企业商机
单细胞多组学基本参数
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  • 科研(临床)检测服务
单细胞多组学企业商机

单细胞多组学测序技术是在单细胞分辨率下精确分析细胞异质性和基因调控网络的新技术,提供了全新的视角来分析细胞的分化路径、细胞间的交互调控和细胞亚群的分离现象。转录组、表观基因组、蛋白组学和代谢组学的差异赋予了组织内同样基因组背景下的单个细胞的功能特异性。单个细胞的组学变化决定了组织的功能状态,因此,阐明组织的细胞异质性是破译生理功能和病理演变的关键。然而,以bulkRNA测序等为**的传统方法掩盖了细胞的异质性,细胞组学变化的平均水平。近10年来,单细胞组学技术应运而生,实现了在单细胞分辨率下研究分子的变化规律。单细胞测序手段有力地解决了组织内高度异质性对于低丰度信号影响的问题。重庆高通量测序单细胞多组学测序服务公司

单细胞转录组测序是在单细胞水平上高通量测序分析基因表达谱的技术,突破传统高通量测序的局限性,组织解离后,单个样本一次上机能捕获500-20000个细胞,基于每个细胞分别建库测序,获得单个细胞的基因结构和基因表达状态,并鉴定细胞的类型,可以在不同样本间从细胞类型的组成和丰度角度进行比较,反映细胞间的异质性。而2021年横空出世的10XGenomicsChromiumX平台实现了单块chip上的百万级别通量的细胞捕获,系统实现16个通道同时运行,每个通道可捕获2000-20000个细胞(不混样),并支持原ChromiumController体统外的多种细胞捕获百万级别通量实验,可准确鉴别稀有细胞类型和适配大规模单细胞研究。青岛scRNA单细胞多组学技术支持单细胞多组学测序技术已应用于心肌再生领域。

二代测序技术在测序方法上取得了重大突破,基于“边合成边测序”(sequencingbysynthesis)和大规模平行测序技术(massiveparallelanalysis,MPS),使测序通量和读取速度得到极大提升,烈冰生物斥巨资购置的Novaseq6000测序仪的测序原理可以简化为四步:样品文库构建、簇生成、测序和数据分析。由于读长限制,样品DNA或由RNA逆转录得到的cDNA需要被打断成300-500bp的片段,并在3和5端接上3种序列:1)Index,用于区分样品来源;2)Adapter,用于结合测序通道上的位点;3)Primerbindingsite,用于结合PCR引物启动扩增反应。

单细胞测序实验再样本细胞上机分选签,需要对细胞数量、细胞活性进行准确判断,这对SingleCell分选标记、建库、下机数据的质量都具有着决定性的作用。如若细胞计数偏高,将会影响建库的成功率;计数偏低,则会显著提高双细胞的比例;而细胞活率过低,就会使测序数据的利用率大打折扣,因此把好单细胞悬液质量这一关尤为重要。而在铺板过程中,由于不同操作人员手法具有不可避免的差异,不同的液体流速将直接影响单细胞的入孔效果。因此烈冰生物BDRhapsody单细胞分选平台配套了专门定制的电动移液器,其具有PrimeTreat、CellLoad、BeadLoad、Wash、Lysis、Retrieval多种操作模式,来对应各种不同的操作。通过已经设定的程序来控制液体的流速,大幅度降低人为操作习惯带来的差异,保证实验操作的一致性。功能研究型单细胞多组学测序技术结合了CRISPR基因编辑技术, 深度挖掘基因表达调控与细胞功能。

转录组学和蛋白质组学都是获得基因表达情况的重要工具,从生物学角度上看,转录组表示了基因表达的中间状态,可以反映诸如转录调控、转录后调控的机理;而蛋白质是生物体直接的功能执行者,因而对其表达水平的研究有着不可替代的优势。要探究生物体疾病机理、胁迫机制,精确研究重要基因的表达模式和调控机理,只有联合转录组学和蛋白组学表达量数据对生物样本进行系统研究,才能真正观察到mRNA-蛋白质关联性,进而从整体上解释生物学问题。单细胞多组学技术基于单细胞测序技术和高通量组学方法发展而来,能在单细胞分辨率下同时整合多种组学信息。烈冰生物单细胞多组学平台

分子检测型单细胞多组学测序技术大多数以转录 组测序为重点。重庆高通量测序单细胞多组学测序服务公司

分子检测型单细胞多组学测序技术中也有一些集中于探究单细胞内表观遗传组各层面的变化及关联。功能研究型单细胞多组学测序技术,结合了强大的CRISPR基因编辑技术,从而可以深度挖掘基因表达调控与细胞功能以及命运决定之间的因果关系。在未来,为了更系统地研究多层组学之间的互动关系对细胞命运的影响,一方面,单细胞多组学测序技术的策略会继续向转录组结合其他多个组学的三组学甚至四组学方向发展.另一方面,单细胞多组学测序技术会转向研发多组学测序分析和功能验证同时进行的方法,这种探究因果关系的策略对于揭示发育和疾病发展中的关键因子和分子网络模块十分重要。重庆高通量测序单细胞多组学测序服务公司

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