人体中也有逆转录过程,比如端粒的复制。端粒(telomere)是染色体末端的特殊结构,由重复的DNA序列(TTAGGG)和核的蛋白组成,可以保护染色体末端,维持基因组完整性。端粒的末端是单链3'末端,形成一种紧凑的T环结构,可保持其稳定性。其表面覆盖着Shelterin复合物,包括TRF1(端粒重复结合因子1)、TRF2(端粒重复结合因子2)、TIN2(TRF1相互作用核的蛋白2)、RAP1(rif相关蛋白)、POT1(端粒保护)和TPP1(端粒保护蛋白1)成功将人表皮干细胞体外分离培养的基础上,对比观察不同发育阶段人表皮干细胞端粒酶反转录酶表达的差异特征,结果表明人胚胎、少儿、成人皮肤来源的表皮干细胞均有端粒酶反转录酶表达,其表达强度依次减弱。提示诱导和增强端粒酶反转录酶的表达对维持表皮干细胞在体外自我更新和增殖能力可能具有重要意义。逆转录实验前应反复检查所有试剂盒的有效期和使用条件。上海茎环法逆转录混合哪家划算
反转录酶的选择:反转录酶(Reversetranscriptase)又称逆转录酶。是以RNA为模板指导dNTP合成互补DNA(cDNA)的酶。一部分反转录酶具有RNA酶活性,能够在转录后降解RNA-DNA杂交链中的RNA链。如果反转录酶没有Rnase酶活性,可加入RNaseH来获得更高的qPCR效率。常用的酶包括Money鼠白血病病毒(MMLV)反转录酶和禽成髓细胞瘤病毒(AMV)反转录酶。依据RT-PCR,理想的状态下是选择具有较高热稳定性的反转录酶,cDNA的合成才能在较高的温度下进行,确保成功转录具有较高二级结构的RNA,并确保在整个反应过程中的全部活性,从而得到质量更高的cDNA。扬州一步法反转录逆转录实验中的RNA样品处理时要避免使用酸性物质、有机溶剂和酶切酶剂。
多逆转录酶都具有多种酶活性,DNA指导的DNA聚合酶活性;以反转录合成的首先条DNA单链为模板,以dNTP为底物,再合成第二条DNA分子。除此之外,有些反转录酶还有DNA内切酶活性,这可能与病毒基因整合到宿主细胞染色体DNA中有关。反转录酶的发现对于遗传工程技术起了很大的推动作用,目前它已成为一种重要的工具酶。用组织细胞提取mRNA并以它为模板,在反转录酶的作用下,合成出互补的DNA(cDNA),由此可构建出cDNA文库(cDNalibrary),从中筛选特异的目的基因,这是在基因工程技术中较常用的获得目的基因的方法。
反转录酶的注意事项,随机引物:适合各种RNA的RT,尤其适合模板丰度很低的情况(比如某个gene表达量很低)。选择随机引物时,首先链cDNA合成反应中就是以所有的RNA为模板,然后进行PCR反应时设计引物进行特异性扩增。同时要注意随机引物的量和总RNA量之间的关系,一般建议每5μg总RNA的随机引物的用量为50ng,如果每5μg总RNA的随机引物的用量超过250ng,可能会导致小片段产物(<500bp)的增加和长片断、全长产物产物的降低。酵母菌逆转录酶是逆转录酶家族中的一个重要表示,逆转录在研究RNA表达调控等领域有普遍的应用前景。逆转录反应首先需要逆转录酶的反应活性。
逆转录酶的质量控制:1.切口酶:在与200单位酶37oC保温60分钟后,超螺旋质粒保留在90%以上。2.DNase测定:200单位酶与50ng3H-DNA37oC保温60分钟,分解出的放射性低于1%。3.RNase测定:200单位酶与50ng3H-RNA37oC保温60分钟,分解出的放射性低于3%。4.首先链cDNA的反应:在标准化的反应中,200单位酶催化从1mg1.2kbRNA或1mg7.5kbRNA将同位素掺入到cDNA中,通过放射自显影,对于1.2kb的RNA,产物cDNA是单一的、全长的条带。对于7.5kb的RNA产物有部分是全长的条带。用这二种RNA放射性转换到cDNA中有12%。5.RNaseH活性:200单位酶与polyA:polydT37oC保温60分钟,释放出的放射性要低于1%。逆转录可改变RNA的信息内容,为研究RNA功能提供基础。杭州miQP2逆转录费用
逆转录技术的发展使RNA研究得到极大便利。上海茎环法逆转录混合哪家划算
RNA逆转录实验注意事项:去除基因组DNA污染:残留的基因组DNA(gDNA)会对荧光定量结果造成很大的干扰,为了使结果更加的真实、可重复,我们需要去除gDNA干扰。我们可以在引物设计时避免gDNA的扩增,比如将上下游引物分别设在不同的外显子上;或者在提取RNA后使用DNaseI处理以除去gDNA。较后,我们还有非常法宝,选择一款具有gDNA去除功能的逆转录试剂盒,一步到位去除gDNA,省心省力max。RNA逆转录实验注意事项:逆转录酶热稳定性:逆转录酶在整个反转录体系中具有关键性影响。除了活性以外,逆转录酶的热稳定性同样很重要,在较高温度下进行逆转录,能够减少RNA的二级结构,增加逆转录的效率。野生型的M-MLV逆转录酶很“怕热”,高于37℃时,稳定性大幅下降。上海茎环法逆转录混合哪家划算