南京10X Chromium X单细胞测序技术支持

针对单细胞测序数据分析时的reads数、基因表达量及细胞数量判定过程中：以捕获5000个细胞、100G的测序量为标准，每个细胞的reads数大约在50k左右；每个细胞的基因中位数取决于样本的细胞类型，例如成熟的B，T，粒细胞数量较多的组织中，由于该类型细胞表达的基因数普遍较少，导致基因中位数下降。而某些疾病组织、或者体外培养的如干细胞等，他们的基因表达数较高，甚至可以超过1W，这就导致该类样本基因中位数非常高。因此，我们对细胞数量以及基因中位数确认时，需要考察实际组织的细胞组成。单细胞测序因其强大的探究疾病--细胞--基因的关系，一度成为高通量测序技术的“天花板”。南京10X Chromium X单细胞测序技术支持

烈冰生信团队倾情研发的NovelBrain®生信大数据分析平台，针对庞大的单细胞测序数据，能够实现细胞类型鉴定的快、精、准：一键导入genelist构建个性化基因列表；轻松一点即可展示Marker基因的Featureplot；任意修改Cluster的颜色和名称助力高效鉴定细胞类型；一键获得t-SNE图、Heatmap和Violin图：轻松获得并下载基因表达的t-SNE图、Heatmap、Violin图，还可以通过调节宽、高和系数比例来调节美观。平台上线300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板，帮助烈冰生信分析团队和自主分析用户实现分析工具和模板的快速调用和一站式全流程自动化分析，节省工作时间并提升整体工作效率宁波二代测序单细胞测序过去的十年，我们是知识的承载者；现在，我们在努力构建医学的大数据时代；未来我们将重新定义知识形态！

基于10XGeomics动态微流控技术，利用Tn5转座酶酶切开放染色质，形成短片段，单细胞ATAC测序在表观基因组学水平上，揭示单细胞染色质的可及性问题，区分细胞异质性，获得开放染色质的位置、转录因子的结合位点、核小体的调控区域和染色质状态等信息，是单细胞表观遗传学的重要突破：分析每个细胞数千个独特的染色质开放区域，识别细胞类型和细胞状态；识别重要的转录因子，进行谱系和发育追踪；探究驱动细胞类型和状态之间基因表达差异的非编码序列；探究细胞类型特异性和基因调控网络特征等。是当前重要的多组学研究基因表达和表观遗传学的手段。

基于10XNextGEM技术，单细胞测序一次实验可以同时检测近万个细胞，可在一个样本中同时获3端mRNA表达谱、如需和免疫组库（TCR和BCR）的数据进行联合时，即某些研究还需结合基因的表达谱和V(D)J数据进行复杂组织样本的是影响免疫应答分析，监测免疫疗法的效果，研究疾病发生、发展的分子机制，可进行单细胞免疫组库测序：烈冰单细胞免疫组库平台具备：1000+项目经验，一次实验可同时获取1000-20000个细胞的文库构建，获得转录组和免疫组数据；具备完善的免疫组库测序和实验质控流程，获取V(D)J全长序列的配对信息；丰富的免疫组库测序和数据分析经验，实现专属个性化数据分析服务，搭配单细胞分析云平台，一键导出交互性的动态结果报告。烈冰生物首批引进 Chromium X 平台，开启百万级通量单细胞测序新时代。

FluidigmC1平台作为应用于单细胞测序（SingleCellRNASequencing）领域的商业化分选技术，基于富鲁达（Fluidigm®）的微流控技术，大约在几个小时中可以捕获96个左右的细胞，进行各类的Single-Cell测序建库。当然，通量还是比较小。但不可否认的是，现在很多非RNA类SingleCell测序，仍然在采用这样的技术，如SingleCellDNA-Seq，SingleCellATAC-Seq等，都是采用此技术进行单细胞分选后再分别用不同试剂盒建库。所以可以说，至少在10X和BD，或者其他企业推出有效的SingleDNA测序技术之前，C1仍然会是市场上的重要组成部分。烈冰实验室包含从样本处理到测序下机的全套实验平台。苏州10X Chromium X单细胞测序

烈冰对于一个细胞群体中的每个细胞单独进行建库测序分析。南京10X Chromium X单细胞测序技术支持

10X Genomics单细胞转录组测序是利用单细胞水平上的高通量测序分析基因表达谱的技术，也是目前国内和国际上公认的单细胞测序大规模实验平台技术，该平台基于动态微流控原理，突破传统高通量测序的局限性，组织解离后，单个样本一次上机能捕获500-20000个细胞， 基于每个细胞分别建库测序，获得单个细胞的基因结构和基因表达状态，并鉴定细胞的类型，可以在不同样本间从细胞类型的组成和丰度角度进行比较，反映细胞间的异质性，提供足够灵活的定制测定法以满足多种实验需要，并有效缩短实验是时间和降低测序成本。南京10X Chromium X单细胞测序技术支持

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