天津10X Chromium X单细胞测序数据分析可视化

单细胞测序是指针对单个细胞进行全转录组测序分析，可精确地描述每一个细胞的状态，在异质性发育过程中具有特殊的应用价值。然而，单细胞测序无法给出固态异质化组织中细胞空间排布信息，对于揭示发育过程、病理微环境都存在很大的局限性。空间转录组测序以点阵形式记录病理切片细胞的空间信息并进行测序，可以精确指示点阵内的全部基因表达情况。空间转录组测序的加入，无疑让单细胞测序如虎添翼，更精确地勾勒了组织水平的异质性。烈冰实验室包含从样本处理到测序下机的全套实验平台。天津10X Chromium X单细胞测序数据分析可视化

单细胞多组学提升见解 基于测序的数据能够将彰显其强大之处，因为它能够了解同一单细胞的多种生物分析指标。如果说单细胞基因表达提供了一种颜色的详细信息，那么单细胞多组学提供了同一细节的全彩色图谱，为您带来样本的真实视图。烈冰2021年强势引进的10x Genomics Chromium单细胞平台能够从同一单细胞中读取细胞复杂性的多组学特征。与传统方法不同，单细胞多组学简化了您需要开展的实验，也节省了您需要分析的样本，而能获得相同的结果。这不但节省了宝贵的样本，还保证了更高的生物学准确性，因为您不需要匹配拆分样本的数据集并通过计算来推断各个组学之间的关系。北京二代测序单细胞测序技术支持烈冰测序数据分析平台，不依赖已有物种信息，可研究非模式物种，针对不同平台的数据，制定多套流程；

一味的追求高细胞数量的捕获，小心得不偿失，原因在这：单细胞测序所有的分析都是基于细胞聚类进行，而细胞聚类是在区分cell和non-cell后，获得细胞基因表达谱，通过降维（pca），无监督聚类以及可视化（t-SNE）得到的。进行细胞聚类时需要考虑到每个细胞的基因表达模式，因此即使是相同的数据，在剔除几个细胞的情况下，前后获得的聚类图也会出现明显不同。而当细胞捕获数过多时，无论是假阴性和假阳性数据还是多细胞数据，都会对正常细胞聚类产生影响，造成聚类结果失真。这也是很多文章，特别是很多高分文章，为什么单个样本捕获细胞数在2000-3000的原因了。烈冰建议单个样本捕获细胞数在3000-5000个时，数据量在100G左右时，可以满足分析和文章发表的多重需求。

10× Genomics单细胞方案要求使用具有较高活性的单细胞悬液。在实际实验中，我们发现因为样本类型和制备单细胞悬液方法的不同，容易出现单细胞悬液中死亡细胞的比例较高的情况。去除单细胞悬液中的死细胞和其他污染物对获得高质量数据是至关重要的。这是因为，死亡的细胞易裂解导致其中的RNA释放出来。这种cell-free RNA会导致检测的背景噪声，并会影响单细胞数据的质量。因此当样本活性较差时，对细胞悬液中细胞活性检测后，需要进行一般死细胞去除的工作（一般悬液活性小于70%时考虑此操作），以保证较高的上机捕获细胞的质量。全线搭建10X Genomics Chromium Controller单细胞测序平台。

基于10X Next GEM技术，单细胞测序一次实验可以同时检测近万个细胞，可在一个样本中同时获3'端mRNA表达谱、如需和免疫组库（TCR和BCR）的数据进行联合时，即某些研究还需结合基因的表达谱和V(D)J数据进行复杂组织样本的是影响免疫应答分析，监测免疫疗法的效果，研究疾病发生、发展的分子机制，可进行单细胞免疫组库测序： 烈冰单细胞免疫组库平台具备：1000+项目经验，一次实验可同时获取1000-20000个细胞的文库构建，获得转录组和免疫组数据； 具备完善的免疫组库测序和实验质控流程，获取V(D)J全长序列的配对信息；丰富的免疫组库测序和数据分析经验，实现专属个性化数据分析服务，搭配单细胞分析云平台，一键导出交互性的动态结果报告。单个细胞的基因结构和基因表达状态，并鉴定细胞的类型。吉林单细胞测序平台

单细胞测序技术提供了单个细胞水平下的科学研究视角。天津10X Chromium X单细胞测序数据分析可视化

科技的发展让单细胞测序已经应用于疾病发展过程中的关键过程和事件，如前病变向恶性的转化、恶性向转移性的发展，以及对多种用药的反应。单细胞测序技术作为一个需要将组织解离成为单细胞悬液，或者是采用细胞核捕获的策略捕获单细胞核，进而对于每一个单细胞或者细胞核进行测序得到结果的技术，其空间定位信息是丢失的。这就衍生出了一个问题就是如果单细胞A与B并不出现在一个组织区域中他们会互相影响或者转化么？免疫研究中，两个具有非常强的PDL1-PD1的配对关系的细胞在组织切片上风马牛不相及，这样PDL1-PD1的关系会生效么？天津10X Chromium X单细胞测序数据分析可视化

上海烈冰生物医药科技有限公司属于医药健康的高新企业，技术力量雄厚。是一家有限责任公司（自然）企业，随着市场的发展和生产的需求，与多家企业合作研究，在原有产品的基础上经过不断改进，追求新型，在强化内部管理，完善结构调整的同时，良好的质量、合理的价格、完善的服务，在业界受到宽泛好评。公司拥有专业的技术团队，具有单细胞测序，生物大数据云分析平台，空间转录组测序，单细胞多组学测序等多项业务。烈冰生物自成立以来，一直坚持走正规化、专业化路线，得到了广大客户及社会各界的普遍认可与大力支持。