对于单细胞测序而言,常常需要先构建细胞图谱,在此基础上再开展后续各项分析,并且数据分析时以细胞聚类(cell cluster)为讨论对象,而不是像常规Bulk测序一样以组别为分析对象,因此单细胞测序项目对样本入组要求没有Bulk测序那样严格,但是单细胞测序,特别是目的为图谱研究时,需要通过提高样本复杂度(增加样本数),尽可能的构建某一疾病类型、群体细胞图谱信息。因此,单细胞测序实验设计时首先需要保证生物学重复,不同样本来源的样本建议单独进行细胞解离和捕获、建库、测序,以保证捕获到足够的细胞数,单个样本分别捕获细胞时,后续分析除了整体分析以外,还可以做单样本分析,保证分析的完备准确性。单细胞测序平台,烈冰提供高性价比服务方案。无锡BD Rhapsody单细胞测序服务
单细胞获得困难,不同组织要求不尽相同难以搞定? 烈冰2000+项目消化经验,100+组织类型解离protocol,精心设计不同组织实验的解离、细胞悬浮实验体系,确保单细胞的获得。 冻存样本无法实验,珍贵样本无法使用? 烈冰采用国际认可的冻存组织复苏技术以及死细胞过滤技术,确保冻存组织使用。 珍贵样本,细胞数量太少,消化背景杂无法做单细胞? 采用国际认可的10X Genomics,BD Rhapsody双平台模式,根据样本实际情况和用户需求提供客观有效的实验方案,细胞量少,背景杂也能做单细胞。 单细胞RNA分类精度不足,部分细胞无法细分? 烈冰同时采用单细胞蛋白质组与单细胞转录组测序技术,真正做到从上游到下游的全流程检测,确保超高的细胞分类精度。重庆BD单细胞实验服务附加流式分选细胞表面Marker,对于较低分辨率的标志物也能有效鉴定,助力高要求测序项目。
烈冰生物单细胞测序服务,为您提供可视化质控系统,保证每次实验的可靠性:BD Rhapsody 扫描仪具有直接成像功能,可在工作流程的不同阶段进行质量控制,如细胞捕获率和细胞多态率(双细胞率)。成像仪指标可以确认起始细胞样本的质量,并确认微孔板工作流程中每个步骤的成功完成状态 ;在细胞裂解前的步骤中评估细胞活性;并对通过测序确定的细胞回收量进行可靠估算。利用这些信息,在进行高成本的下游测序之前,用户可根据需要改变方向并解决实验中遇到的问题。这些指标允许用户对不同工作日间的或者不同研究中心间的工作流程性能进行跟踪。
现有的单细胞测序技术阵营在几个主要领域存在差别。一个是基于微流控通道的细胞与Beads的在通道内的动态结合,通过油相水相不相容的特点将结合了的细胞和Beads进行分隔,在这个空间,单个细胞的内容物释放,转录本或其他生物分析物被标记或添加索引,以便下游识别。BD Rhapsody单细胞测序平台采用静态微孔技术(Cyto-Seq具有类似的技术原理)。通过微孔板的物理分隔,将一个个单个细胞和带有标签的磁珠,一对一的“框”在微反应的物理平台中。这样,每一个细胞都会结合一个磁珠,那么在每一个磁珠中上长满了不同的Cell Barcode和UMI Barcode连接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,这个抓手就会使用oligo dT抓住mRNA构建文库。烈冰生物全国五大实验中心,多地部署BD Rahpsody平台,助您的样本更快速抵达“战场”。
您的珍贵样本,可以放心依赖烈冰生物BD Rhapsody单细胞捕获系统,基于BD平台从原理到效率到通量的多重包容性,使得BD平台对实验过程存在的批次效应产生的可能性更小,可在技术、生物学、实验中心和用户之间的样本检测获得一致、可靠的结果,而磁珠的拆分使用和即时存储,可增加实验设计的灵活性,配套的BD Scanner可视化工作流程质控,从细胞铺板前微孔板空板检测,到细胞上样、磁珠上样、磁珠洗涤扫描、细胞裂解、磁珠回收、回收磁珠扫描等全过程,均实现BD Scanner的可视化质控,让您的每个样本在实验端全程无忧。烈冰实验室包含从样本处理到测序下机的全套实验平台。无锡BD单细胞测序
烈冰对于一个细胞群体中的每个细胞单独进行建库测序分析。无锡BD Rhapsody单细胞测序服务
针对单细胞测序数据分析时的reads数、基因表达量及细胞数量判定过程中:以捕获5000个细胞、100G的测序量为标准,每个细胞的reads数大约在50k左右;每个细胞的基因中位数取决于样本的细胞类型,例如成熟的B,T,粒细胞数量较多的组织中,由于该类型细胞表达的基因数普遍较少,导致基因中位数下降。而某些疾病组织、或者体外培养的如干细胞等,他们的基因表达数较高,甚至可以超过1W,这就导致该类样本基因中位数非常高。因此,我们对细胞数量以及基因中位数确认时,需要考察实际组织的细胞组成。无锡BD Rhapsody单细胞测序服务
上海烈冰生物医药科技有限公司属于医药健康的高新企业,技术力量雄厚。烈冰生物是一家有限责任公司(自然)企业,一直“以人为本,服务于社会”的经营理念;“诚守信誉,持续发展”的质量方针。以满足顾客要求为己任;以顾客永远满意为标准;以保持行业优先为目标,提供***的单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序。烈冰生物自成立以来,一直坚持走正规化、专业化路线,得到了广大客户及社会各界的普遍认可与大力支持。