逆转录常见问题及解决方法之组织提取:RNAisolater可以提取miRNA吗?可以提取miRNA。他普遍适用于培养细胞、动物组织、微生物以及代谢较少的植物组织,如幼苗、幼叶等。提取的RNA有基因组DNA污染:a)、向裂解液中加入氯仿后,需要在低温下(2-8°C)高速离心。离心后,RNA被抽提到上层的水相中,中、下层是有机相,含有氯仿。DNA即存在于中层。氯仿在常温下会与水以一定比例互溶,因此,常温离心会导致上层水相中也有少量基因组DNA污染。吸取上层液体时,应非常小心,避免吸到中间层和下层,为此失去一点得率,保留一些上清不吸是非常值得的。RNA应如何保存:建议分装后在-80℃长期保存,在-20℃可以短期保存,但需要尽快使用。逆转录的反应条件和反应体系的优化十分重要。东莞彩色逆转录试剂
miRNA的加尾法逆转录和qPCR,miRNA与mRNA不同,成熟的miRNA的长度只有20nt左右,非常短,通常正向引物就足以覆盖其全长甚至有余,反向引物就无处安放了。那么如何实现miRNA的qPCR扩增呢?解决方案就是在逆转录的时候设法增加逆转录产物长度。普遍的方法有两种,加尾法和茎环法。经过加尾法或茎环法这种特殊的逆转录形式处理之后,得到的cDNA长度从原始的20nt增加到80nt以上,这样就能够实现miRNA的qPCR扩增了。RNA逆转录实验注意事项:选择合适的引物:但其对RNA的完整度和二级结构的要求较高,而且不适用于原核生物。随机引物可以根据碱基情况结合到几乎所有的RNA上,包括mRNA、tRNA和rRNA。广州miQP2反转录逆转录技术的发展使RNA研究得到极大便利。
RNA逆转录实验注意事项:RNA定量:除了掌握RNA的完整性之外,反转录之前还需要对RNA浓度进行测定。一般反转录试剂盒会对上样量有要求,建议totalRNA上样量小于5μg。超过这个范围,会使反转录产物产生偏好性(表达丰度高的基因优先被反转录)而造成定量结果不准确。逆转录引物的选择:逆转录引物一般包含3种:oligodT引物,随机引物和特异性引物。对于短的且不具备发卡结构的真核细胞mRNA,三种都可用。逆转录实验过程中避免光照,防止RNA样品和试剂受光降解或刺激。
逆转录是指以RNA为模板合成DNA的过程,即将遗传信息由RNA逆向传给DNA的过程,其遗传的传递方向与转录相反。反转录酶也可写成逆转录酶又称为依赖RNA的DNA聚合酶。是以RNA为模板指导三磷酸脱氧核苷酸合成互补DNA(cDNA)的酶。哺乳类C型病毒的反转录酶和鼠类B型病毒的反转录酶都是一条多肽链。鸟类RNA病毒的反转录酶则由两上亚基结构。真核生物中也都分离出具有不同结构的反转录酶。RNA指导的DNA聚合酶活性;以RNA为模板,催化dNTP聚合成DNA的过程。此酶需要RNA为引物,多为色氨酸的tRNA,在引物tRNA3′-末端以5′→3′方向合成DNA。反转录酶中不具有3′→5′外切酶活性,因此没有校正功能,所以由反转录酶催化合成的DNA出错率比较高。逆转录过程由逆转录酶催化,此酶也称依赖RNA的DNA聚合酶,即以RNA为模板催化DNA链的合成。
逆转录酶的合成步骤:1、使用前每个组份轻轻混匀,然后2000rpm离心20s;2、取灭过菌且无核酸酶的0.2ml离心管,依次加入2~5μgRNAnμL;3、65℃保温5min,然后冰浴5min;4、往3步骤中的0.2ml离心管依次加入下列组份:RNase抑制剂(40u/μL)0.5μL、10×M-MLVReactionBuffer2μL、DTT(200mM)1μL、逆转录酶(M-MLV)1μL;5、轻轻混匀后,然后2000rpm离心20s;6、先在37℃保温1hr,然后70℃保温15min;7、上述产物可立即进行下一步的PCR反应或-20℃保存。逆转录酶的质量控制:物理纯度:在SDS-PAGE上>90%纯。储存缓冲液:20mMTris-HClpH7.5;200mMNaCl;0.1mMEDTA;1mMDTT;0.01%NP-40(一种去垢剂)和50%甘油。反应缓冲液:250mMTris-HClpH8.3;375mMKCl;15mMMgCl2;50mMDTT(以Part#M531A供应)。逆转录实验完成反应后要及时保存和处理PCR产物,并记录实验数据和结果等。重庆快速逆转录酶报价
逆转录酶是逆转录过程中的重要酶类。东莞彩色逆转录试剂
多逆转录酶都具有多种酶活性,DNA指导的DNA聚合酶活性;以反转录合成的首先条DNA单链为模板,以dNTP为底物,再合成第二条DNA分子。除此之外,有些反转录酶还有DNA内切酶活性,这可能与病毒基因整合到宿主细胞染色体DNA中有关。反转录酶的发现对于遗传工程技术起了很大的推动作用,目前它已成为一种重要的工具酶。用组织细胞提取mRNA并以它为模板,在反转录酶的作用下,合成出互补的DNA(cDNA),由此可构建出cDNA文库(cDNalibrary),从中筛选特异的目的基因,这是在基因工程技术中较常用的获得目的基因的方法。东莞彩色逆转录试剂