逆转录是一种重要的生物学现象,它在生物体内发挥着重要的作用。逆转录是指将RNA转录成DNA的过程,与正常的DNA转录成RNA的过程相反。这个过程由逆转录酶来完成,而逆转录酶是一种酶类蛋白质,普遍存在于病毒和一些细胞中。逆转录的重要性在于它是某些病毒的复制过程中必不可少的一步。许多病毒的遗传物质是RNA分子,而它们必须先将RNA转录成DNA,才能利用细胞的合成机制来进行复制。这种转录过程一旦完成,病毒的DNA就可以与宿主细胞的DNA结合在一起,从而使病毒的遗传物质被复制并传递下去。逆转录实验中引物设计时要注意反向引物特异性和长度,避免循环扩增和特异性问题。苏州彩色逆转录纯度高
逆转录是指以RNA为模板合成DNA的过程,即将遗传信息由RNA逆向传给DNA的过程,其遗传的传递方向与转录相反。反转录酶也可写成逆转录酶又称为依赖RNA的DNA聚合酶。是以RNA为模板指导三磷酸脱氧核苷酸合成互补DNA(cDNA)的酶。哺乳类C型病毒的反转录酶和鼠类B型病毒的反转录酶都是一条多肽链。鸟类RNA病毒的反转录酶则由两上亚基结构。真核生物中也都分离出具有不同结构的反转录酶。RNA指导的DNA聚合酶活性;以RNA为模板,催化dNTP聚合成DNA的过程。此酶需要RNA为引物,多为色氨酸的tRNA,在引物tRNA3′-末端以5′→3′方向合成DNA。反转录酶中不具有3′→5′外切酶活性,因此没有校正功能,所以由反转录酶催化合成的DNA出错率比较高。重庆一体化逆转录酶企业逆转录活性可以RNA为模板,合成与其序列互补的DNA链,生成DNA-RNA杂合双链。
逆转录的过程:生物体中的逆转录过程就比较复杂,比如逆转录病毒(retrovirus)。病毒是真正的“极简风”,所有东西都压缩到非常。比如它的基因组中,经常有些基因是重叠、嵌套结构,充分利用每一个碱基。所以它也不会专门编码一个引发酶来合成引物,它一般是在组装时带走宿主的tRNA,在下次侵染时当作引物使用。被用作引物的tRNA会结合在病毒基因组RNA链的中间,所以首先次只能合成出一部分cDNA,然后利用基因组RNA两端的一段重复序列,“跳”回另一端,完成整条链的逆转录。之后水解RNA链的时候,会留下一些片段作为复制的引物。双链DNA的合成同样也需要经过一次跳跃(jump),以合成完整双链。较后两端具有相同的序列,称为长末端重复(longterminalrepeats,LTR)。LTR不只包含跳跃时用来配对的序列,还有整合信号、启动子、增强子、polyA位点等重要结构。
逆转录的端粒复制:逆转录经常与细胞恶性转化有关,艾滋、乙肝等很多疾病也有逆转录过程。所以相关研究可以为很多疾病的研究和防治提供帮助。逆转录酶抑制剂就一直是药物研发热点,例如抗HIV的nevirapine。逆转录酶缺乏校对(3'-5'核酸外切酶)功能,所以容易出错。这也是很多病毒容易突变进化的原因,比如nevirapine就很容易被抵抗。不过,校对功能与逆转录活性并不矛盾。有人使用改良的定向进化策略从具有校对功能的DNA聚合酶(古细菌的DNA聚合酶B)进化出高保真的耐热逆转录酶,称为逆转录异种聚合酶(reversetranscriptionxenopolymerase),证明校对与逆转录是兼容的。在科研中,RTX可用于RT-PCR等过程,能够提高精确度及简化操作程序。逆转录实验要使用高质量的反转录酶和逆转录引物,避免引物交叉污染。
RT-PCR逆转录引物设计原则:1.上下游引物要保守:扩增子长度需选择一段保守片段(100-200bp)进行PCR扩增,选择片段需跨越内含子,因内含子的基因组DNA序列不会被扩增,也可减少从污染的基因组DNA中扩增得到的假阳性风险。引物选取同样需要保守。2.引物长度和Tm值:引物设计长度为18-25bp,Tm值在50-65℃之间,引物中GC含量在40-60%。设计引物时尽量避免出现4个或超过4个G碱基。RT-PCR实验阴性对照:反转录阴性对照应包括在所有的RT-PCR的实验中,用来检测DNA是否污染(如基因组DNA或PCR产物)。该对照所指不加反转录酶,通过反转录过程得到cDNA在进行荧光定量PCR检测。如检测到扩增,则样本中可能含有基因组DNA污染。逆转录经常与细胞恶性转化有关,艾滋、乙肝等很多疾病也有逆转录过程。重庆一体化逆转录酶企业
逆转录引物的设计需要考虑反向引物的特性。苏州彩色逆转录纯度高
逆转录的转录过程:基因的转录是由RNA聚合酶催化进行的。基因的上游具有结合RNA聚合酶的区域,叫作启动子。启动子是一段具有特定序列的DNA,具有和RNA聚合酶特异性结合的位点,决定了基因转录的起始位点。RNA聚合酶与启动子结合后,在特定区域将DNA双螺旋两条链之间的氢键断开,使DNA解旋,形成单链区,以非编码链为模板合成RNA互补链的过程就开始了。转录的延长是以前面核苷酸的3′-OH为基础逐个加入NTP,形成磷酸二酯键,使RNA逐步从5′向3′端延伸的过程。在原核生物中,因为没有核膜的分隔,转录未完成即已开始翻译,而且在同一个DNA模板上同时进行多个转录过程。电镜下看到的羽毛状图形和羽毛上的小黑点(多聚核糖体),是转录和翻译高效率的直观表现。苏州彩色逆转录纯度高
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