逆转录酶实验一步法与两步法具有以下区别:一步法比两步法更快速、简便、减少了污染机会、减少了RNA二级结构、减少了PCR反应的错配率;两步法的优势在于中间产物cDNA,便于保存;且第二步PCR只取逆转录反应产物的1/10进行反应,有利于PCR条件的调整,实验重现性强;两步法可以在第二步PCR反应体系中加入特异性引物,其灵敏度比一步法高;两步法包括首先链cDNA合成和随后的PCR反应,容易产生污染问题;两步法的实验预算要低于一步法。逆转录是2代测序、单细胞测序等技术的前置步骤。厦门加尾法逆转录试剂
RNA逆转录实验注意事项:RNA定量:除了掌握RNA的完整性之外,反转录之前还需要对RNA浓度进行测定。一般反转录试剂盒会对上样量有要求,建议totalRNA上样量小于5μg。超过这个范围,会使反转录产物产生偏好性(表达丰度高的基因优先被反转录)而造成定量结果不准确。逆转录引物的选择:逆转录引物一般包含3种:oligodT引物,随机引物和特异性引物。对于短的且不具备发卡结构的真核细胞mRNA,三种都可用。逆转录实验过程中避免光照,防止RNA样品和试剂受光降解或刺激。广州快速逆转录酶纯度高逆转录实验前应反复检查所有试剂盒的有效期和使用条件。
逆转录引物:加尾法逆转录引物的结构并不是想象中那么简单的oligodT,其包含三个关键结构:①为了与PolyA序列互补配对,OligodT序列必不可少。②在OligodT序列的5端,存在一段通用序列,用于qPCR过程中反向引物与cDNA的结合。③OligodT序列的3端存在一个或两个锚定碱基,V或者VN。(兼并碱基,V表示A、G或C,N表示ATCG中的任意一种)。如果没有锚定碱基,逆转录引物中的OligodT就会随机结合到PolyA的任意位置,这样会造成同一miRNA的逆转录产物长度不一,给较后的熔解曲线检测带来麻烦。因此,锚定碱基的作用就是特异性地结合到miRNA上,从而让逆转录引物结合到紧挨着miRNA的那段PolyA序列上。只有这样,才能够保证同一miRNA的逆转录产物大小相同。
逆转录的过程与端粒复制,逆转录酶通常具有多种活性,如逆转录活性、复制活性与RNA酶H活性。逆转录活性可以RNA为模板,合成与其序列互补的DNA链,生成DNA-RNA杂合双链。RNA酶H活性可以水解杂合双链中的RNA,得到与RNA互补的DNA单链(cDNA)。复制活性则用来合成双链DNA。HIV逆转录酶的活性部位。与复制类似,逆转录也是由5’向3’合成DNA,要求有模板和不少于四个核苷酸的引物。各种DNA聚合酶活性都需要引物,只有确认引物正确配对,才会进行DNA的合成。这是保证其忠实性的重要手段,逆转录酶也不例外。实验室合成cDNA时,经常会用合成的寡聚T(oligodT)作为引物,与mRNA的polyA配对。这个过程比较简单,因为引物结合在RNA链的末端,所以整条链的逆转录是一次性完成的。核酸合成与转录过程与遗传信息的流动方向相反,故称为逆转录。
miRNA加尾法逆转录:miRNA加尾法利用基因组中压缩miRNA元件,通过识别不同转录起始位置,将miRNA连接到其前体mRNA上这种方法可以注意到与miRNA相关的各种信息,例如miRNA功能特异性,miRNA的转录条件和miRNA的表达量等。miRNA的逆转录允许科学家们用特定的miRNA测序技术来节省时间。miRNA逆转录,可以检测miRNA的表达以及miRNA与RNA的瓦作关系,还可以检测miRNA的调节的位点。同样,miRNA表达量的研究也能够通过miRNA逆转录来进行,从而帮助我们更好地了解miRNA在细胞信号转导中发挥着重要作用。逆转录在研究RNA表达调控等领域有普遍的应用前景。厦门加尾法逆转录试剂
逆转录后的DNA可直接用于基因克隆或测序等应用。厦门加尾法逆转录试剂
人体中也有逆转录过程,比如端粒的复制。端粒(telomere)是染色体末端的特殊结构,由重复的DNA序列(TTAGGG)和核的蛋白组成,可以保护染色体末端,维持基因组完整性。端粒的末端是单链3'末端,形成一种紧凑的T环结构,可保持其稳定性。其表面覆盖着Shelterin复合物,包括TRF1(端粒重复结合因子1)、TRF2(端粒重复结合因子2)、TIN2(TRF1相互作用核的蛋白2)、RAP1(rif相关蛋白)、POT1(端粒保护)和TPP1(端粒保护蛋白1)成功将人表皮干细胞体外分离培养的基础上,对比观察不同发育阶段人表皮干细胞端粒酶反转录酶表达的差异特征,结果表明人胚胎、少儿、成人皮肤来源的表皮干细胞均有端粒酶反转录酶表达,其表达强度依次减弱。提示诱导和增强端粒酶反转录酶的表达对维持表皮干细胞在体外自我更新和增殖能力可能具有重要意义。厦门加尾法逆转录试剂
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