软件功能是指酶标仪所具有的对ELISA定性和定量测定及其他测定方式如酶标动力学、紫外和凝集等数据的统计分析并报告结果的功能。软件功能是中酶标仪的一个非常重要的功能。如果硬件方面区别不大，则软件就成为判定酶标仪优劣的惟一指标。对于用户来说，好的软件功能，对实际工作会有较大的帮助。ELISA定性测定，酶标仪如具有阳性判断值（cut-off）及其测定“灰区”（即指测定吸光度处于cut—off周围的一定区域，此区域内结果应为“可疑”）的统计计算功能，不但方便了实验室工作人员，而且在某些特定的情况下，有很高的实用价值。
国内多家机构，如卫生部临床检验中心和计划生育系统等多次强调酶标仪的重要性，并要求酶联免疫检测试剂应使用酶标仪判读，酶免试剂的质控也应使用酶标仪，并提供酶标仪测定的原始数据，而各厂家的试剂盒说明书没有是让用目测的。同时酶免检测的项目往往是一些实质性的和病变（如：肝炎、、优生优育等），判读更要求严谨，由误诊引起的纠纷很难处理。另外，住院手术病人术前的丙肝、艾滋等EIA试剂检测是避免因输血引起引发的医疗事故纠纷的必要手段，正逐渐被许多单位所采用。滤光片作用是根据不同的波长选择性地透过或反射光线，从而实现对样品信号的分离和增强。
K3 Plus酶标仪可以通过USB接口连接打印机接口对读数进行处理。青海双检测模式酶标仪试用
酶标仪在肉制品检测的应用：肉制品检测行业包括养殖厂、屠宰场、肉制品深加工企业等，酶标仪在这些行业的作用主要是检测瘦肉精（盐酸盐酸克伦特罗、莱克多巴胺、沙丁胺醇等）、***等兽药残留。有些客户会把他叫做兽药残留检测仪。酶标仪在乳品检测的应用：酶标仪在乳品行业中主要是检测乳品中的。另外，还可以检测乳品中的违法添加剂—三聚氰胺。酶标仪在水产品检测的应用：酶标仪在水产检测方面主要应用是检测氯霉素、孔雀石绿等***。除食品行业外，酶标仪在饲料、畜牧和医疗行业也发挥着极为重要的作用。在饲料行业，酶标仪主要是测各种******；在畜牧行业（畜牧局、畜牧推广站、畜牧兽医局等），主要是做动物疾病的检测，如猪口蹄疫、猪蓝耳病、猪伪狂犬病、猪瘟等；在医疗上，酶标仪更是应用甚广，是各级医院检验科的免疫室、HIV初筛实验室必备的设备，用于乙肝、梅毒、**等病毒类疾病以及优生优育、**标记物的检测。青海双检测模式酶标仪试用
