样品提取**：-确定目标DNA或RNA条带后，使用干净的工具（如切割器或移液枪）从凝胶中切割出含有目标分子的凝胶片段。4.**磁珠准备**：-根据磁珠试剂盒的说明书，准备磁珠。通常包括磁珠的重悬和可能的表面修饰，以确保它们能够特异性地结合目标核酸。5.**样品与磁珠混合**：-将切割出的凝胶片段转移到含有磁珠的溶液中，温和地混合以促进磁珠与核酸的结合。6.**磁分离**：-将含有磁珠和核酸的混合物置于磁分离架上，利用磁场使磁珠快速聚集在管底，从而实现与溶液的分离。7.**洗涤**：-移除未结合的溶液，向磁珠上加入洗涤液，再次进行磁分离以去除杂质。Recombinant Cynomolgus CRTAM Protein,His Tag在MAGE-A3基因序列的C末端添加His标签和Avi标签序列。His标签有助于通过金属螯合亲和层析进行蛋白纯化。

pA-Tn5转座酶是一种经过特殊改造的融合蛋白，由ProteinA和高活性的Tn5转座酶组成，具有以下主要应用：1.**高通量测序建库**：pA-Tn5转座酶可以用于快速构建用于高通量测序的DNA文库，通过其转座酶活性实现DNA片段化，同时加上测序接头，简化了传统DNA测序建库的多步过程。2.**CUT&Tag技术**：这是一种新兴的蛋白质与DNA相互作用研究方法，pA-Tn5转座酶利用ProteinA与特定抗体结合，将转座酶带到目标蛋白附近进行DNA切割和标签添加，实现对蛋白质结合位点的高通量测序分析。CUT&Tag技术具有高特异性、低背景噪音、高灵敏度、良好重复性等优点，适用于表观遗传学、干细胞等领域的研究。3.**ATAC-seq**：pA-Tn5转座酶也可用于ATAC-seq实验，这是一种研究染色质可及性的方法，通过转座酶在没有核酸酶消化的情况下切割染色质DNA，然后在切割位点加上测序接头，进行后续的测序分析。4.**转录组测序快速建库**：有研究开发了基于Tn5转座酶的转录组测序快速建库方法，例如SHERRY方法，它利用Tn5转座酶直接作用于RNA/DNA杂交链，简化了建库过程，适用于单细胞转录组测序，提高了样本的利用率和测序速度。

dGTPSolution（脱氧鸟苷三磷酸溶液）在分子克隆中扮演着重要角色，主要应用包括但不限于以下几个方面：1.**DNA合成**：dGTP作为DNA聚合酶的底物之一，在分子克隆中用于合成新的DNA链，特别是在PCR扩增和cDNA合成中。2.**PCR扩增**：在常规PCR和高保真PCR中，dGTP提供必要的核苷酸，以确保目标DNA片段的准确复制。3.**cDNA合成**：在从mRNA模板合成cDNA的过程中，dGTP是合成互补DNA链的关键成分。4.**DNA测序**：dGTP也用于Sanger测序等DNA测序技术中，帮助合成测序反应中的DNA链。5.**质粒构建**：在质粒或其他载体的构建过程中，dGTP可能用于填补缺口或连接DNA片段。6.**引物延伸**：在引物延伸反应中，dGTP用于延伸引物，以合成完整的DNA链。7.**DNA标记**：dGTP可以用于DNA片段的标记，便于后续的克隆和检测。dGTPSolution通常以100mM的浓度提供，以便于在实验中根据需要进行稀释。在使用时，应确保产品具有高纯度、无DNase和RNase污染，以保证实验的准确性和重复性。此外，dGTPSolution应储存在-20°C的条件下，避免反复冻融，以保持其稳定性。Cas9 NLS可用于体外实验中筛选能够高效引导Cas9蛋白进行DNA剪切的gRNA序列 。

PCR抑制剂是指那些在PCR反应中能够干扰或阻碍DNA扩增的物质。这些物质通常来源于生物样本本身或者样本的收集和处理过程。以下是一些PCR抑制剂的特点：1.**多样性**：PCR抑制剂可以是多种不同的化合物，包括胆酸盐、尿素、血红素、酚类化合物、蛋白质、多糖、植物或血液成分等。2.**来源**：它们可能来自血液（如血红素）、尿液（如尿素）、粪便（如胆酸盐）、植物（如多酚和多糖）、土壤（如腐殖酸）或化学物质（如酚类化合物）。3.**影响**：抑制剂可以影响DNA聚合酶的活性，干扰引物的退火，或与DNA模板发生非特异性结合，导致PCR扩增效率降低或特异性下降。4.**复杂性**：由于样本来源的复杂性，不同的抑制剂可能需要不同的策略来克服。某些抑制剂可能通过物理方法（如离心、过滤）去除，而其他抑制剂可能需要化学处理或使用特定的PCR增强剂。5.**浓度依赖性**：抑制效果通常与抑制剂的浓度有关。在较低浓度下，某些抑制剂可能不会影响PCR，但随着浓度增加，抑制效果会变得更加明显。6.**特异性**：某些抑制剂可能对特定的DNA聚合酶或PCR体系有特定的影响。例如，一些抑制剂可能特别影响高GC含量的模板扩增。通过SDS-PAGE、Western blot、质谱等方法验证蛋白的纯度和分子量。通过活性测试评估蛋白的生物活性。Shepherdin (79-87)

His-Avi Tag包含了特定肽段，分子量预测为50.20 kDa，但由于糖基化，其在Tris-Bis PAGE结果上迁移至55-60 kDa。DNA Marker II

5'DNA腺苷酰化试剂盒中使用的酶通常被称为腺苷酰化酶(Adenylase)，这种酶能够催化5'端磷酸化的单链DNA或RNA（pDNA或pRNA）转换成5'端腺苷酰化DNA或RNA（AppDNA或AppRNA）。根据搜索结果，该酶的来源是嗜热古细菌，在大肠杆菌中进行表达并纯化而获得。这种酶在反应中将ATP分解成AMP和PPi，然后将AMP转移到单链DNA的5'磷酸基团上，形成腺苷酰化单链DNA，从而制备出腺苷酰化接头(linker)。此外，一些5'DNA腺苷酰化试剂盒中使用的酶是MthRNA连接酶（例如NEB#M2611A），这种酶也用于生成高产量的5'腺苷酰化DNA，并且操作简便，具有超过95%的效率，无需凝胶纯化即可完成单步反应。MthRNA连接酶是一种已知能够在65℃下有效工作的酶，有助于避免DNA的二级结构对腺苷酰化反应的干扰。这些酶的高效率和特异性使得5'DNA腺苷酰化试剂盒在单链DNA的5'端腺苷酰化修饰中非常有效，常用于miRNA等3'端为羟基的RNA或单链DNA在克隆、高通量测序建库或PCR检测等应用中。DNA Marker II