企业商机
单细胞基本参数
  • 品牌
  • NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoC
  • 服务项目
  • 科研医学服务,高通量测序,科研服务,临床检测服务
单细胞企业商机

SingleCellSequencing技术,即利用优化后的高通量测序技术(NGS,NextGenerationSequencing)分析每一个单个细胞的序列信息,从而更高分辨率地揭示细胞间的细胞差异以及其在微环境中的功能情况。那么问题来了,如何获得单个细胞?如果无法获得单个细胞这一切都是不成立的;如何获得大批量的单个细胞?单个组织细胞群体通常在百万级别以上,如果被检测的测序细胞数量过小精确度不足;如何低成本地获得大批量单个细胞?单细胞测序成本非常高,尤其是需要测2000~3000个以上的细胞的时候,如果单个细胞的分选成本也很高,技术根本无法普及。所以,正因为这些问题的存在使得高通量测序在单个细胞测序应用中的普及度一直不足,直到几个单细胞测序突破性技术的诞生。烈冰生物为您提供一站式全流程高通量BD 单细胞测序服务。无锡scRNA单细胞测序服务公司

烈冰生物单细胞测序服务,为您提供可视化质控系统,保证每次实验的可靠性:BDRhapsody扫描仪具有直接成像功能,可在工作流程的不同阶段进行质量控制,如细胞捕获率和细胞多态率(双细胞率)。成像仪指标可以确认起始细胞样本的质量,并确认微孔板工作流程中每个步骤的成功完成状态;在细胞裂解前的步骤中评估细胞活性;并对通过测序确定的细胞回收量进行可靠估算。利用这些信息,在进行高成本的下游测序之前,用户可根据需要改变方向并解决实验中遇到的问题。这些指标允许用户对不同工作日间的或者不同研究中心间的工作流程性能进行跟踪。四川BD VDJ单细胞测序深度的单细胞测序数据解读助力医疗健康大时代。

单细胞测序结果动辄上百G数据量,庞大的数据对于分析平台和分析能力有着很高的要求,首先针对下机数据的质控环节:单细胞测序产生数亿的结果序列,不可避免的会出现低质量的测序结果,存在各种情况的序列污染。因此序列过滤及质量评估就会变得极为重要。序列质量主要通过测序质量值Q20/Q30的占比来表征,即碱基测序结果的错误率在1%/0.1%以下的比例。理想的测序结果reads的碱基质量均高于30。保证数据获得后的处理结果的准确性,为后续细胞类型鉴定和功能分析打下坚实基础。

作为单细胞测序的又一个重要里程碑,BDRhapsody单细胞捕获平台整合了仪器、试剂盒和基础信息学软件,能精确对接illumina测序仪,因此可实现大量大细胞的快速高效标记、测序和分析,获得单细胞水平的基因表达谱和差异情况,并通过对复杂细胞群体进行深入细致分析,绘制大规模单细胞表达图谱。以量化细胞内的群体异质性,并逐个鉴定细胞类型、细胞状态和动态细胞跃迁。除了有望鉴定新的细胞亚型和稀有细胞群体,单细胞技术还能更好地了解转录动态和基因调控关系。烈冰BD Rahpsody单细胞测序平台,助力您的深入科学探究。

单细胞测序庞大的数据烈冰生信团队倾情研发的NovelBrain®生信大数据分析平台,可实现零代码操作、简单方便:单细胞浏览器的操作简单,不需要命令行操作。简单拖拽、设置参数即可运行,即使生信0基础用户也可以运用自如;可视化展示海量结果文件:可视化展示Cluster的基因数,UMI数量、线粒体RNA占比信息;以及不同Cluster对应的细胞数量、基因表达量、RNA表达量、样本细胞分布、线粒体RNA表达量等;3D立体展示,文章动图先人一步:单细胞浏览器针对t-SNE图、UMAP图和pseudotime结果进行三维立体展示,更加直观立体的观察细胞分布和聚类情况。烈冰斥巨资引进Novaseq6000,开启更大通量测序新纪元。西安BD单细胞转录组测序

单细胞测序技术提供了单个细胞水平下的科学研究视角。无锡scRNA单细胞测序服务公司

针对单细胞测序的细胞数量判断环节:主要是对细胞数量、基因表达量、测序质量进行整体描述。过滤标准:由于细胞破碎后游离RNA会释放到环境或孔中,并且测序中也会存在一些死细胞,导致数据存在background值。因此,我们需要设定一定的标准来过滤掉假细胞或死细胞。以10×Genomics为例,细胞数量判断主要通过分析UMICounts-Barcode曲线斜率拐点,当存在多个斜率拐点的时候,结合预期UMI=500时的细胞数量进行过滤。当斜率拐点低于UMI=500的时候,选择UMI=500作为细胞的判断的标准;否则,选择和预期细胞数量接近的拐点作为细胞判断的位置。这样我们能够有效获得真实的并且在基因数量上可以分析的数据。无锡scRNA单细胞测序服务公司

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