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免疫沉淀基本参数
  • 品牌
  • 世途科生物
  • 产品名称
  • 免疫沉淀磁珠Protein A/G
  • 有效期
  • 12个月
免疫沉淀企业商机

染色质免疫共沉淀(Chromatinimmunoprecipitation,ChIP)技术是目前公认的研究此相互作用的选择,是真核生物基因表达机制研究中不可或缺的技术之一。
它的基本原理是在活细胞状态下,固定蛋白质-DNA(染色质)复合物,并将其切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过免疫学方法(抗体亲和)沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的 DNA,通过对目的片段的纯化与后期检测,从而获得蛋白质与 DNA 相互作用的信息。
这项技术通过蛋白质与DNA互作来分析目标基因活性以及已知蛋白质的靶基因,被广泛应用于体内转录调控因子与靶基因启动子上特异核苷酸序列结合方面的研究。该技术常与DNA芯片和分子克隆技术相结合。
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免疫沉淀技术(Immunoprecipitation, IP)的实验设计通常包括以下几个关键步骤:

1. 目标蛋白质的选择:
2. 抗体的选择:选择特异性强、亲和力高的抗体来捕获目标蛋白质
3. 样本的准备:收集和准备细胞或组织样本。
4. 蛋白质的裂解和释放:选择合适的裂解条件,如pH值、离子强度、去污剂等。
5. 蛋白质浓度的测定:确定裂解液中蛋白质的浓度,以便于后续步骤的标准化。
6. 免疫沉淀的操作:将特异性抗体与裂解液混合,并在适宜的条件下孵育,以形成抗体-抗原复合物。
7. 非特异性结合的减少:通过预纯化步骤去除可能的非特异性结合蛋白。
8. 洗涤:多次洗涤以去除未结合的蛋白质和杂质。
9. 目标蛋白质的洗脱:使用适当的缓冲液洗脱抗体-抗原复合物。
10. 后续分析:对洗脱的蛋白质进行进一步分析,如Western Blot.
11. 对照实验:设计适当的正对照和负对照,以评估实验的特异性和敏感性。
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Co-IP的优势:
1. 生理相关性:Co-IP可以在接近生理条件的条件下捕获蛋白质相互作用。
2. 特异性:使用特异性抗体可以提高实验的特异性。
3. 广泛应用:Co-IP技术适用于多种样本类型,包括细胞培养、组织样本等。
Co-IP的局限性:
1. 抗体依赖性:需要高质量的特异性抗体,否则可能得到假阳性或假阴性结果。
2. 非特异性结合:可能存在非特异性结合问题,需要仔细的实验设计和对照来控制。
3. 技术挑战:对于低丰度或弱相互作用的蛋白质,Co-IP可能面临技术挑战。

免疫沉淀技术(Immunoprecipitation, IP)是一种用于研究蛋白质相互作用和纯化特定蛋白质的实验方法。
优点:
1. 特异性强:利用特异性抗体捕获目标蛋白,可以有效地从复杂的生物样本中分离出感兴趣的蛋白质。
2. 灵敏度高:可以检测到低丰度的蛋白质,包括瞬态或弱相互作用的蛋白质复合物。
3. 应用范围广:适用于多种生物样本,如细胞裂解物、组织提取物和生物流体。
4. 生物学洞察深入:能够揭示蛋白质之间的相互作用网络,有助于理解细胞内的信号传递和调控机制。
5. 可与其他技术联用:如与质谱(IP-MS)联用,可以准确鉴定蛋白质及其相互作用伙伴。
缺点:
1. 对抗体依赖性高:需要高亲和力和高特异性的抗体,抗体的质量直接影响实验结果。
2. 可能存在非特异性结合:样本中的其他蛋白质可能与抗体或固相支持物发生非特异性结合,导致背景噪音。
3. 可能影响蛋白质的天然状态:裂解和沉淀过程可能会改变蛋白质的构象和功能。
4. 实验重复性:需要多次实验来确保结果的可重复性和可靠性。
5. 样品处理:需要避免样品降解和非特异性结合,这可能需要使用蛋白酶抑制剂和适当的缓冲液条件。
免疫沉淀技术ChIP的实验方法。

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ChIP(染色质免疫沉淀)实验是一种用于研究蛋白质与DNA相互作用的技术。以下是ChIP实验的实验方法概述:
1. 交联:将细胞与交联剂(如1%甲醛)孵育,通常在室温下进行10-15分钟。
2. 终止交联:添加甘氨酸以终止交联反应,孵育5分钟。
3. 收集细胞:通过离心收集细胞,并用PBS洗涤以去除交联剂。
4. 细胞裂解:使用裂解缓冲液裂解细胞,释放染色质。
5. 染色质剪切:使用超声波或酶消化将染色质剪切成适当大小的片段。
6. 免疫沉淀:将剪切后的染色质与特异性抗体孵育,然后添加蛋白A/G磁珠。
7. 洗涤:用低盐、高盐和LiCl洗涤液洗涤磁珠,去除非特异性结合物。
8. 洗脱:用洗脱缓冲液洗脱DNA。
9. 逆转交联:用蛋白酶K处理,然后在65°C下加热过夜以逆转交联。
10. DNA纯化:使用商业试剂盒或标准酚/氯仿方法纯化DNA。
11. 分析:使用qPCR分析富集的DNA,或进行测序以确定蛋白质结合位点。
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免疫沉淀技术的实验方法通常包括以下步骤:
1. 样本准备
2. 细胞裂解:使用裂解缓冲液(含有蛋白酶抑制剂以防止蛋白质降解)裂解细胞,释放蛋白质。
3. 蛋白质浓度测定:使用BCA、Bradford或Lowry等方法测定裂解液中蛋白质的浓度。
4. 抗体预处理:如果使用预固定的抗体,需先将抗体固定在固相支持物上,如琼脂糖珠或磁性微珠。
5. 免疫沉淀反应:将裂解液与特异性抗体(固定或未固定)混合,并在4°C下缓慢摇晃孵育过夜,以允许抗体与目标蛋白质充分结合。
6. 固相支持物的回收:对于未固定的抗体,加入与抗体特异性结合的蛋白A或蛋白G结合的固相支持物。
7. 洗涤:去除未结合的蛋白质和杂质,通常需要多次洗涤固相支持物。
8. 洗脱:使用适当的洗脱缓冲液(如加热的SDS加载缓冲液或酸性缓冲液)从固相支持物上洗脱免疫复合物。
9. 后续分析:对洗脱的蛋白质进行SDS-PAGE电泳、Western Blot、质谱分析等,以进一步分析目标蛋白质。
10. 对照实验:包括正对照(已知能沉淀目标蛋白的抗体)和负对照(非特异性抗体或无抗体)以验证实验的特异性。
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