综上所述,本研究应用RNA-seq转录组分析结合iTRAQ蛋白质组学技术,探讨油茶种子不同成熟期储量积累的动态变化。此外,作者还探讨了黄酮类化合物和脂肪酸的生物合成和代谢可能的调控机制。许多功能转录本(16530)和蛋白质物种(1228)的模式发生了***变化,其中317个DAPs被转录组结果覆盖。结合结构基因(蛋白)或转录因子的表达谱及相应化合物的含量,对重要代谢产物的调控网络进行了探讨。结果表明,黄酮类化合物的合成能力在种子成熟过程中逐渐减弱,而脂肪酸的合成能力则先升高后下降。修饰蛋白质组试-蛋白质组学 解决方案。广东蛋白组学概念
4D蛋白质组学分析发现,不同的病因和疾病的严重程度中蛋白表达存在差异。严重的疾病同急性期的蛋白的增加,补体系统蛋白及功能相关的蛋白相关;通过COVID-19和健康组对比,发现了49%的差异分析物;和脓毒症相比,G-CSF,IL-8等在严重的COVID-19患者中含量更低;蛋白和临床相关性分析则发现临床特征和某些蛋白呈强相关性。本研究通过4D蛋白组学技术结合其他组学技术及免疫技术,确定了COVID-19免疫特征和宿主反应等相关因素,并为进一步COVID-19的***打下了良好的基础。广东蛋白组学概念蛋白质组学测序 蛋白组学技术缺点。
iTRAQ标记蛋白组学研究方法:2021年12月欧易/鹿明生物合作客户甘肃农业大学孙万仓教授课题组在Scientific Reports期刊发表的题为 “iTRAQ-Based Quantitative Proteome Analysis Insights into Cold Stress of Winter Turnip Rapa (Brassica rapa L.) Grown in the Field ”的研究成果,通过iTRAQ标记蛋白组学+转录组学研究方法,探究了茎尖分生组织的形态对冬油菜低温耐受性中的作用。中文标题:iTRAQ标记蛋白质组学分析揭示了低温胁迫对田间生长冬油菜的影响研究对象:白菜型冬油菜发表期刊:ScientificReports影响因子:4.17
本文为了探究其潜在的分子机制,作者运用RNA测序(RNA-seq)和iTRAQ标记定量蛋白组学,对不同成熟度水平的油脂种子进行了研究。不仅揭示了关键候选基因和蛋白质的时间特异性表达,而且为该树种的遗传改良提供了科学依据。中文标题:基于iTRAQ蛋白质组学和转录组学联合分析揭示油茶种子成熟过程中油质相关的关键代谢产物的积累研究对象:油茶种子发表期刊:HorticultureResearch影响因子:6.793发表时间:2021.07.01发表单位:海南大学园艺园林学院运用生物技术:RNA测序(RNA-seq)和iTRAQ标记定量蛋白组学、转录组学、蛋白组学文章中iTRAQ标记定量蛋白组学由欧易/鹿明生物提供技术支持蛋白质组与代谢组联合分析。
iTRAQ蛋白质组学研究实用案例:2021年8月,浙江大学药学院何俏军、罗沛华团队在Autophagy期刊发表了题为“Autophagic degradation of CCN2 (cellular communication network factor 2) causes cardiotoxicity of sunitinib”的研究成果,通过动物模型、功能实验、iTRAQ蛋白质组学等研究方法,发现了舒尼替尼诱导的自噬导致心肌细胞凋亡和心脏功能障碍,探究了舒尼替尼诱导的适应不良自噬通过TOLLIP介导的内体相关通路选择性降解心肌细胞存活介质CCN2的机理,揭示了调节心肌细胞死亡的自噬降解新靶标蛋白。为提高基于舒尼替尼的*****安全性提供了方法及理论依据。中文标题:CCN2的自噬降解导致舒尼替尼的心脏毒性研究对象:小鼠发表期刊:Autophagy影响因子:16.016发表时间:2021年8月合作单位:浙江大学药学院运用生物技术:iTRAQ蛋白质组学(由鹿明生物提供技术支持)定量蛋白质组学 蛋白质进行质谱检测未知蛋白进行全检测。上海蛋白组学和基因组学的差异
蛋白质组学质谱分析蛋白质组学三大基本技术。广东蛋白组学概念
采用TMT标记定量蛋白质组学技术对三个脱水特殊阶段(21、27和40DAP)的新鲜莲种胎进行了蛋白质组学分析,共鉴定了5,477个蛋白质。对测试样本进行了PCA分析,结果显示,不同组间样品具有很好的区分,每组的三个重复样本被聚集在一起。PCA的前两个成分占总方差的70%以上(图2A)。三个试验组之间共有815个差异表达蛋白。其中,198个(32%)和198个(26%)蛋白质丰度增加,而420个(68%)和558个(74%)蛋白质丰度在27DAP和40DAP组分别下降(图2B)。只有30个蛋白质的丰度在27DAP和40DAP组之间具有***变化(图2C)。广东蛋白组学概念
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