深度测序技术称为深度测序（deepsequencing），是因为它是对传统测序技术的一次性改变，它通过一次性对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定（之前只是几十至多几千个碱基），同时，如此的高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全方面的分析成为可能。你以为深度测序只是一种“养”在实验室“深闺”中摸不着、看不透的高精尖技术？错！... 【查看详情】

微生物检测中含有一种以上的微生物培养物称为混和培养物。如果在一个菌落中所有细胞均来自于一个亲代细胞，那么这个菌落称为纯培养(pureculture)。在进行菌种鉴定时，所用的微生物一般均要求为纯的培养物。得到纯培养的过程称为分离纯化，方法有许多种。先把微生物悬液通过一系列稀释，取一定量的稀释液与熔化好的保持在40-50℃左右的营养琼脂培养... 【查看详情】

在实验室中，为了分离某些厌氧菌，可以利用装有原培养基的试管作为培养容器，把这支试管放在沸水0浴中加热数分钟，以便逐出培养基中的溶解氧。然后快速冷却，并进行接种。接种后，加入无菌的石蜡于培养基表面，使培养基与空气隔绝。另一种方法是，在接种后，利用n2或co2取代培养基中的气体，然后在火焰上把试管口密封。有时为了更有效地分离某些厌氧菌，可以把... 【查看详情】

高通量测序技术又称“下一代“测序技术或深度测序技术，可以一次性对几十万至几百万条DNA分子进行序列测定。现已普遍应用在基因组测序、基因表达分析、非编码小分子RNA鉴定、转录因子靶基因筛选及DNA甲基化等相关的研究领域。高通量测序技术是对传统测序一次性的改变，一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定，因此在有些文献中称其为下一代测序技术... 【查看详情】

微生物检测方法：计数器测定法即用血细胞计数器进行计数。取一定体积的样品细胞悬液置于血细胞计数器的计数室内，用显微镜观察计数。由于计数室的容积是一定的(0.1mm3)，因而根据计数器刻度内的细菌数，可计算样品中的含菌数。本法简便易行，可立即得出结果，不仅适于细菌计数，也适用于酵母菌及霉菌孢子计数。电子计数器的工作原理是测定小孔中液体的电阻变... 【查看详情】

在运用宏基因组测序方法检测的样本量位居全球前列，样本总数居国内第二，其中脑脊液检测量位列全球前二强。除了传染病的应用场景之外，利用mNGS还可以对菌群进行菌株鉴定分型、耐药基因与毒力基因的检测，适用于抗传染院内传染管理的评估。在越来越多的证据表明微生物对人体免疫系统能够产生影响，以及微生物菌群会参与到神经退行性疾病、糖尿病等疾病的发生和发... 【查看详情】

宏病毒组学(ViralMetagenomics)是宏基因组学的一个分支，但与传统的宏基因组学概念不同，它是在宏基因组学概念的基础上，结合病毒自身的特点，将宏基因组学方法应用到病毒学领域而形成的。2002年，Breitbart等(BreitbartM,etal,2002)将宏基因组学方法应用于海洋病毒群落的研究，发现噬菌体为海水中主要病毒组... 【查看详情】

介绍宏病毒组分析的常用软件之前，首先我们来看一下宏病毒组的基本分析流程。这里需要说明的是基于病毒颗粒分离技术及NGS测序平台的宏病毒组学研究还处于起步阶段，分析功能模块新的思路和技术层出不穷，但另一个层面，宏病毒组是宏基因组的一个分支，基本大的分析思路方面与宏基因组还是有着不小的相似之处。归纳一下，宏病毒组主要包括一下几个方面的分析内容：... 【查看详情】

宏基因组有广义和狭义两种概念。广义的概念是指所有可能与人的生活密切相关的微生物的基因组，包括长期共生在体内的微生物，也包括可以进入体内，对人类的生活造成不同形式的影响的微生物。而狭义的宏基因组是指长期共生在体内的微生物。宏基因组测序分析技术：单是共生在人体内的微生物就有1000多种，特别是胃肠道内的微生物为丰富。宏基因组除了这些微生物外，... 【查看详情】

宏基因组测序对环境样本所有微生物基因组DNA进行提取和高通量测序，分析样本环境中所有微生物基因组信息。宏基因组测序解读微生物群体的多样性与丰度信息，分析微生物群体基因组及功能，也探求微生物与环境、微生物与宿主之间的关系，发掘和研究新的功能基因。生物信息分析内容1.测序质量分析与统计、评估；2.数据库比对；3.物种丰度分析；4.功能基因注释... 【查看详情】

进行病毒基因组测序的流程是怎么样的？简而言之，客户只需要说清楚样品情况，准备样品即可，其他事宜都由探普来进行安排。大致流程如下：1)与销售人员沟通项目需求和样本情况；2)探普生物工作人员拟定项目合同，双方协商合同内容后签字盖章；3)按样本准备指南准备好样本，填写信息单后通知销售人员预订干冰，安排样本寄运输,4)客户支付项目启动款，探普生物... 【查看详情】

二代测序相较其他微生物鉴别手段，技术层面的差异主要就是无差别、非特异地将样本中的核酸全部抓取进行测序，这是它能对完全未知的物种实现鉴别的根本原因。搭载大数据分析，就可以将获得的序列信息进行比对或者注释，获得准确的物种信息。实现这一目的，样本需要经历：核酸纯化-文库构建-生物信息学分析这三大基本流程。因此，每一步的实验方案是否足够灵敏，决定... 【查看详情】