南通BD VDJ单细胞多组学测序

细胞计数和活力评估在评估样本质量时，需要在细胞清洗和过滤之后测定细胞活力，这一点至关重要。测定细胞活力有许多种方法，烈冰多年单细胞测序经验发现台盼蓝法在鉴定活细胞与死细胞的比例时效果很好。细胞计数的准确性以及目标回收量和实际回收量之间的一致性，取决于我们了解样本中有多少个细胞。一旦过滤和清洗完成，可采用细胞计数设备（如血球计数器或自动细胞计数仪）进行定量。这些设备不但能提供准确的细胞计数，还能计算出向微流体芯片上样适量细胞所需的细胞悬液体积。对于消化背景杂，样本初始数量少，关注粒细胞的项目，推荐您使用烈冰BD 单细胞测序平台。南通BD VDJ单细胞多组学测序

关于单细胞测序实验样本制备，这与流式细胞术用户熟悉的步骤完全一致，也就是通过酶促或机械消化、细胞分选或其他细胞分离技术从整个样本中制备生成活的单细胞悬液。随后是细胞计数和质量控制步骤，以确保您的样本有适当浓度的活细胞，并且不含细胞团块和死细胞碎片。如有必要，您还可以使用抗体对样本进行染色，标记细胞表面蛋白或其他生物分析物，或者通过FACS来富集感兴趣的细胞类型。解离样本时采取的具体步骤将根据您的起始材料和实验目标而定。也许需要额外的制备步骤，具体取决于组织质量、样本丰度、细胞大小，以及是否需要提取出细胞核进行染色质可接近性分析。无论具体的考虑因素如何，所有样本类型都遵循同一个基本原则，那就是生成高质量的单细胞悬液。南京BD Rhapsody单细胞多组学测序单细胞测序技术提供了单个细胞水平下的科学研究视角。

烈冰科技自主研发的单细胞云平台致力于帮助每一位客户定制化分析数据，深度解读数据分析结果，深入挖掘其背后的生物学意义；从操作便捷、结果可视化、分析可追溯、系统稳定等方面助力单细胞研究，加速科研进程！此外，烈冰生信团队根据丰富的实战经验为用户量身打造了一款单细胞测序结果解读的神兵利器——单细胞浏览器（Single Cell Browser），不但可以将海量复杂的结果文件可视化，还是可以实现三维立体化展示的软件。专业的生信代码交给专业的烈冰，专业的生物学意义交给专业的您！

单细胞测序庞大的数据烈冰生信团队倾情研发的NovelBrain®生信大数据分析平台，可实现零代码操作、简单方便：单细胞浏览器的操作简单，不需要命令行操作。简单拖拽、设置参数即可运行，即使生信0基础用户也可以运用自如；可视化展示海量结果文件：可视化展示Cluster的基因数，UMI数量、线粒体RNA占比信息；以及不同Cluster对应的细胞数量、基因表达量、RNA表达量、样本细胞分布、线粒体RNA表达量等；3D立体展示，文章动图先人一步：单细胞浏览器针对t-SNE图、UMAP图和pseudotime结果进行三维立体展示，更加直观立体的观察细胞分布和聚类情况。基于“静态蜂巢”技术，实现落孔细胞的物力分割和磁珠的一对一匹配。

由于高通量测序实验方法相关的测序成本，使得单细胞实验往往非常昂贵，烈冰生物BD Rhapsody单细胞测序服务珍视您的每一份样本，在平台搭建前，我们测试评估了BD Rhapsody的性能，与BD官方公布的数据结合来看，将人293T和小鼠NIH/3T3细胞的1:1混合物以不同浓度上样到BD Rhapsody卡式芯片上。存储的cDNA分子普遍扩增并进行低通量测序（每个细胞月8700个读数）。在测序数据中检测到1109个细胞的上样条件下，每个细胞中，来自每个细胞的平均99.4%的分子经检测为人或小鼠，这表明微孔之间的串扰非常小，在测序数据中检测到1000个或更少细胞的上样密度下，多重态发生率接近零，并且在15000个细胞下小于5%。单细胞测序技术的迅速发展和应用推广，为从多维度揭示疾病发展提供了强有力的工具。江苏BD VDJ单细胞实验服务

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什么时候要用到去死细胞的操作呢？跟进烈冰生物多年单细胞测序服务经验来看，当细胞悬液进行质量和活性检测后，考虑对细胞活性在50%-70%的悬液进行去除死细胞的操作。而太低活性的悬液（小于30%），悬液中细胞大量死亡，可能已经丢失了原组织内的细胞比例和状态，失真严重，建议重新收集样本进行新的实验，保证数据的高质量和实验结果的准确性。但需要注意到，去除死细胞的操作会损失一定的细胞数量，因此希望您在提供样本时，尽可能提供足量的细胞，以备实验过程中可能存在的细胞死亡的问题，BD Rhapsody单细胞捕获平台对样本起始细胞量的要求较低，一般提供10万个细胞以上均可满足需求，特殊样本可详细咨询烈冰生物。南通BD VDJ单细胞多组学测序

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