对于单细胞测序而言,常常需要先构建细胞图谱,在此基础上再开展后续各项分析,并且数据分析时以细胞聚类(cell cluster)为讨论对象,而不是像常规Bulk测序一样以组别为分析对象,因此单细胞测序项目对样本入组要求没有Bulk测序那样严格,但是单细胞测序,特别是目的为图谱研究时,需要通过提高样本复杂度(增加样本数),尽可能的构建某一疾病类型、群体细胞图谱信息。因此,单细胞测序实验设计时首先需要保证生物学重复,不同样本来源的样本建议单独进行细胞解离和捕获、建库、测序,以保证捕获到足够的细胞数,单个样本分别捕获细胞时,后续分析除了整体分析以外,还可以做单样本分析,保证分析的完备准确性。烈冰单细胞多组学测序助您探究细胞类型特异性和基因调控网络特征。成都10X Genomics单细胞测序服务
作为单细胞测序的一个重要里程碑,10x genomic公司于2016年2月推出10x Chromium Single Cell Gene Expression Solution,此平台整合了仪器、试剂盒和信息学软件,能精确对接illumina测序仪,因此可实现大量大细胞的快速高效标记、测序和分析,获得单细胞水平的基因表达谱和差异情况,并通过对复杂细胞群体进行深入细致分析,绘制大规模单细胞表达图谱。 以量化细胞内的群体异质性,并逐个鉴定细胞类型、细胞状态和动态细胞跃迁。除了有望鉴定新的细胞亚型和稀有细胞群体,单细胞技术还能更好地了解转录动态和基因调控关系。武汉二代测序单细胞测序服务烈冰实验室包含从样本处理到测序下机的全套实验平台。
单细胞多组学提升见解 基于测序的数据能够将彰显其强大之处,因为它能够了解同一单细胞的多种生物分析指标。如果说单细胞基因表达提供了一种颜色的详细信息,那么单细胞多组学提供了同一细节的全彩色图谱,为您带来样本的真实视图。烈冰2021年强势引进的10x Genomics Chromium单细胞平台能够从同一单细胞中读取细胞复杂性的多组学特征。与传统方法不同,单细胞多组学简化了您需要开展的实验,也节省了您需要分析的样本,而能获得相同的结果。这不但节省了宝贵的样本,还保证了更高的生物学准确性,因为您不需要匹配拆分样本的数据集并通过计算来推断各个组学之间的关系。
针对单细胞测序数据分析时的reads数、基因表达量及细胞数量判定过程中:以捕获5000个细胞、100G的测序量为标准,每个细胞的reads数大约在50k左右;每个细胞的基因中位数取决于样本的细胞类型,例如成熟的B,T,粒细胞数量较多的组织中,由于该类型细胞表达的基因数普遍较少,导致基因中位数下降。而某些疾病组织、或者体外培养的如干细胞等,他们的基因表达数较高,甚至可以超过1W,这就导致该类样本基因中位数非常高。因此,我们对细胞数量以及基因中位数确认时,需要考察实际组织的细胞组成。全线搭建10X Genomics Chromium X单细胞实验测序平台。
单细胞测序是指针对单个细胞进行全转录组测序分析,可精确地描述每一个细胞的状态,在异质性发育过程中具有特殊的应用价值。然而,单细胞测序无法给出固态异质化组织中细胞空间排布信息,对于揭示发育过程、病理微环境都存在很大的局限性。空间转录组测序以点阵形式记录病理切片细胞的空间信息并进行测序,可以精确指示点阵内的全部基因表达情况。空间转录组测序的加入,无疑让单细胞测序如虎添翼,更精确地勾勒了组织水平的异质性。烈冰科技已建立了多种国际和国内主流的高通量测序实验平台。南京高通量测序单细胞测序数据分析培训班
十二年测序经验,烈冰生物单细胞多组学领域的佼佼者。成都10X Genomics单细胞测序服务
基于10X Next GEM技术,单细胞测序一次实验可以同时检测近万个细胞,可在一个样本中同时获3'端mRNA表达谱、如需和免疫组库(TCR和BCR)的数据进行联合时,即某些研究还需结合基因的表达谱和V(D)J数据进行复杂组织样本的是影响免疫应答分析,监测免疫疗法的效果,研究疾病发生、发展的分子机制,可进行单细胞免疫组库测序: 烈冰单细胞免疫组库平台具备:1000+项目经验,一次实验可同时获取1000-20000个细胞的文库构建,获得转录组和免疫组数据; 具备完善的免疫组库测序和实验质控流程,获取V(D)J全长序列的配对信息;丰富的免疫组库测序和数据分析经验,实现专属个性化数据分析服务,搭配单细胞分析云平台,一键导出交互性的动态结果报告。成都10X Genomics单细胞测序服务
上海烈冰生物医药科技有限公司致力于医药健康,以科技创新实现***管理的追求。烈冰生物作为生物科技、医药科技、信息科技、计算机科技领域内的技术开发、技术服务、技术转让、技术咨询,市场营销策划,市场信息咨询与调查(不得从事社会调查、社会调研、民意调查、民意测验),从事货物及技术的进出口业务,计算机、软件及耗材(除专控),软件开发【依法须经批准的项目,经相关部门批准后方可开展经营活动】的企业之一,为客户提供良好的单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序。烈冰生物不断开拓创新,追求出色,以技术为先导,以产品为平台,以应用为重点,以服务为保证,不断为客户创造更高价值,提供更优服务。烈冰生物创始人陈岱,始终关注客户,创新科技,竭诚为客户提供良好的服务。