虽然系统递送的外泌体主要在肝脏、肾脏和脾脏中积累，但通过在外泌体的外表面上展示特定的靶向分子。例如，识别靶抗原的肽或抗体片段，可以获得靶向外泌体；通过在细胞分泌囊泡上展示糖基磷脂酰肌醇（GPI）锚定的纳米抗体，可以使细胞分泌囊泡显示多种蛋白，包括抗体、荧光蛋白和信号分子。自然分泌的外泌体分离纯化直接作为药物的潜力有限，但是，将自然的外泌体分泌所需组分掺入合成脂质体或纳米颗粒中，并且使用可控程序组装后的工程化外泌体模拟物在药学上拥有更大的应用潜力。外泌体可以直接进入受体细胞影响细胞功能。湖南外泌体示踪
与干细胞不同的是：干细胞外泌体对受损的微环境不响应，但它可以通过改变细胞外基质，改变受体细胞的转录组和蛋白质组，来调节细胞凋亡，生长，增殖和分化途径。因此，干细胞外泌体具有减少细胞凋亡、减轻炎症反应、促进血管生成、抑制纤维化、提高组织修复潜力等重要生物学功能，在调控组织再生方面存在良好的临床应用前景。干细胞外泌体的优点，体积小：纳米级粒子，大小约为细胞的1/200，因此能很好地被人体所利用。免疫反应程度低：外泌体不是细胞，只作为载具，外膜的表层上呈现较少的抗原，免疫系统难识别，对人体影响小。可穿透血脑障壁：体积小加上脂质外膜的特性，使其可以通过血脑障壁，抵达脑部组织。外泌体WB蛋白质分子在外泌体信号传递过程中起到了非常重要的作用。
目前，在各种健康与疾病模型中都发现，外泌体通过分子信息传递扮演着重要的角色。外泌体还越来越多地被认为是疾病的生物标志物和预后因子，具有重要的临床诊断和治理意义。除此之外，它们还有潜力被用于临床，作为基因和药物递送的载体。健康人和多种疾病的患者会将含有不同RNA和蛋白质成分的外泌体释放到体液循环中，因其特殊性，外泌体可以作为生物标志物来对疾病进行检测。例如，从血液或尿液中分离的外泌体可以用作病症、心脏病的诊断和预后的指标。
外泌体是具有双层脂膜的囊泡结构, 其稳定性较好, 可保护内部生物分子免受体液中各种酶的影响, 从而保持其完整性和生物活性。外泌体被提取后一般悬浮于磷酸盐缓冲液。目前, 常用的储存方法为冷冻保存, 但是冷冻保存可能会导致外泌体形状与物理性质的改变, 也可能导致多层囊泡的形成和聚集, 反复冻融会导致外泌体表面分子的生物特性、含量和标志物组成发生变化。血清中包含外泌体在内的细胞外囊泡DNA在不同储存环境可保持稳定, 血浆存放于4 °C时其RNA会明显降解, 在–20 °C下长期保存也会导致血浆中外泌体总RNA降解, 但miRNA却十分稳定, 这也提示了外泌体miRNA作为生物标志物的潜力。几乎没有混入外泌体以外的蛋白，回收量高，操作重复性好。
血清和血浆为常规检测样本，具有微创取样的优点，是诊断疾病的理想样本。血液中外泌体能够作为胰腺ai、胃ai、肺ai和阿尔兹海默等疾病的早期诊断和疗效评价提供潜在标志物。血液外泌体来源的疾病标志物主要包括蛋白质和miRNA两类。Melo等发现利用胰腺ai细胞外泌体表面的磷脂酰肌醇聚糖-1(GPC1)能够实现胰腺ai早期诊断，利用该方法对血清中包含GPC1的外泌体进行检测，能够高特异性(100%)、高灵敏度(100%)地区分胰腺ai患者(246例)和正常人(20例)以及慢性胰腺炎患者(37例)。外泌体参与细胞分化、新生血管形成、促进血流恢复和毛xi血管网形成。江西腹水外泌体染色PKH67/PKH26
双层囊膜结构（茶托状）是外泌体重要标志之一，但普通光学显微镜难以观察到此种亚显微结构。湖南外泌体示踪
流式细胞技术针对外泌体的表面抗原标记物进行检测，能够实现外泌体的高通量、多通道分析。但是由于外泌体的粒径小、折射率低，所以采用常规的流式细胞仪进行检测时往往需要将外泌体与beads连接以增大表面积、增强反射，操作耗时又费力。Tian等搭建了一种高灵敏度的流式细胞仪(HSFCM)，将可检测的外泌体粒径降至40nm，能够在不连接beads的情况下实现每分钟10000个外泌体的检测，并且能够结合免疫荧光的方法进行外泌体标志蛋白质的定量检测，目前该仪器已商品化。湖南外泌体示踪
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