苏州医疗系统认证数字PCR原理

常规PCR和实时荧光PCR定量检测都需要已知拷贝数的标准DNA制定标准曲线，由于样品测定在各种条件上不会完全一致，会造成PCR扩增效率的差异，从而影响定量结果的准确性。而ddPCR不受标准曲线和扩增动力学影响，可以进行定量。如何在双通道设置及双探针标记的情况下实现多重检测?不同位点的双探针检测体系中引物和探针采用不同的终浓度，这样阳性微滴的终点FAM/HEX荧光信号强度就会不同，利用阳性微滴不同的“分簇(cluster)”来区分不同的突变位点。采用对应的KRAS野生型和突变型细胞系对双重ddPCR检测体系的性能进行验证。结果显示除了Q61H位点外，其他位点的检测体系在54C的情况下均能很好的区分4个明显的cluster。通过创新技术微流控芯片，让数字PCR单反应耗材价格进入个位数，实现了新的进步，也降低开发难度。苏州医疗系统认证数字PCR原理

20世纪末，Vogelstein等提出数字PCR(digitalPCR，dPCR)的概念，通过将一个样本分成几十到几万份，分配到不同的反应单元，每个单元至少包含一个拷贝的目标分子(DNA模板)，在每个反应单元中分别对目标分子进行PCR扩增，扩增结束后对各个反应单元的荧光信号进行统计学分析。PCR实际上是一个在模板DNA、引物(模板片段两端的已知序列)和四种脱氧核苷酸等存在的情况下，DNA聚合酶依赖的酶促合成反应，扩增的特异性取决于引物与模板DNA的特异结合。广东一体化数字PCR样品回收20世纪末，Bert Vogelstein等提出数字PCR的概念。

数字PCR技术是继一代普通PCR、二代荧光定量PCR之后的第三代PCR技术。该技术将一个样本分成几到几十万份，分配到不同的反应单元，每个单元包含一个或多个拷贝的目标分子(DNA模板)，在每个反应单元中分别对目标分子进行PCR扩增；扩增结束后，将有荧光信号的微滴判读为1，没有荧光信号的微滴判读为0，终根据泊松分布原理以及阳性微滴的比例，计算出待检靶分子的浓度或拷贝数。定量：不再依赖于Ct值和标准曲线，直接给出靶序列的起始浓度，实现真正意义上的定量。更高灵敏度与特异性：数字PCR可实现万分之一稀有样本的定量，可用于极微量核酸样本检测、复杂背景下的稀有突变检测、表达量微小差异鉴定、单细胞基因表达等方面。数字PCR在分子诊断领域将会发挥巨大的作用，数字PCR适用于生物标志物研究、拷贝数变异分析、微生物检测、转基因生物检测、mRNA和miRNA检测、基因相对表达研究等，并对遗传病、、产前诊断的研究提供了一种全新的技术思路与手段，具有广的、不可替代的应用前景。

数字PCR实验步骤包括：1）试剂配制：将10xdPCRBuffer、dPCR酶、引物和探针、无核酸酶水混合成dPCR预混液，并分装到8联排管中或96孔板中；将各待测样本的核酸模板、阳性对照、阴性对照分别加入相应的8联排管中或96孔板中；2）芯片进样：在小海龟BioDigital·青全自动样品处理系统上进行芯片上反应液进样和液滴生成；3）芯片扩增：在小海龟BioDigital·青PCR扩增仪上进行芯片上PCR扩增反应；4）芯片阅读：在小海龟BioDigital·青生物芯片阅读仪上进行芯片上荧光信号阅读；5）数据分析：使用生物芯片数据分析·青软件进行数据分析和报告导出；三重ddPCR检测体系存在的问题：不同位点检测体系之间的cross-reactivity。

dPCR的测量结果通常表示为含量，即拷贝数值或转基因质量百分比，而QPCR结果通常表示为拷贝数的质量分数。目前市场上可购买到大多数转基因标准物质，以qPCR定值的标准物质是以拷贝数（单倍体基因组当量）的质量分数来表示特性量；以dPCR定值的标准物质直接采用拷贝数比例来表示特性量。不同方法使用不同的表示方式，会造成测量结果不可比。因此质量分数、拷贝数和拷贝数比例之间的关系需要转化，才能得到单位一致，数值可比的数据。EU联合研究中心建议使用转换因子从拷贝数换算到质量分数。相同模板进行 96 次扩增，终点处产物量不恒定，但 Ct 值却极具重现性。苏州锐讯数字PCR油滴制造

通过不同cluster的位置进行突变位点的判断时存在误判的现象。苏州医疗系统认证数字PCR原理

在荧光定量PCR应用已经如此的情况下，缘何数字PCR仍然能横空出世？中心点在于荧光定量PCR尽管为科研和临床市场应用提供了非常重要的检测工具支撑，但仍然有尚未被满足的客户需求。荧光定量PCR需要基于标准品制作的标准曲线进行定量，属于相对定量，操作较为复杂，且终端用户对其结果的重复性、灵敏性、精密度、分辨率、对PCR反应抑制剂的耐受性等方面有更高的期待。数字PCR通过将反应体系进行有限稀释至成千上万的反应单元中，实现了核酸靶标的单分子扩增。PCR扩增结束后，基于终点法对阳性液滴数和总液滴数进行计数，结合泊松分布原理，从而实现对起始样本的定量。其极大地简化了操作步骤，并且大幅提高了检测性能，尤其在低丰度或较低丰度的核酸检测上（灵敏性可达0.001-0.0001%），其优异的性能得到了终端用户的认可。苏州医疗系统认证数字PCR原理

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