上海FabRICATORIdeS蛋白酶蛋白组学

Genovis的FabRICATOR MagIC自动样品制备可用于分析和监测不同的CQA。mAb在生产或储存过程中的氧化就是这样一种CQA，可能会影响zhiliao产品的质量。为了展示FabRICATOR MagIC如何解决这个问题，对6种mAb的混合物进行强制降解（室温下3个月），并通过反相LC-MS进行分析。当在完整水平上分析mAb时，可以检测到mAb5丰度的显着差异，同时出现许多新的峰。然而，无法获得可靠的质量数据。使用FabRICATOR MagIC，mAb5变化的来源在Fab区域内。随后还原为 Fc/2、LC 和 Fd' 片段，可以识别差异是由于 mAb5 Fd' 片段上的色氨酸氧化，通过形成氧代内酯 （+14 Da） 和二氧代内酯 （+30 Da） 以及 mAb5 LC （-18 Da） 的琥珀酰亚胺化来揭示。此外，还可检测到mAb3轻链的异构化。该示例说明了FabRICATOR MagIC在mAb中级分析中的强大功能，它创建的片段足够小，可以精确定位特定的修饰，而无需耗时耗费资源的肽图分析，所有这些都以相对较少的手动操作时间快速完成。Genovis的IgASAP 是 IgA 消化酶家族。上海FabRICATORIdeS蛋白酶蛋白组学

Blinatumomab（一种对 CD19 和 T 细胞标志物 CD3 具有特异性的 BiTE 分子）的研究级生物仿制药在室温下用固定化过夜的 Genovis的GlySERIAS 消化。通过LC-MS对消解样品的直接分析表明，所有三个连接子区域均被消解，α-CD3 VL和VH链洗脱为一个色谱峰，α-CD19 VH和VL链作为单独的峰洗脱。来自连接的 α-CD3 VH 和 α-CD19 VH 结构域的小峰显示该短连接子未完全消化，表明 GlySERIAS 对短连接子的活性较低。与完整的蛋白质分析相比，四个结构域的分离提供了具有单同位素分辨率的高质量光谱。可以观察到每个结构域的几个不同变体，剩余的连接子残基数量不同。在色谱分离过程中，α-CD3 VH结构域无法从α-CD19 VH结构域完全基线分离，导致在相关质谱中观察到一些共洗脱。四个结构域的分离产生了有关在完整蛋白质水平上鉴定的蛋白质修饰位置的信息。例如，在完整水平上鉴定的 37 Da 的蛋白质修饰被分配给 α-CD3 VH 链。此外，240Da 和 320da 的两个修饰分别被分配给 α-CD3 VL 结构域。后者还含有一个带有五六个组氨酸残基的 His 标签。这些数据证明了使用 Genovis的GlySERIAS Immobilized 对包含多个柔性连接子蛋白进行质量控制的中级工作流程的强大功能。山东GingisKHANIdeS蛋白酶抗体酶切Genovis提供IdeS蛋白酶色谱柱，使得抗体消化和亚基生成的自动化使生物反应器的在线监测应用成为可能。

在Genovis，我们的策略是帮助客户进行中级（或亚基）分析，这是我们的工作，特别是我们的蛋白质酶切产品。完整质量和肽图谱是蛋白质表征的常用方法，我们发现，与简单但信息有限的完整质量和高度复杂但信息丰富的肽图谱相比，中级方法具有优势。通过执行中级描述，您可以生成从完整的质量实验中获得的所有信息，具有额外的优势。在对抗体进行完整质量分析时，很难明确地识别某些修饰。质谱仪器正在改进，可以更有效地分析更大的分子，但通过使用我们的SmartEnzymes，如IdeS，可以将抗体分解成更小的片段，这提高了这些实验可以执行的分辨率，因此，增加了鉴定修饰的信心。此外，你不仅能够更好地识别修改，而且你能够将它们定位到蛋白质上的单个结构域，这是你在完整水平上无法做到的。

其他基于 IgG 的生物制药需要仔细表征和监测关键质量属性，例如氧化、糖基化和其他翻译后修饰。与抗体的克隆选择、工艺开发和稳定性研究相关的大量样品通常通过液相色谱质谱 （LC-MS） 进行分析。然而，在LC-MS之前进行足够规模的样品制备通常具有挑战性。为了解决样品制备的挑战，Genovis将半胱氨酸蛋白酶FabRICATOR（IdeS）固定在磁性琼脂糖珠上，现在称为FabRICATOR MagIC。FabRICATOR固定在磁珠上，可同时快速自动消化多种抗体，促进中级表征工作流程。Genovis的FabRICATOR MagIC 如何以较少的用户交互减少实验和操作时间，降低样品处理错误的风险，同时提高通量。孵育时间为过夜（16-18小时），并且由于酶的特异性，没有过度消化的风险。

为了让所有实验室都能同时快速自动消化多种抗体，Genovis的FabRICATORMagIC的设计具有灵活性，适用于一系列自动化平台。我们在ThermoScientific™KingFisher™纯化系统上优化了FabRICATORMagIC的工作流程，但它可以转移到其他自动化平台，如果没有自动化，在振动台上也能同样出色地工作。消解后，将含有处理样品的深孔板直接转移到LC-MS的自动进样器中进行快速色谱分析，或转移到其他分析方法进行分析。FabRICATORMagIC与在消解缓冲液中添加0.05%聚山梨醇酯20兼容，以极大限度地减少自动化系统中可能发生的纯粹压力。使用KingFisher仪器处理样品时，样品制备非常简单。将样品、树脂和缓冲液移液到指定的孔或板中，然后将板放入仪器中。设计用于FabRICATORMagIC的BindIt™协议将控制每个步骤的孵育温度和时间。可以用Genovis的GlySERIAS固定化酶（琼脂糖珠共价偶联）消化度拉糖肽。云南FabALACTICAIdeS蛋白酶

Genovis发现更多的缓冲液与FabRICATOR活性兼容。上海FabRICATORIdeS蛋白酶蛋白组学

对于涉及完整Fab或Fc抗体片段的应用，需要在抗体铰链处进行消化。木瓜蛋白酶和 Lys-C 等传统酶可用于生成 Fab 片段，但非特异性酶活性需要仔细优化，以极大限度地降低多个消化位点的风险。Genovis的SmartEnzymes IgG 蛋白酶 GingisKHAN 和 FabALACTICA 具有一个消化位点，可从人 IgG1 生成均质的 Fab 和 Fc 抗体片段。生成的片段可用于结晶和高阶结构 （HOS） 的 NMR 研究、结合研究等。在这里，我们提出了获得完整Fab和Fc抗体片段的不同策略。所得片段显示 GingisKHAN 的有效消化，用于生成完整的 Fab 片段或从依那西普上的融合 TNFR 结构域中分离 Fc。由于 GingisKHAN 的特异性消化依赖于 IgG 的天然折叠，因此在变性条件下特异性受到负面影响。为了使用SDS-PAGE分析消解效率，在加入SDS上样缓冲液之前，停止在分析样品中加入碘乙酰胺的反应。Genovis同时提供IdeS酶的纯化试剂盒。上海FabRICATORIdeS蛋白酶蛋白组学