RT-PCR就是逆转录PCR或称为反转录PCR(Reversetranscription-PCR,RT-PCR),是以RNA为材料应用于PCR扩增中的一种实验方法。首先通过逆转录酶将总RNA或信使RNA(mRNA)转录成互补DNA(cDNA)。其次TaqDNA聚合酶以cDNA为模板进行qPCR扩增。RT-PCR已被普遍应用于多种分子生物学应用中,包括基因表达分析、基因测试、RNA干扰验证检测、微阵列验证、病原体检测和疾病研究。RT-PCR的方法之一步法和两步法:RT-PCR其操作方法分为两种,即一步法和两步法。一步法RT-PCR,逆转录同PCR扩增结合在一起,即cDNA合成与PCR扩增反应在同一管Buffer及酶中进行,一步完成。两步法RT-PCR,RNA首先在反转录酶的作用下生成cDNA,再以cDNA为模板进行PCR扩增,分成两步进行。逆转录PCR反应过程中要注意反应管中溶液面积不宜过高,避免泡沫问题。杭州一步法反转录哪家好
miRNA逆转录茎环法:首先需要进行RNA样品制备,可选的方法有:离心柱法抽提(不必去除gDNA);传统Trizol法抽提(需要去除gDNA)。miRNA正向引物:需要分别设计。是否采用通用引物视情况而定,正向引物与通用反向引物不会形成二聚体时才能用。取200ul的PCR管,根据所得每组RNA的浓度C,每孔加入1000ng总RNA,按公式1000ng/C计算出所需RNA的体积x。然后按建议的20μL反应体系说明,依次向200μL的PCR管内加入下列试剂:加样结束后,移液器吹打混匀,低速离心数秒。将逆转录PCR管放入PCR扩增仪内,调整参数:37℃15min(反转录反应),85℃5s(反转录酶的失活反应),4℃∞。反应结束后根据实验需要进行荧光定量PCR或放入-20℃冰箱保存。说明:此处可以选择U6下游引物作为U6的逆转录引物,注意相应地调整无酶水的体积和反应温度。上海一体化逆转录酶纯度高逆转录酶是逆转录过程中的重要酶类。
M-MLV反转录酶比AMV反转录酶缺乏连续性,因此要获得像AMV反转录酶反应中产生同样量的cDNA就要求使用较多单位的M-MLV反转录酶。用1微克的mRNA起始合成首先条链的cDNA,要用8单位的M-MLV反转录酶才相当于1单位的AMV反转录酶的作用。该酶很容易被亚精胺(Spermidine)所抑制,该酶非常不能用Promega的RiboprobeAMV反转录酶5X反应缓冲液,也不能用Promega的RiboclonecDNA首先条链缓冲液,因为这二种缓冲液均含有亚精胺。逆转录实验可以选择加入RNA合成抑制剂RNAse防止RNA降解和污染,逆转录实验过程需适当的RNA质量,过少或质量不佳将影响扩增效果。
逆转录实验的准备工作:1、实验器具与材料:(1)移液头:200ul、10ul;(2)吸头:200ul、20ul;(3)EP管1。5ml、100ul;(4)水浴箱。2、实验器具的处理与准备,塑料制品:(包括吸头、EP管等)将塑料制品逐个浸泡于1‰DEPC水中(必要时小头头需要用吸管打入DEPC水)37℃过夜,然后送至高压3次,后在80℃烘烤箱中烘干(或置于37℃中8小时左右烘干),试验前将头头放入吸头台。3、试剂配制和准备:(1)DEPC水:泡实验器具的DEPC水的配制:1000ml双蒸水中加1mlDEPC,放在1000ml容量瓶中静置4小时后备用。逆转录中所用的DEPC水的配制:100ml盐水瓶内装40ml双蒸水,加40ulDEPC,37℃过夜,送至高压,后分装到几个1。5mlEP管中,-20℃中保存备用。(2)RT中所需要的各种试剂。逆转录引物的设计需要考虑反向引物的特性。
逆转录的发现有重要的理论意义和实践意义。(1)在致死病毒的研究中发现了病基因,在人类一些病细胞如膀胱病、小细胞肺病等细胞中,也分离出与病毒病基因相同的碱基序列,称为细胞病基因或原病基因。病基因的发现为疙瘩发病机理的研究提供了很有前途的线索。(2)在实际工作中有助于基因工程的实施。由于目的基因的转录产物易于制备,可将mRNA反向转录形成DNA用以获得目的基因。逆转录酶实验操作注意事项:RNA提取一定要迅速,样本要新鲜,组织尽量在液氮中研磨;RNA提取完马上进行逆转录不要拖延,新提的RNA很容易降解;逆转录反应过程,需建立无RNAase环境,以避免模板RNA降解。RNase是RNA水解酶的统称,包含RNaseA,RNaseH等,RNaseA可以水解单双链RNA,RNaseH主要水解RNA与DNA杂交双链中的RNA。逆转录后的DNA可用于构建基因工程载体。上海茎环法逆转录哪家专业
逆转录在研究RNA表达调控等领域有普遍的应用前景。杭州一步法反转录哪家好
逆转录的端粒复制:对于线性基因组,其滞后链的末端是无法完整复制的,每次约损失30-200个核苷酸(Cells.2020Feb22;9(2).)。这样随着细胞分裂,端粒会持续缩短,造成复制性衰老。对于大多数体细胞来说,端粒磨损是一种控制其分裂潜力的机制,但对于需要多次增殖的干细胞来说,必须设法维持端粒长度。端粒酶(telomerase)可以通过逆转录过程延长端粒。端粒酶由端粒酶RNA(TERC)和端粒酶逆转录酶(TERT)组成。TERT使用TERC作为模板,在染色体的单链末端合成端粒DNA的重复序列。大多数体细胞缺乏端粒酶活性,因而容易衰老。但未分化的生殖细胞,干细胞,活化的淋巴细胞和大多数疙瘩细胞具有高水平的端粒酶活性,可以克服端粒磨损并维持无限的细胞分裂。杭州一步法反转录哪家好
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