CoIP实验细胞的收集及裂解方法：
收集2E7个细胞样品，加入PBS洗涤细胞，离心后弃上清收集细胞沉淀。
准备500μl预冷的CellLysisBuffer,分别加入5μlProteaseInhibitor、5μlPMSF，混匀后加进细胞沉淀中吹打均匀，冰上孵育30min，期间涡旋混匀几次。
4℃,12000rpm离心10min，取上清，进行蛋白浓度测定及后续实验。
CoIP实验免疫复合物的制备：
在离心管中，将每个样品的细胞裂解液与2-10μg免疫沉淀抗体结合。每个免疫沉淀反应推荐的总蛋白量为500-1000μg，由PierceBCAProteinAssay蛋白浓度检测试剂盒测定。
用免疫沉淀裂解/漂洗缓冲液将抗体/裂解液稀释至500μL。
在室温下孵育1-2h，或4℃过夜，以形成免疫复合物。 Co-IP实验要点：温和裂解、验证抗体、充分结合、沉降分离、洗脱纯化，确保结果准确可靠！北京互作蛋白检测CoIP mass
Co-IP技术虽然广泛应用于蛋白质相互作用的研究，但也存在一些局限性。首先，Co-IP技术的结果可能受到抗体特异性的影响。如果抗体与目标蛋白的结合不够特异，可能导致非特异性蛋白的共沉淀，增加背景噪声。其次，Co-IP技术可能无法检测到低丰度的蛋白质相互作用，因为低丰度蛋白在细胞裂解液中的浓度较低，难以形成稳定的复合物。此外，Co-IP技术还受到样品制备和实验条件的影响。样品中的杂质、降解产物或酶活性等因素都可能干扰实验结果。另外，Co-IP技术只能检测到在细胞裂解时存在的蛋白质相互作用，对于瞬时或动态的相互作用可能无法准确捕捉。因此，在使用Co-IP技术时，需要注意这些局限性，并结合其他实验方法和验证手段，以获得更准确的蛋白质相互作用结果。北京互作蛋白检测CoIP massCoIP实验技术重复和生物重复设计建议。
IP-Mass（免疫沉淀-质谱）实验流程主要包括以下步骤：样品制备：收集细胞或组织样品，并进行适当的裂解处理，以释放细胞内的蛋白质。免疫沉淀：将特异性抗体与目标蛋白结合，形成抗原-抗体复合物。随后，将复合物与固相载体（如磁珠）结合，通过洗涤步骤去除非特异性结合的杂质。洗脱：从固相载体上洗脱免疫沉淀得到的蛋白质复合物，以便进行后续的质谱分析。蛋白酶消化：将洗脱下来的蛋白质复合物进行蛋白酶消化，将其分解成小分子的肽段。质谱分析：将消化后的肽段进行质谱分析，通过测量肽段的质量和电荷信息，鉴定出蛋白质的种类和序列。数据分析：对质谱数据进行处理和分析，确定与目标蛋白相互作用的蛋白质，以及相互作用的可能性和强度。IP-Mass实验流程结合了免疫沉淀的高特异性与质谱分析的高灵敏度，能够准确地鉴定蛋白质相互作用，并为后续的功能研究和药物开发提供有力支持。
免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation,Co-IP）实验在生物学和医学研究中具有广泛的应用范围。以下是其主要的应用领域：1.蛋白质相互作用研究（检测蛋白质相互作用/确定蛋白质复合物的成员）；2.细胞信号传导研究；3.蛋白质功能和结构研究；4.疾病机制研究；5.其他应用：蛋白纯化，蛋白质翻译后修饰研究。综上所述，免疫共沉淀实验在蛋白质相互作用研究、细胞信号传导研究、蛋白质功能和结构研究以及疾病机制研究等多个领域都具有广泛的应用价值。快速了解Co-IP技术，需明原理、知流程、重细节、查文献、勤实践，方能掌握精髓！
免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation）是以抗体和抗原之间的专一性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的经典方法，是确定两种蛋白质在完整细胞内生理性相互作用的有效方法。其原理是：当细胞在非变性条件下被裂解时，完整细胞内存在的许多蛋白质－蛋白质间的相互作用被保留了下来。如果用蛋白质X的抗体免疫沉淀X，那么与X在体内结合的蛋白质Y也能沉淀下来。目前多用精制的prorein A预先结合固化在argarose的beads上，使之与含有抗原的溶液及抗体反应后，beads上的prorein A就能吸附抗原达到富集的目的。这种方法常用于测定两种目标蛋白质是否在体内结合；也可用于确定一种特定蛋白质的新的作用搭档。Co-IP和ChIP基本原理方面的区别有什么。北京互作蛋白检测CoIP mass
Co-IP技术助力蛋白互作与泛素化研究，揭示生命过程奥秘！北京互作蛋白检测CoIP mass
CoIP-Mass和CoIP-WB优劣势：优势：高通量获得目的蛋白的专属蛋白互作库。劣势：CoIP的蛋白库鱼龙混杂，包含目的蛋白的直接/间接互作蛋白，非特异结合，残留蛋白。常规理想IP-Mass项目可鉴定到1000-2000个蛋白，其中绝大部分是非特异性结合及清洗残留的背景蛋白，导致CoIP-Mass假阳性高，CoIP-WB验证成功率低，导致研发进展反复跌宕，时间和经费成本占用较大，严重影响士气。其次，项目受限于蛋白表达量和IP抗体有效性，达到理想状态的CoIP-Mass较难，同时分析门槛较高。因此，该项目成功实施，比较依赖成熟和有分析经验的团队。建议整包交给专业的服务商开展检测。北京互作蛋白检测CoIP mass
