RT-PCR逆转录中模板的选择：在RT-PCR实验中，选择总RNA或纯化的mRNA作为模板进行逆转录十分重要。mRNA虽然能提供略高的灵敏度，但总RNA经常使用，具有较mRNA更重要的优势。首先，其过程需要较少的纯化流程，这保证了更好的回收模板和更好的把结果标准化为起始的细胞数。第二，避免mRNA富集步骤，为了避免不同mRNA的回收率而带来结果偏移的可能性。总之，在大多数的应用中，目标基因的相对定量比检测的非常灵敏度更重要，因此在多数情况下，总RNA更适用。HIV病毒复制的一个重要步骤就是逆转录。上海一步法逆转录蛋白检测
miRNA加尾法逆转录：miRNA加尾法利用基因组中压缩miRNA元件，通过识别不同转录起始位置，将miRNA连接到其前体mRNA上这种方法可以注意到与miRNA相关的各种信息，例如miRNA功能特异性，miRNA的转录条件和miRNA的表达量等。miRNA的逆转录允许科学家们用特定的miRNA测序技术来节省时间。miRNA逆转录，可以检测miRNA的表达以及miRNA与RNA的瓦作关系，还可以检测miRNA的调节的位点。同样，miRNA表达量的研究也能够通过miRNA逆转录来进行，从而帮助我们更好地了解miRNA在细胞信号转导中发挥着重要作用。上海一步法逆转录蛋白检测逆转录是以RNA为模板合成DNA的过程，即RNA指导下的DNA合成。
逆转录的过程与端粒复制，逆转录酶通常具有多种活性，如逆转录活性、复制活性与RNA酶H活性。逆转录活性可以RNA为模板，合成与其序列互补的DNA链，生成DNA-RNA杂合双链。RNA酶H活性可以水解杂合双链中的RNA，得到与RNA互补的DNA单链（cDNA）。复制活性则用来合成双链DNA。HIV逆转录酶的活性部位。与复制类似，逆转录也是由5’向3’合成DNA，要求有模板和不少于四个核苷酸的引物。各种DNA聚合酶活性都需要引物，只有确认引物正确配对，才会进行DNA的合成。这是保证其忠实性的重要手段，逆转录酶也不例外。实验室合成cDNA时，经常会用合成的寡聚T（oligodT）作为引物，与mRNA的polyA配对。这个过程比较简单，因为引物结合在RNA链的末端，所以整条链的逆转录是一次性完成的。
逆转录酶还有DNA内切酶活性，这可能与病毒基因整合到宿主细胞染色体DNA中有关。逆转录酶的发现对于遗传工程技术起了很大的推动作用，它已成为一种重要的工具酶。用组织细胞提取mRNA并以它为模板，在逆转录酶的作用下，合成出互补的cDNA，由此可构建出cDNA文库（cDNAlibrary），从中筛选特异的目的基因，这是在基因工程技术中较常用的获得目的基因的方法。简要过程表示：逆转录酶的作用是以dNTP为底物，以RNA为模板，tRNA(主要是色氨酸tRNA)为引物，在tRNA3'-末端上，按5'→3'方向，合成一条与RNA模板互补的cDNA单链，它与RNA模板形成RNA-cDNA杂交体。随后又在反转录酶的作用下，水解掉RNA链，再以cDNA为模板合成第二条DNA链。至此，完成由RNA指导的DNA合成过程。病毒复制方式：逆转录病毒（属于RNA病毒）：RNA→DNA→RNA。拟逆转录病毒（属于DNA病毒）：DNA→RNA→DNA。逆转录反应首先需要逆转录酶的反应活性。
反转录酶(reversetranscriptase,也可写成逆转录酶)又称为依赖RNA的DNA聚合酶。1970年Temin等在致死RNA病毒中发现了一种特殊的DNA聚合酶，该酶以RNA为模板，以dNTP为底物，tRNA(主要是色氨酸tRNA)为引物，在tRNA3'-OH末端上，根据碱基配对的原则，按5'-3'方向合成一条与RNA模板互补的DNA单链，这条DNA单链叫做互补DNA(complementaryDNA，CDNA)。反转录酶（Reversetranscriptase）是以RNA为模板指导三磷酸脱氧核苷酸合成互补DNA（cDNA）的酶。哺乳类C型病毒的反转录酶和鼠类B型病毒的反转录酶都是一条多肽链。鸟类RNA病毒的反转录酶则由两上亚基结构。真核生物中也都分离出具有不同结构的反转录酶。逆转录可用于新型病毒的检测。武汉彩色逆转录混合制造商
逆转录实验时要记录反应体系的温度、时间、反应试剂的添加量等参数。上海一步法逆转录蛋白检测
逆转录酶的质量控制：1.切口酶：在与200单位酶37oC保温60分钟后，超螺旋质粒保留在90%以上。2.DNase测定：200单位酶与50ng3H-DNA37oC保温60分钟，分解出的放射性低于1%。3.RNase测定：200单位酶与50ng3H-RNA37oC保温60分钟，分解出的放射性低于3%。4.首先链cDNA的反应：在标准化的反应中，200单位酶催化从1mg1.2kbRNA或1mg7.5kbRNA将同位素掺入到cDNA中，通过放射自显影，对于1.2kb的RNA，产物cDNA是单一的、全长的条带。对于7.5kb的RNA产物有部分是全长的条带。用这二种RNA放射性转换到cDNA中有12%。5.RNaseH活性：200单位酶与polyA:polydT37oC保温60分钟，释放出的放射性要低于1%。上海一步法逆转录蛋白检测
