从单细胞测序描述性分析转向复杂样本中不同细胞类型的功能解析,越来越需要一种多组学的细胞生物学视角。通过单细胞多组学——即对不同组学的数据集进行分析和整合——科学家能够从同一个单细胞来源中检测多种细胞特征。这些特征包括全转录组基因表达、细胞表面蛋白表达、免疫组库序列(包括T细胞和B细胞受体)以及用于了解表观基因组调控的开放染色质区域。随着单个实验可提供更多信息丰富的数据,研究人员的获益更多,包括保留珍贵样本、提高生产力、减少因批次效应引起的错误,并节省更多的高科技资源(从资助基金到人员时间)。2019年,烈冰已助力发表了采用BD Rahpsody平台的单细胞风湿类文章。烈冰单细胞实验服务
相对于Smart-Seq技术在细胞数量上的问题,BD平台普遍提供的细胞数量都在1000-10000不等的测序细胞量,特殊研究需求的项目,可提供上限40000个细胞的捕获量(单个样本)。这个量级的测序细胞量已经可以说能够完全覆盖绝大部分组织的Single Cell群体类型。因此,对于基于基因表达进行准确细胞分型上,无论是从细胞数量上来说还是表达检测可靠性来说,都会更实用。此外针对特殊项目研究,如需要捕获和分析脆弱的细胞,如粒细胞、中性粒细胞、CAR-T细胞、干细胞、移植瘤细胞、骨髓瘤细胞等,烈冰生BD平台也有更好的捕获效能,满足您的实际需求。single cell 单细胞测序服务公司从样本处理到终端数据分析,只要您需要,烈冰提供全流程的无忧服务。
多样本数据合并:Fraction of Reads Kept:合并样本时,各样本根据Mapped Barcoded Reads per Cell数量计算出来的数据利用率。如果各样本间该参数值相差很大,需要进行Downsample处理,以数据量少的样本为基准将不同样本中细胞测序深度标化到同一水平,从而避免因测序深度差异导致的基因检测数量、基因表达水平的差异。烈冰科技自主研发的单细胞云平台致力于帮助每一位客户定制化分析数据,深度解读数据分析结果,深入挖掘其背后的生物学意义;从操作便捷、结果可视化、分析可追溯、系统稳定等方面助力单细胞研究,加速科研进程!
细胞计数和活力评估在评估样本质量时,需要在细胞清洗和过滤之后测定细胞活力,这一点至关重要。测定细胞活力有许多种方法,烈冰多年单细胞测序经验发现台盼蓝法在鉴定活细胞与死细胞的比例时效果很好。细胞计数的准确性以及目标回收量和实际回收量之间的一致性,取决于我们了解样本中有多少个细胞。一旦过滤和清洗完成,可采用细胞计数设备(如血球计数器或自动细胞计数仪)进行定量。这些设备不但能提供准确的细胞计数,还能计算出向微流体芯片上样适量细胞所需的细胞悬液体积。烈冰对于一个细胞群体中的每个细胞单独进行建库测序分析。
基于测序的数据能够将彰显其强大之处,因为它能够了解同一单细胞的多种生物分析指标。如果说单细胞基因表达提供了一种颜色的详细信息,那么单细胞多组学提供了同一细节的全彩色图谱,为您带来样本的真实视图。烈冰自2019年引进的BD Rhapsody单细胞平台以来,能够从同一单细胞中读取细胞复杂性的多组学特征。与传统方法不同,单细胞多组学简化了您需要开展的实验,也节省了您需要分析的样本,而能获得相同的结果。这不但节省了宝贵的样本,还保证了更高的生物学准确性,因为您不需要匹配拆分样本的数据集并通过计算来推断各个组学之间的关系。BD平台基于cyto-seq技术,实现细胞和磁珠的一对一结合。四川BD单细胞平台
烈冰生物作为BD 中国联合成立单细胞测序实验室,为推动单细胞测序技术发展贡献中国力量。烈冰单细胞实验服务
为什么需要单细胞分辨率? 生物学就像宇宙一样。它非常复杂,有许多独特的单体,也就是细胞。这些细胞相互作用并扮演不同的角色,在更大的体系中构建并驱动多个过程。就像伽利略探索宇宙的努力一样,发现和定义这些细胞也需要高分辨率的工具,才能解开促成生物学复杂性的基因表达异质性。单细胞测序能够在以一个细胞为功能单位中开展生物学研究,阐明具体细节,构建出一幅更大、更精细的图谱,说明导致产生某种外在表型的不同类型的分子和细胞之间是如何相互作用的:患者为什么会复发?是什么让这种疫苗能够有效防止传染等等诸多问题。烈冰单细胞实验服务
上海烈冰生物医药科技有限公司致力于医药健康,是一家服务型的公司。公司自成立以来,以质量为发展,让匠心弥散在每个细节,公司旗下单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序深受客户的喜爱。公司注重以质量为中心,以服务为理念,秉持诚信为本的理念,打造医药健康良好品牌。烈冰生物秉承“客户为尊、服务为荣、创意为先、技术为实”的经营理念,全力打造公司的重点竞争力。