宏基因组是指特定环境中全部微生物遗传物质的总和，宏基因组测序以特定环境中的整个微生物群落作为研究的对象，不需对微生物进行分离培养，而是提取环境微生物总DNA进行研究。其摆脱了传统研究中微生物分离培养的技术限制，在基因组水平解读微生物群体的多样性和丰度，探索微生物与环境及宿主之间的关系。目前，第二代高通量测序技术在宏基因组的研究上已被普遍应用。第二代高通量测序平台具有通量高、准确性高、速度快、信息全等特点，加快了宏基因组测序在鉴定低丰度的微生物群落，挖掘更多基因资源方面的应用。微生物鉴定的用途：医疗保健：准确、快速地鉴定细菌和寄生虫,以进行正确和及时的疾病诊断。河南病毒宏基因组测序上哪找
病毒宏基因组测序中人类想要征服新发人畜共患病，只有提前发掘潜在的新的致病的病原，并针对新病原进行基因组分析、流行病学调查、疫苗和抗体的开发等方面的研究。病毒宏基因组学是在宏基因组学基础上发展起来研究特定环境中病毒的新兴技术，该技术结合深度测序技术（第二代、第三代测序技术）已经在人类、动物、特定环境中挖掘出大量的新病毒，该技术不依赖于病毒培养及病毒序列，在国内外被普遍应用于新发人畜共患病病原的挖掘与临床诊断。总之，随着病毒宏基因组学与各种新的分子生物学技术及深度测序技术的结合，该技术展现了区别于传统病毒诊断技术的优势，而该技术对动物病毒的挖掘及其他领域的应用将更加普遍。四川水体微生物多样性分析传统Sanger测序相比，NGS技术的发展使得一个小的研究小组可以拥有大量病毒株的全基因组序列。
状病毒的发现，病原宏基因组测序功不可没。对一种新病毒进行鉴定和检测，其中非常关键的步骤就是获得病毒的全基因组信息。在此次病情监测和防控中，病原宏基因组测序发挥了至关重要的作用，利用其技术优势，研究人员在五天内就鉴定并分析出冠状病毒的基因组，而2003年SARS的鉴定耗时5月余、2013年H7N9的鉴定耗时1月余。冠状病毒2019-nCoV为线性单链RNA（ssRNA）病毒，基因组全长包含29903个核苷酸，10个基因。病毒基因组序列为进一步分析其传染机理，传播途径，药物靶点等提供了有利的支持。
宏病毒组学是宏基因组学的一个分支，但与传统的宏基因组学概念不同，它是在宏基因组学概念的基础上，结合病毒自身的特点，将宏基因组学方法应用到病毒学领域而形成的。2002年，Breitbart等(BreitbartM,etal,2002)将宏基因组学方法应用于海洋病毒群落的研究，发现噬菌体为海水中主要病毒组，这一研究标志着宏病毒组学正式应用于科学研究。简而言之，宏病毒组学就是应用特殊方法把特定环境中所有病毒与其他微生物分开，然后提取的病毒核酸，用高通量技术进行病毒核酸测序，依托现有数据库进行相应的比对工作，并运用软件分析处理后得到研究样品中病毒群落的组成信息。可利用不同底物产生的不同代谢产物来间接检测该微生物内酶的有无，从而达到检测特定微生物的目的。
在探普生物进行宏病毒基因组测序的流程非常简单，简而言之，客户只需要说清楚样品情况，准备样品即可，其他事宜都由探普来进行安排。大致流程如下：1)与销售人员沟通项目需求和样本情况；2)探普生物工作人员拟定项目合同，双方协商合同内容后签字盖章；3)按样本准备指南准备好样本，填写信息单后通知销售人员预订干冰，安排样本寄运输；4)客户支付项目启动款，探普生物启动项目实验和分析并提供测序报告；5)客户支付项目尾款，探普生物提交测序数据和分析结果；6)售后问题处理，项目结题。可利用不同底物产生的不同代谢产物来间接检测该微生物内酶的有无,从而达到检测特定微生物的目的.皮肤微生物测序分析方法
宏基因组测序是通过比对数据库，得到病原体的信息。河南病毒宏基因组测序上哪找
病原微生物二代测序也称宏基因组测序（mNGS）是目前临床上针对病原较常用的基因测序方法。通过对疑似传染标本采集提取后（无需培养）直接进行高通量测序，利用病原微生物数据库比对和分析后可以获得疑似致病微生物种属信息。基于NGS的宏基因组学检测技术在2014年被用于临床传染患者的病原学诊断。目前，多个省市已经将病原微生物二代测序纳入医保报销，助力病毒检测！目前，国家微生物科学数据中心数据资源总量已超过300TB，数据记录数超过了40亿条。可用于临床的微生物数据库包括了超过18000条信息。河南病毒宏基因组测序上哪找
