从单细胞测序描述性分析转向复杂样本中不同细胞类型的功能解析,越来越需要一种多组学的细胞生物学视角。通过单细胞多组学——即对不同组学的数据集进行分析和整合——科学家能够从同一个单细胞来源中检测多种细胞特征。这些特征包括全转录组基因表达、细胞表面蛋白表达、免疫组库序列(包括T细胞和B细胞受体)以及用于了解表观基因组调控的开放染色质区域。随着单个实验可提供更多信息丰富的数据,研究人员的获益更多,包括保留珍贵样本、提高生产力、减少因批次效应引起的错误,并节省更多的高科技资源(从资助基金到人员时间)。单细胞测序是高通量测序下的又一重大技术突破。广东BD单细胞实验平台
基于测序的数据能够将彰显其强大之处,因为它能够了解同一单细胞的多种生物分析指标。如果说单细胞基因表达提供了一种颜色的详细信息,那么单细胞多组学提供了同一细节的全彩色图谱,为您带来样本的真实视图。烈冰自2019年引进的BD Rhapsody单细胞平台以来,能够从同一单细胞中读取细胞复杂性的多组学特征。与传统方法不同,单细胞多组学简化了您需要开展的实验,也节省了您需要分析的样本,而能获得相同的结果。这不但节省了宝贵的样本,还保证了更高的生物学准确性,因为您不需要匹配拆分样本的数据集并通过计算来推断各个组学之间的关系。宁波BD Rhapsody单细胞服务机构烈冰科技已建立了多种国际和国内主流的高通量测序实验平台和自主研发国产化实验平台。
关于单细胞测序实验样本制备,这与流式细胞术用户熟悉的步骤完全一致,也就是通过酶促或机械消化、细胞分选或其他细胞分离技术从整个样本中制备生成活的单细胞悬液。随后是细胞计数和质量控制步骤,以确保您的样本有适当浓度的活细胞,并且不含细胞团块和死细胞碎片。如有必要,您还可以使用抗体对样本进行染色,标记细胞表面蛋白或其他生物分析物,或者通过FACS来富集感兴趣的细胞类型。解离样本时采取的具体步骤将根据您的起始材料和实验目标而定。也许需要额外的制备步骤,具体取决于组织质量、样本丰度、细胞大小,以及是否需要提取出细胞核进行染色质可接近性分析。无论具体的考虑因素如何,所有样本类型都遵循同一个基本原则,那就是生成高质量的单细胞悬液。
根据烈冰多年单细胞测序服务经验,为什么不建议您一味的追求高细胞数量的捕获:单细胞测序所有的分析都是基于细胞聚类进行,而细胞聚类是在区分cell和non-cell后,获得细胞基因表达谱,通过降维(pca),无监督聚类以及可视化(t-SNE)得到的。进行细胞聚类时需要考虑到每个细胞的基因表达模式,因此即使是相同的数据,在剔除几个细胞的情况下,前后获得的聚类图也会出现明显不同。而当细胞捕获数过多时,无论是假阴性和假阳性数据还是多细胞数据,都会对正常细胞聚类产生影响,造成聚类结果失真。这也是很多文章,特别是很多高分文章,为什么单个样本捕获细胞数在2000-3000的原因了。烈冰建议单个样本捕获细胞数在3000-5000个时,数据量在100G左右时,可以满足分析和文章发表的多重需求。助力探索生命时空多维度的动态变化的生物学信息;助力医疗健康时代!
烈冰生物单细胞测序服务体系,不仅提供10X Genomics和BD Rhapsody两大国际认可的单细胞实验平台,在“附加”产品上,我们提供BD FACS Melody流式细胞仪,满足您对特殊细胞类型的富集需求,自主研发的Panocell单细胞捕获芯片,可兼容BD 平台全套原装磁珠、试剂和protocol,为您提供完整的单细胞多组学解决方案。从细胞多样本分析和染色所需的试剂到检测试剂盒,生物信息分析工具,和在线大数据分析系统、精简方案和专业团队技术支持,烈冰生物可为您提供用于单细胞多组学甚至到空间转录组测序的各种工具,助您加速科研探索之旅。烈冰全线实验平台满足超深度、大规模发现和复杂疾病研究的测序。天津BD单细胞测序
烈冰科技成立10余年,为科研学者提供专注的测序数据分析服务。广东BD单细胞实验平台
烈冰科技于2010年诞生之初便立足于高通量测序行业,为科研学者提供专注的测序数据分析服务,先后经历基因芯片时代、基因测序、转录组测序时代...在科技日新月异的洪流中始终独占鳌头。2018年以来,单细胞测序进入发展的快车道,烈冰作为国内首批引进单细胞实验双平台的公司,依托自主研发的NovelBrain®生物大数据分析平台,为用户提供一站式全流程的单细胞测序服务和解决方案。4年的单细胞技术的积累,烈冰已具备大鼠、小鼠、斑马鱼、猴、裸鼹鼠、水稻、拟南芥等10+物种,皮肤、脑、脂肪、心脏、花序等50+组织类型,100+细胞类型,1000+靶标基因,10000+样本处理经验。广东BD单细胞实验平台
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