企业商机
单细胞基本参数
  • 品牌
  • NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoC
  • 服务项目
  • 科研医学服务,高通量测序,科研服务,临床检测服务
单细胞企业商机

单细胞测序实验再样本细胞上机分选签,需要对细胞数量、细胞活性进准判断,这对SingleCell分选标记、建库、下机数据的质量都具有着决定性的作用。如若细胞计数偏高,将会影响建库的成功率;计数偏低,则会提高双细胞的比例;而细胞活率过低,就会使测序数据的利用率大打折扣,因此把好单细胞悬液质量这一关尤为重要。而在铺板过程中,由于不同操作人员手法具有不可避免的差异,不同的液体流速将直接影响单细胞的入孔效果。因此烈冰生物BDRhapsody单细胞分选平台配套了专门定制的电动移液器,其具有PrimeTreat、CellLoad、BeadLoad、Wash、Lysis、Retrieval多种操作模式,来对应各种不同的操作。通过已经设定的程序来控制液体的流速,大幅度降低人为操作习惯带来的差异,保证实验操作的一致性。烈冰生物全国五大实验中心,多地部署BD Rahpsody平台,助您的样本更快速抵达“战场”。上海烈冰生物单细胞测序服务

多样本数据合并:FractionofReadsKept:合并样本时,各样本根据MappedBarcodedReadsperCell数量计算出来的数据利用率。如果各样本间该参数值相差很大,需要进行Downsample处理,以数据量少的样本为基准将不同样本中细胞测序深度标化到同一水平,从而避免因测序深度差异导致的基因检测数量、基因表达水平的差异。烈冰科技自主研发的单细胞云平台致力于帮助每一位客户定制化分析数据,深度解读数据分析结果,深入挖掘其背后的生物学意义;从操作便捷、结果可视化、分析可追溯、系统稳定等方面助力单细胞研究,加速科研进程!无锡scRNA单细胞测序服务公司基于磁珠Barcode和UMI及polyT的探针结构,精细区分上万个细胞中mRNA的来源及表达丰度。

针对单细胞测序的细胞上样数,为什么不建议捕获到的细胞数量越高越好?一味地追求高数量的细胞捕获可能会存在一些问题。例如在上机细胞悬液浓度固定时,如果目标细胞捕获数增加到8000甚至10000,上样细胞悬液体积势必增加,在细胞悬液质量不是很理想(细胞活性5%、结团率均>5%)的情况下,引入的背景信号会增加,分析结果不理想的直接体现包括:cell、non-cell无法有效区分和Fractionreadsincells偏低。当cell和non-cell无法有效区分时,会使得数据出现假阳性和假阴性结果!当目标细胞捕获数很大时,多细胞率会增加,数据分析时,此部分“cell”表现为基因检测数和UMI检测数是正常cell的N倍(N是一个GEM包裹的细胞数),导致所有细胞的统计数据(单个细胞基因检测中位数、单个细胞UMI检测中位数)虚高。此部分“cell”虽然可以通过设置数据分析阈值进行过滤,但是容易会有此类数据的残留和正常高基因检测细胞的人为去除!

烈冰生物在上海、北京、广州、西安、江西等多地部署单细胞测序实验组中心,多地部署搭建BDRhapsody单细胞实验平台,基于微孔的强大的高通量单细胞分析系统,为您提供可靠的单细胞分析工作流程,该系统可通过简单的唯恐把工作流程和多重条码标记系统,对高通量单细胞进行多组学的信息捕获,由此捕获的信息科进一步生成各种类型的二代测序(NGS)文库。之后对文库进行测序和基于NovelBrain生物大数据分析平台(云平台)的数据可视化分析,实现高位分辨率下的组织内基因的表达差异和表达丰度。烈冰测序服务已助力300余篇国际期刊研究文章发表。

单细胞测序庞大的数据烈冰生信团队倾情研发的NovelBrain®生信大数据分析平台,可实现零代码操作、简单方便:单细胞浏览器的操作简单,不需要命令行操作。简单拖拽、设置参数即可运行,即使生信0基础用户也可以运用自如;可视化展示海量结果文件:可视化展示Cluster的基因数,UMI数量、线粒体RNA占比信息;以及不同Cluster对应的细胞数量、基因表达量、RNA表达量、样本细胞分布、线粒体RNA表达量等;3D立体展示,文章动图先人一步:单细胞浏览器针对t-SNE图、UMAP图和pseudotime结果进行三维立体展示,更加直观立体的观察细胞分布和聚类情况。截至2022年6月,烈冰助力发表单细胞测序文章30+篇。苏州单细胞测序服务公司

烈冰生物为您提供多平台一站式全流程BD单细胞测序服务。上海烈冰生物单细胞测序服务

您的珍贵样本,可以放心依赖烈冰生物BDRhapsody单细胞捕获系统,首先,该系统的技术原理是基于cyto-seq的微孔技术,因此不会因为样本细胞体积太大或悬液背景太杂等问题导致捕获通道的堵塞进而导致样本的损失;其次,BDRhapsodyTM单细胞捕获系统无电子元件,便于携带,当您的样本需及时实验时,我们可以“拎包上门”,快速的完成细胞捕获部分,不至于珍贵样本因细胞活性快速下降带来的损失;在这,BDRhapsody单细胞捕获系统对细胞数量包容性较好,细胞悬液上样量高达575ul,针对样本中细胞数量较少的组织类型,也能完成整个项目的细胞捕获工作。上海烈冰生物单细胞测序服务

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