逆转录实验的准备工作:1、实验器具与材料:(1)移液头:200ul、10ul;(2)吸头:200ul、20ul;(3)EP管1。5ml、100ul;(4)水浴箱。2、实验器具的处理与准备,塑料制品:(包括吸头、EP管等)将塑料制品逐个浸泡于1‰DEPC水中(必要时小头头需要用吸管打入DEPC水)37℃过夜,然后送至高压3次,后在80℃烘烤箱中烘干(或置于37℃中8小时左右烘干),试验前将头头放入吸头台。3、试剂配制和准备:(1)DEPC水:泡实验器具的DEPC水的配制:1000ml双蒸水中加1mlDEPC,放在1000ml容量瓶中静置4小时后备用。逆转录中所用的DEPC水的配制:100ml盐水瓶内装40ml双蒸水,加40ulDEPC,37℃过夜,送至高压,后分装到几个1。5mlEP管中,-20℃中保存备用。(2)RT中所需要的各种试剂。逆转录的反应机理是RNA模板上的DNA合成。一体化反转录生产商
miRNA的加尾法逆转录和qPCR,miRNA与mRNA不同,成熟的miRNA的长度只有20nt左右,非常短,通常正向引物就足以覆盖其全长甚至有余,反向引物就无处安放了。那么如何实现miRNA的qPCR扩增呢?解决方案就是在逆转录的时候设法增加逆转录产物长度。普遍的方法有两种,加尾法和茎环法。经过加尾法或茎环法这种特殊的逆转录形式处理之后,得到的cDNA长度从原始的20nt增加到80nt以上,这样就能够实现miRNA的qPCR扩增了。RNA逆转录实验注意事项:选择合适的引物:但其对RNA的完整度和二级结构的要求较高,而且不适用于原核生物。随机引物可以根据碱基情况结合到几乎所有的RNA上,包括mRNA、tRNA和rRNA。一体化反转录生产商逆转录现象说明:至少在某些生物中,RNA同样兼有遗传信息传递和表达功能。
逆转录实验步骤:引物浓度计算方法:(新合成的引物的稀释)假如终浓度为XuM(pmol/ul)加DEPC水体积(ul)=(OD×33×1000000)/(分子量×X)。用AMV逆转录酶进行RT(10ul体积)1、准备0.65mlEP管。2、加入4.5ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA。3、稍离心,100℃沸水裕1min。4、加入0.5uldNTP,2ul5×Buffer,1ulAMV逆转录酶。5、稍离心,封口膜封口,42℃水浴90℃作RT。6、100℃沸水裕3min灭活AMV。7、立即PCR或-20℃保存。逆转录实验时注意事项:为避免RNA酶污染,在RT中仍要佩戴一次性手套和口罩。
反转录酶的选择:反转录酶(Reversetranscriptase)又称逆转录酶。是以RNA为模板指导dNTP合成互补DNA(cDNA)的酶。一部分反转录酶具有RNA酶活性,能够在转录后降解RNA-DNA杂交链中的RNA链。如果反转录酶没有Rnase酶活性,可加入RNaseH来获得更高的qPCR效率。常用的酶包括Money鼠白血病病毒(MMLV)反转录酶和禽成髓细胞瘤病毒(AMV)反转录酶。依据RT-PCR,理想的状态下是选择具有较高热稳定性的反转录酶,cDNA的合成才能在较高的温度下进行,确保成功转录具有较高二级结构的RNA,并确保在整个反应过程中的全部活性,从而得到质量更高的cDNA。逆转录PCR反应过程中要注意反应管中溶液面积不宜过高,避免泡沫问题。
RT-PCR逆转录中模板的选择:在RT-PCR实验中,选择总RNA或纯化的mRNA作为模板进行逆转录十分重要。mRNA虽然能提供略高的灵敏度,但总RNA经常使用,具有较mRNA更重要的优势。首先,其过程需要较少的纯化流程,这保证了更好的回收模板和更好的把结果标准化为起始的细胞数。第二,避免mRNA富集步骤,为了避免不同mRNA的回收率而带来结果偏移的可能性。总之,在大多数的应用中,目标基因的相对定量比检测的非常灵敏度更重要,因此在多数情况下,总RNA更适用。逆转录是2代测序、单细胞测序等技术的前置步骤。南昌彩色逆转录酶
逆转录实验时要记录反应体系的温度、时间、反应试剂的添加量等参数。一体化反转录生产商
miRNA加尾法逆转录:miRNA,即microRNA,是一类非常短的RNA分子,只有几十到几百个核首酸,在正常细胞存活期间会产生大量的miRNA。miRNA起着重要的抑制作用,它可以抑制特定mRNA的表达以及细胞中内含物翻译和转录等功能他们是催化机制,负责影响细胞及其产物的生物学复杂性和稳定性,对于宿主机体影响是非常重要的。miRNA加尾法是一种获得miRNA及其前体的研究方法之。较重要的是,它是RNA千扰技术的一个重要组成部分。过去的研究发现,通过miRNA加尾法获得的新miRNA表达调节了细胞信号传导、细胞分裂和细胞凋亡等多重信号传递通路,其过程非常复杂。一体化反转录生产商