Corynebacterium trachiae

格雷厄姆氏根瘤菌是豆科家族里更“挑剔”的房客，却只认花生这一位房东。它自带“门禁卡”——特殊的Nod因子，能精细识别花生根毛分泌的染料木苷，两者对接成功，根毛便卷曲成螺旋，把菌请进“地下别墅”。随后，细菌释放信号，诱导根部细胞分裂，三天鼓出乳白根瘤，像给根系挂上微型氮肥厂。瘤内氧气被植物合成的豆血红蛋白调到纳摩级，固氮酶安全开工，将空气中惰性的N₂转化为NH₄⁺，昼夜输送给花生，亩产蛋白因此提升三成，农户少施20公斤尿素，却多收一筐饱满果仁。更妙的是，收获后根瘤遗落田间，氮素缓慢释放，后茬小麦吸氮量提高15%，土壤硝态淋失减少四成，地下水不再“又咸又绿”。如今，科研团队把菌液做成铝箔袋装，拌种即可，比化肥便宜三成，却无污染；还植入耐旱基因，让它在华北旱地也能结瘤。小小格雷厄姆氏根瘤菌，用微米之躯撬动绿色农业，让蓝天少一缕烟，田里多一季香。这种细菌的代谢能力多样，能够适应不同的环境条件，使其成为研究细菌适应性和进化机制的理想对象。Corynebacterium trachiae

巴基斯坦赖氨酸芽孢杆菌（Lysinibacillus pakistanensis）是2009年从巴基斯坦干旱区大豆根际分离的新种，因肽聚糖含meso-二氨基庚二酸而非赖氨酸，在属内独树一帜。菌体革兰氏阳性、具周生鞭毛，可形成椭圆芽孢，能在10–28℃、pH6.5–9.0及0–6%NaCl范围内生长，并耐受150mM硼酸，被视为“中度耐硼”的旱地先锋。在抗逆机制上，该菌细胞膜以二磷脂酰甘油、磷酸乙醇胺为主，脂肪酸iso-C18:0占30%，赋予其高膜稳定性；基因组G+C含量37%，携带多重外排泵与渗透调节基因，可在干旱、盐碱环境中维持胞内水平衡。功能层面，巴基斯坦赖氨酸芽孢杆菌表现出“促生-抗病-解”三合一特性。实验室条件下，其IAA产量达118mg/L，明显高于同属菌株，可刺激小麦根长增加35%，干重提高28%；菌液处理后，花生根结线虫侵染率下降42%，对南方根结线虫卵孵化抑制率超60%，为线虫绿色防控提供新选择。此外，该菌对革兰氏阴性植物病原菌具有明显抑菌圈，代谢产物中的酶抑制剂可干扰细菌双功能酶系统，相关菌机制仍在持续解析。耳炎差异球菌牙龈蛋白酶（Gingipains）是牙龈卟啉单胞菌在细胞内合成并分泌到细胞外的一种胰蛋白酶样半胱氨酸蛋白酶。

克劳氏芽孢杆菌（Bacillus clausii）是芽孢杆菌属中的“耐碱”，1915年由意大利克劳氏从碱性土壤中分离，菌体杆状、周生鞭毛，可在 pH 8–10.5、盐 0–12 % 的条件下旺盛生长，芽孢能耐受 100 ℃ 沸水 30 min，是研究极端碱适应的模式菌之一。一、耐碱机制基因组编码多拷贝 Na⁺/H⁺ 逆向转运蛋白（nhaC、mnh）与碳酸酐酶，可将胞内多余 Na⁺ 泵出并维持 pH 稳态；细胞壁肽聚糖富含 meso-二氨基庚二酸，膜脂分支化程度高，为高温高碱酶的高效表达提供稳定平台。二、工业酶宝库其耐碱蛋白酶在 pH 11、40 ℃ 仍保持 90 % 活性，已用于无磷洗涤剂，血渍、奶渍去污力提升 30 %；耐碱淀粉酶更适 pH 9、90 ℃，可在纺织退浆中省略中和步骤，节能 15 %；耐碱木聚糖酶用于纸浆漂白，氯用量减少 30 %，降低可吸附有机卤化物（AOX）排放。三、农业与环境菌株 SIN 可产 IAA 15 mg·L⁻¹ 并溶磷 2.6 mg·L⁻¹，使玉米根系增 28 %，吸磷量提 18 %；与秸秆复配堆肥，24 h 堆温升至 65 ℃，纤维素降解率提高 30 %，堆肥周期缩短 6 d。耐碱特性使其在 pH 9 的苏打盐碱土中仍能定殖，水稻产量增加 10 %。

