RT-PCR逆转录中模板的选择：在RT-PCR实验中，选择总RNA或纯化的mRNA作为模板进行逆转录十分重要。mRNA虽然能提供略高的灵敏度，但总RNA经常使用，具有较mRNA更重要的优势。首先，其过程需要较少的纯化流程，这保证了更好的回收模板和更好的把结果标准化为起始的细胞数。第二，避免mRNA富集步骤，为了避免不同mRNA的回收率而带来结果偏移的可能性。总之，在大多数的应用中，目标基因的相对定量比检测的非常灵敏度更重要，因此在多数情况下，总RNA更适用。逆转录酶是逆转录过程中的重要酶类。南京茎环法逆转录试剂纯度高
加尾法逆转录的较大特点在于：对于抽提纯化的miRNA，进行无差别加尾。因此，如果用户需要对样本中的多个miRNA进行考察，一次逆转录即可完成对所有qPCR模板的制备。qPCR引物方面，miRNA以及内参的反向引物都是通用引物R，不同的只是正向引物。因此在设计加尾法miRNA的qPCR引物时，只需设计特异性正向引物即可，正向引物的特异性直接决定了实验结果的好坏。总之，加尾法适合对样本中多个miRNA的快速检测。引物设计简单，但有非特异性的风险。由于其特殊的加PolyA机制，因此miRNA加尾法逆转录是无法只通过常规的mRNA逆转录试剂盒完成的。上海miQP2逆转录酶供货商逆转录引物的设计需要考虑反向引物的特性。
逆转录的过程：生物体中的逆转录过程就比较复杂，比如逆转录病毒（retrovirus）。病毒是真正的“极简风”，所有东西都压缩到非常。比如它的基因组中，经常有些基因是重叠、嵌套结构，充分利用每一个碱基。所以它也不会专门编码一个引发酶来合成引物，它一般是在组装时带走宿主的tRNA，在下次侵染时当作引物使用。被用作引物的tRNA会结合在病毒基因组RNA链的中间，所以首先次只能合成出一部分cDNA，然后利用基因组RNA两端的一段重复序列，“跳”回另一端，完成整条链的逆转录。之后水解RNA链的时候，会留下一些片段作为复制的引物。双链DNA的合成同样也需要经过一次跳跃（jump），以合成完整双链。较后两端具有相同的序列，称为长末端重复（longterminalrepeats，LTR）。LTR不只包含跳跃时用来配对的序列，还有整合信号、启动子、增强子、polyA位点等重要结构。
茎环法逆转录是一种逆转录反应的技术，它利用茎环结构的RNA分子作为反向引物，在逆转录过程中特异性地扩增目标RNA分子。该技术在分子生物学和医学研究中得到了普遍的应用，特别是在RNA的研究和检测中具有独特的优势。茎环法逆转录技术的基本原理是利用逆转录酶和茎环结构的RNA作为反向引物，将RNA逆转录成cDNA，并在PCR反应中扩增。茎环结构的RNA分子具有较高的稳定性和特异性，可以特异性地识别和结合目标RNA分子，从而在逆转录反应中作为反向引物扩增目标cDNA。此外，由于茎环结构的RNA分子与目标RNA分子的碱基序列互补，因此茎环法逆转录技术可以避免随机引物引起的非特异扩增。逆转录实验可以选择加入RNA合成抑制剂RNAse防止RNA降解和污染。
miRNA的加尾法逆转录和qPCR，miRNA与mRNA不同，成熟的miRNA的长度只有20nt左右，非常短，通常正向引物就足以覆盖其全长甚至有余，反向引物就无处安放了。那么如何实现miRNA的qPCR扩增呢？解决方案就是在逆转录的时候设法增加逆转录产物长度。普遍的方法有两种，加尾法和茎环法。经过加尾法或茎环法这种特殊的逆转录形式处理之后，得到的cDNA长度从原始的20nt增加到80nt以上，这样就能够实现miRNA的qPCR扩增了。RNA逆转录实验注意事项：选择合适的引物：但其对RNA的完整度和二级结构的要求较高，而且不适用于原核生物。随机引物可以根据碱基情况结合到几乎所有的RNA上，包括mRNA、tRNA和rRNA。逆转录实验时要记录反应体系的温度、时间、反应试剂的添加量等参数。cDNA合成逆转录酶哪家划算
逆转录可用于新型病毒的检测。南京茎环法逆转录试剂纯度高
逆转录常见问题及解决方法之组织提取：RNAisolater可以提取miRNA吗?可以提取miRNA。他普遍适用于培养细胞、动物组织、微生物以及代谢较少的植物组织，如幼苗、幼叶等。提取的RNA有基因组DNA污染：a)、向裂解液中加入氯仿后，需要在低温下(2-8°C)高速离心。离心后，RNA被抽提到上层的水相中，中、下层是有机相，含有氯仿。DNA即存在于中层。氯仿在常温下会与水以一定比例互溶，因此，常温离心会导致上层水相中也有少量基因组DNA污染。吸取上层液体时，应非常小心，避免吸到中间层和下层，为此失去一点得率，保留一些上清不吸是非常值得的。RNA应如何保存：建议分装后在-80℃长期保存，在-20℃可以短期保存，但需要尽快使用。南京茎环法逆转录试剂纯度高
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