无锡single cell RNA单细胞多组学平台

基因测序是基因检测的方法之一，其又叫基因谱测序，是国际上公认的一种基因检测标准。高通量测序技术是对传统测序一次颠覆性的改变，一次对几十万到几百万条核酸序列进行测定，被称为下一代测序技术(nextgenerationsequencing)，足见其划时代的改变，同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能，所以又被称为深度测序(deepsequencing)。基因测序相关产品和技术已由实验室研究逐渐演变到临床应用，可以说，基因测序技术将是下一个改变世界的技术。首先 出现的单细胞多组学方法就是将转录组与其他组学技术结合。无锡single cell RNA单细胞多组学平台

FluidigmC1平台基于富鲁达（Fluidigm®）的微流控技术应用于单细胞测序（SingleCellRNASequencing）领域的商业化中，该技术大约在几个小时中可以捕获96个左右的细胞，进行各类的Single-Cell测序建库。当然，通量还是比较小。但不可否认的是，现在很多非RNA类SingleCell测序，仍然在采用这样的技术，如SingleCellDNA-Seq，SingleCellATAC-Seq等，都是采用此技术进行单细胞分选后再分别用不同试剂盒建库。所以可以说，至少在10XGenomics、BD或者其他企业推出有效的SingleDNA测序技术之前，C1仍然会是市场上的重要组成部分。合肥烈冰生物单细胞多组学平台单一的转录本研究不能体现生命进程的变化，因此多组学联合分析成为解析生命进程的有力工具。

细胞是构成生命的基础单元，迅速发展的单细胞测序技术为在单细胞层面研究细胞功能及其背后的基因调控机制提供了重要的技术手段，单细胞测序可用于检测多种不同的组学种类，包括转录组、染色质开放组、DNA甲基化组、组蛋白修饰组等等，对不同组学技术产生的数据进行整合分析有助于更地刻画细胞内的基因调控状态、揭示调控机制。然而，与传统的bulk数据相比，单细胞数据具有规模大、噪声高、异构性强等特点，如何通过开发新的计算方法实现对这些宝贵数据的有效利用已成为当今生物信息学领域关注的重点与热点。

烈冰生信团队倾情研发的NovelBrain®生信大数据分析平台，可实现零代码操作、简单方便：单细胞浏览器的操作简单，不需要命令行操作。简单拖拽、设置参数即可运行，即使生信0基础用户也可以运用自如；可视化展示海量结果文件：可视化展示Cluster的基因数，UMI数量、线粒体RNA占比信息；以及不同Cluster对应的细胞数量、基因表达量、RNA表达量、样本细胞分布、线粒体RNA表达量等；3D立体展示，文章动图先人一步：单细胞浏览器针对t-SNE图、UMAP图和pseudotime结果进行三维立体展示，更加直观立体的观察细胞分布和聚类情况。多组学技术结合了不同的生物数据集，如基因组学、转录组学和蛋白质组学。

二代测序技术在测序方法上取得了重大突破，基于“边合成边测序”（sequencingbysynthesis）和大规模平行测序技术（massiveparallelanalysis,MPS），使测序通量和读取速度得到极大提升，烈冰生物斥巨资购置的Novaseq6000测序仪的测序原理可以简化为四步：样品文库构建、簇生成、测序和数据分析。由于读长限制，样品DNA或由RNA逆转录得到的cDNA需要被打断成300-500bp的片段，并在3和5端接上3种序列：1）Index，用于区分样品来源；2）Adapter，用于结合测序通道上的位点；3）Primerbindingsite，用于结合PCR引物启动扩增反应。随着单细胞多组学的不断进步, 研究者将有机会在单细胞分辨率下进一步理解个体发育以及疾病发展机制。苏州烈冰科技单细胞多组学数据分析可视化

单细胞测序技术遍地开花，烈冰服务让您的生物医学研究如虎添翼。无锡single cell RNA单细胞多组学平台

当下，单细胞测序已经广泛应用于多种疾病发展过程中的关键过程和事件，如疾病从轻症病变向恶性的转化、恶性向转移病变的发展，以及疾病对多种药物的反应等等。单细胞测序技术作为一个需要将组织解离成为单细胞悬液，或者是采用细胞核捕获的策略捕获单细胞核，进而对于每一个单细胞或者细胞核进行测序得到结果的技术，其空间定位信息是丢失的。这就衍生出了一个问题就是如果单细胞A与B并不出现在一个组织区域中他们会互相影响或者转化么？免疫研究中，两个具有非常强的PDL1-PD1的配对关系的细胞在组织切片上风马牛不相及，这样PDL1-PD1的关系会生效么？无锡single cell RNA单细胞多组学平台

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