BM液体培养基，全名Basal Mineral Liquid Medium，是微生物学界公认的“极简配方”。它只提供生命必需的矿物元素：K₂HPO₄ 1.0 g、KH₂PO₄ 1.0 g、MgSO₄·7H₂O 0.2 g、CaCl₂·2H₂O 0.02 g、Fe-EDTA 0.01 g，加蒸馏水至1 L，pH 6.5±0.1，无碳、无氮、无有机微量元素，因此也被称为“空白画布”。研究者可根据目标菌的代谢特点，精确添加单一碳源（如葡萄糖、苯甲酸、甲烷）、氮源（如NH₄Cl、NO₃⁻或尿素）及特定金属，实现代谢通路、降解基因或耐受机制的单变量研究。BM的高纯度与低背景使其成为环境微生物分离的优先。取河水或土壤浸提液，经0.22 μm过滤除菌后，取1 mL加入含BM的50 mL血清瓶，再投加目标污染物（如50 mg L⁻¹多环芳烃），28℃、150 r/min培养7天，即可富集到以该污染物为碳能源的降解菌群。继代3次后，稀释涂布于含BM的固体平板，菌落纯化率可达90%以上，极大减少杂菌干扰。此外，BM培养基在合成生物学中亦扮演重要角色。研究者可在BM中添加特定浓度的¹³C-葡萄糖或¹⁵N-NH₄Cl，实现全菌体同位素标记，为蛋白质组、代谢流分析提供干净背景；也可通过缺铁、缺锌的BM，研究金属调控蛋白的功能。有研究报道霍氏肠杆菌中存在“高毒力-泛耐药”流行克隆ST133，对临床方面构成挑战 。

高岛氏胶珊瑚菌（Holtermanniella takashimae）是近年来备受关注的珍稀胶质菌，隶属于银耳目，因日本学者高岛首先分离而得名。它通体晶莹剔透，状若海底珊瑚，色泽由纯白到淡黄，质地柔软富有弹性，晒干后收缩成轻薄菌片，复水即恢复原有形态。该菌多生长在海拔500至1500米、湿润凉爽的常绿阔叶林中，常与壳斗科植物形成浅层菌根，对酸性土壤和空气洁净度要求极高，故又被视为森林健康的指示物种。成分分析显示，高岛氏胶珊瑚菌的粗蛋白含量可达干重的55%，氨基酸组成均衡，富含赖氨酸、苏氨酸等人体必需氨基酸；其特有的大分子β-葡聚糖与酸性杂多糖具有明显的免疫启动与抗氧化活性，能明显提升实验动物巨噬细胞的吞噬能力，对自由基DPPH的率高于常见银耳20%以上。此外，菌体中钙、铁、锌等微量元素及维生素B1、B2、D前体含量亦居食用菌前列，为开发天然营养补充剂提供了质量原料。在传统食用方式上，高岛氏胶珊瑚菌以清炖、冰糖羹、菌菇火锅更为常见。其胶质丰厚，久煮不烂，口感滑润，可吸附汤汁精华，入口带淡淡坚果香。现代食品科技则将其超微粉添加到面包、酸奶或植物饮料中，既提升膳食纤维含量，又赋予产品独特爽滑口感。木糖氧化无色杆菌氧化应激特点：抗氧化有体系，酶类物质协同，基因调控应激，维持胞内氧化还原稳态。灰蓝毛霉

科学家正给它插入耐旱基因，希望让戈壁也长出稻浪。Corynebacterium trachiae

甲基营养型芽孢杆菌是土壤里的“碳链炼金师”。它以甲醇、甲胺等一碳化合物为主食，却能把这些常被忽视的小分子变成高值产物。菌体在含甲醇的培养基中迅速萌发，分泌甲醇脱氢酶，将有毒的甲醇先氧化为甲醛，再经RuMP循环固定为果糖-6-磷酸，既获得能量，又合成自身所需碳骨架。整套反应在pH 7、30℃下效率比较高，甲醇转化率可达理论值的92%，远高于化学催化。更难得的是，它同时是一株“生物兵工厂”。在利用甲醇的同时，甲基营养型芽孢杆菌能合成表面活性素、泛革素等脂肽，对黄瓜枯萎、辣椒疫霉、番茄青枯的抑菌带宽达25-30毫米；其挥发性的3-甲基-1-丁醇、2-甲基吡嗪可诱导植物系统抗性，使棉花黄萎病指下降40%。田间试验表明，每亩用200克菌粉滴灌，玉米根际甲醇天然浓度降低60%，植株叶绿素提高1.5个SPAD单位，产量增加8%，且农药使用量减少三成。工业端，科研团队把聚-γ-谷氨酸合成酶基因导入甲基营养型芽孢杆菌，使其在消耗甲醇的同时产出高黏度γ-PGA，可作为保水剂、絮凝剂或医用敷料；5吨罐分批发酵，γ-PGA产量达25 g/L，成本比传统谷氨酸发酵低20%。此外，其芽孢可耐沸水煮15分钟、紫外照射两小时，喷雾干燥存活率超过90%，为大规模制剂化提供了便利。Corynebacterium trachiae