企业商机
单细胞基本参数
  • 品牌
  • NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoC
  • 服务项目
  • 科研医学服务,高通量测序,科研服务,临床检测服务
单细胞企业商机

烈冰生物BD Rhapsody单细胞分析系统,可平行分析成千上万个单细胞内数千个基因的表达水平,单细胞RNA-seq正在改变我们对细胞的理解。而烈冰作为多平台的技术服务提供商,基于BD 在生物学领域40年的专业技术,满足您的实验需求,在单细胞水平理解细胞形态和功能。BD单细胞测序分析系统克服了传统检测的局限性,如微阵列和大量细胞RNA-seq,这些技术检测通过实现对各个细胞之间的微妙差异的观察,依赖于对多个细胞的平行检测。用户可以鉴定和表征新型和罕见细胞类型,其进一步帮助理解从免疫学到疾病发展的多个领域内的生物学过程。十二年测序经验,烈冰生物单细胞多组学领域的佼佼者。西安BD单细胞测序服务公司

机体为响应各种应激,其细胞会从一种功能“状态”转变为另一种功能“状态”;当细胞在不同状态之间转变时,往往会经历转录重组,导致一些基因被沉默,一些基因被重新“唤醒”,但纯化这些瞬态细胞进行研究是很困难或不可能的;scRNA-seq拟时序分析可以让我们在不需要纯化的情况下查看这些细胞状态。拟时序分析,即根据不同细胞亚群基因表达量随时间的变化情况,构建细胞谱系发育,但这里的时间并不是真时间,而是一个虚拟的时间,是指的细胞与细胞之间的转化和演替的顺序和轨迹。即使在同一个样本中,也会存在多种不同的细胞形态。因此,不论测定了多少样本,我们都可以采用拟时序分析对样本中的细胞转化和变化进行描述。重庆BD VDJ单细胞测序搭建多种测序数据的生物信息分析平台,5000+项目检验,真实可信赖。

针对单细胞测序的细胞数量判断环节:主要是对细胞数量、基因表达量、测序质量进行整体描述。过滤标准:由于细胞破碎后游离RNA会释放到环境或孔中,并且测序中也会存在一些死细胞,导致数据存在background值。因此,我们需要设定一定的标准来过滤掉假细胞或死细胞。以10× Genomics为例,细胞数量判断主要通过分析UMI Counts-Barcode曲线斜率拐点,当存在多个斜率拐点的时候,结合预期UMI=500时的细胞数量进行过滤。当斜率拐点低于UMI=500的时候,选择UMI=500作为细胞的判断的标准;否则,选择和预期细胞数量接近的拐点作为细胞判断的位置。这样我们能够有效获得真实的并且在基因数量上可以分析的数据。

您的珍贵样本,可以放心依赖烈冰生物BD Rhapsody单细胞捕获系统,首先,该系统的技术原理是基于cyto-seq的微孔技术,因此不会因为样本细胞体积太大或悬液背景太杂等问题导致捕获通道的堵塞进而导致样本的损失;其次,BD RhapsodyTM单细胞捕获系统无电子元件,便于携带,当您的样本需及时实验时,我们可以“拎包上门”,快速的完成细胞捕获部分,不至于珍贵样本因细胞活性快速下降带来的损失;在这,BD Rhapsody单细胞捕获系统对细胞数量包容性较好,细胞悬液上样量高达575ul,针对样本中细胞数量较少的组织类型,也能完成整个项目的细胞捕获工作。此外,烈冰开展了单细胞转录组、单细胞多组学以及空间转录组等多种产品在内的全套科研解决方案,欢迎垂询。

对于稀有样本,或细胞量比较少的稀有组织,样本中每一粒细胞都很珍贵,BD Rhapsody单细胞捕获平台对该种类型的样本能实现友好包容,如果在实际实验中,我们发现因为样本类型和制备单细胞悬液方法的不同,容易出现单细胞悬液中死亡细胞的比例较高的情况。也会和您探讨是否考虑去除单细胞悬液中的死细胞和其他污染物的操作,以获得高质量数据是至关重要的。这是因为,死亡的细胞易裂解导致其中的RNA释放出来。这种cell-free RNA会导致检测的背景噪声,并会影响单细胞数据的质量。因此当样本活性较差时,对细胞悬液中细胞活性检测后,需要进行一般死细胞去除的工作(一般悬液活性小于70%时考虑此操作),以保证较高的上机捕获细胞的质量。烈冰一站式单细胞测序服务:立足科学研究,解码生命本质。苏州BD Rhapsody单细胞多组学测序

单细胞多组学测序可识别重要的转录因子,进行谱系和发育追踪。西安BD单细胞测序服务公司

多样本数据合并:Fraction of Reads Kept:合并样本时,各样本根据Mapped Barcoded Reads per Cell数量计算出来的数据利用率。如果各样本间该参数值相差很大,需要进行Downsample处理,以数据量少的样本为基准将不同样本中细胞测序深度标化到同一水平,从而避免因测序深度差异导致的基因检测数量、基因表达水平的差异。烈冰科技自主研发的单细胞云平台致力于帮助每一位客户定制化分析数据,深度解读数据分析结果,深入挖掘其背后的生物学意义;从操作便捷、结果可视化、分析可追溯、系统稳定等方面助力单细胞研究,加速科研进程!西安BD单细胞测序服务公司

上海烈冰生物医药科技有限公司是一家生物科技、医药科技、信息科技、计算机科技领域内的技术开发、技术服务、技术转让、技术咨询,市场营销策划,市场信息咨询与调查(不得从事社会调查、社会调研、民意调查、民意测验),从事货物及技术的进出口业务,计算机、软件及耗材(除专控),软件开发【依法须经批准的项目,经相关部门批准后方可开展经营活动】的公司,致力于发展为创新务实、诚实可信的企业。公司自创立以来,投身于单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序,是医药健康的主力军。烈冰生物继续坚定不移地走高质量发展道路,既要实现基本面稳定增长,又要聚焦关键领域,实现转型再突破。烈冰生物始终关注自身,在风云变化的时代,对自身的建设毫不懈怠,高度的专注与执着使烈冰生物在行业的从容而自信。

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