南京慢病毒整合位点评估

靶细胞群的转化可能性，这可能与细胞的分化状态、增殖潜力、体外培养条件和体内植入环境等有关。基于已有科学经验和既往非临床/临床研究结果，如果认为基因修饰细胞所采用的载体系统可将外源基因整合到细胞基因组中并可在体内长期存续，需综合分析以上风险因素，评估潜在的插入突变、致瘤/致性风险。非临床研究，应采用具有代表性的基因转导细胞进行基因整合位点分析，分析细胞的克隆组成以及在关注基因（如liu相关调控基因）附近有无优先整合迹象，含有关注整合位点的细胞有无优先异常增殖。非病毒定点整合CAR-T技术的开发和应用。南京慢病毒整合位点评估

遗传物质整合到宿主基因组中、患者长期处于免疫抑制状态诱发（恶性）形成；建议研究病毒整合至目标细胞的典型特征，包括优势插入位点、插入拷贝数、优势克隆异常生长等。关注基因附近是否存在优先整合情况及潜在的致风险。致瘤性的风险：考虑产品特征，所使用整合性载体（如逆转录病毒或转座子等）将外源基因插入到基因组中可能会插入到原基因附近jihuo该基因导致患者风险增加。基因zhiliao产品可能会采用修饰宿主基因组的技术，并有可能在宿主细胞或组织中持续存在。很多基因zhiliao载体的基因整合不会指向基因组的特定位点，可能在整合位点处产生插入突变、或jihuo整合位点附近的原基因等，进而破坏重要基因功能或增加恶性的风险。温州基因编辑整合位点方法对T细胞受体(TCR)β链库进行深度测序(TCR-seq)以及慢病毒载体整合位点(LVIS)分析。

应用场景：单克隆抗体药物辅助筛选；致xingbing毒整合位点检测与整合偏好性分析等；WGS不适用于转染之后未经过传代培养和表型筛选的细胞系。丰富的项目经验目前，唯可已与国内外多家免疫zhiliao研究前沿企业开展合作，采用该方法对高度异质性的CAR-T细胞进行整合位点检测与细胞安全性评估，具有较为丰富的项目经验。一般HBV插入到基因组中形成下图结构。使用三代测序，靶向插入区域的测序reads可分为Readsgroup1（HBV插入区域测通）和Readsgroup2（reads部分比对染色体，部分比对HBV插入区域）。基于三代数据比对后bam文件的IGV图，判断变异类型，推断断点类型和插入序列。

在国家药典委员会公布的《人用基因制品总论》（草案）的3.1条款中，特别指出：“应检测重组载体基因组或质粒的完整性和均一性，载体和zhiliao序列的遗传稳定性”；“对于病毒载体，适当情况下应测定插入位点，并充分评估插入突变的可能性和相关风险”。对此，可分别采用宿主细胞全基因组重测序方法和LM-PCR结合二代测序方法为研究人员提供整合位点检测服务。通过测序分析可对整合位点相关基因进行功能分析，对整合位点偏好性画像，从而评估病毒载体的安全性。慢病毒载体在宿主全基因组范围内的整合位点倾向性分析。

插入突变风险评估一些整合性载体（如逆转录病毒、慢病毒、转座子）可将外源基因插入整合到细胞基因组中，这可能会导致关键基因突变或jihuo原基因，从而导致恶性liu风险增加。影响插入突变的关键风险因素包括：（1）载体的整合特征，如插入位点的偏好性；（2）载体的设计，如增强子、启动子等构建元件的活性，影响邻近基因的潜力；产生剪接突变体的潜在剪接位点或多聚腺苷酸信号等；（3）细胞载体拷贝数；4）转基因表达产物的功能活性（如与细胞生长调控相关）和表达水平；5）靶细胞群的转化可能性，这可能与细胞的分化状态、增殖潜力、体外培养条件和体内植入环境等有关。CAR-T整合位点，推荐唯可生物，实验实力强，专业性高，检测效率高，结果准确率高。杭州crispr/cas9整合位点技术

转基因植物外源基因的检测方法及整合位点分析。南京慢病毒整合位点评估

药代动力学（PK）和药效学（PD）研究。免疫细胞zhiliao产品的药代动力学特点与传统的小分子或生物大分子药物有明显差异，可能无法进行吸收、分布、代谢和排泄（ADME）等传统药代动力学评估。由于检测技术的快速发展，申请人应利用科学合理的药代动力学评估方法，监测细胞活力、增殖/分化（例如细胞表型和功能性标记物）、持续存在（例如血药浓度-时间曲线下面积）、致瘤性、免疫原性、体内分布、异位灶、组织嗜性/迁移以及细胞/产品预期存活期内的功能（或其替代指标)等特性。如果一种方法不能完全反映细胞在体内的PK特性，建议申请人采用多种方法监测细胞在体内的增殖和存活情况。南京慢病毒整合位点评估