空间代谢组学研究作者对P493-6B细胞淋巴瘤系(BCL)进行了全基因组表达谱、核突变和ChIP分析,发现MYC诱导增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相关蛋白在内的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表达,在MYC诱导的肝细胞*(HCC)、急性白血病(T-ALL)和肾细胞*(RCC)的三种体内转基因小鼠模型中也有类似表达。还发现MYC与这些FA合成基因的启动子结合并启动mRNA转录,如甲羟戊酸和胆固醇途径基因的启动子。为了了解MYC和SREBP1之间的相互作用,作者首先,对这两种蛋白进行ChIP和re-ChIP分析,证明MYC和SREBP1都可以发现与FA合成基因启动子中的相同...
如空间代谢组。研究中开发了一种新的基于拉曼光谱和空间代谢组学分析的脂质组学(HSL)成像策略,用于分子表征和定量再髓鞘形成,并通过特定髓鞘蛋白的免疫标记进行了验证。利用拉曼和空间代谢组学数据生成了分子成像图谱,用于体外组织的生物分子结构和组成的关联。将相关脂质组成像方法应用于局灶性脱髓鞘小鼠模型和多发性硬化症死后脑标本的髓鞘再分化研究。发现不仅在脱髓鞘脑组织和正常脑组织之间,在有髓鞘组织和正常有髓组织之间,脂质成分皆存在差异。蛋白质组学的研究方法。黑龙江药物空间代谢组学AFADESI-MSI空间代谢组学:生物组织**能代谢物的空间分布可以更深层次的理解组织特异性分子组织学和病理学。问题的**在...
空间代谢组学(AFADESI-MSI):中文标题:使用敞开式质谱成像技术及代谢组学绘制大鼠脑代谢网络图研究对象:大鼠脑发表期刊:AnalyticalChemistry影响因子:6.986发表时间:2021年4月23日研究单位:中国医学科学院药物研究所天然药物活性物质与功能国家重点实验室运用生物技术:空间代谢组学(AFADESI-MSI)。大脑是结构**复杂的***之一,主要功能与其微区的分子相互作用密切相关。大脑的小分子调节机制对理解***功能、精神疾病机理和药物研发有很大的帮助。动物的认知过程和行为控制均依赖于脑部强大的***网络——神经连接体。科学家进行了很多研究,但是对脑部小分子网络的研...
通过空间代谢组学测量了四种转基因小鼠模型(肺*(LC)、RCC、HCC和T-ALL)中甘油磷脂(GPs)的含量,发现在不同的**中,MYC诱导改变了磷酸酰甘油(PGs)的丰度(图 4A),能够增加了大多数PG物质。MYC失活后,PG丰度恢复到基础水平(图 4B)。PGs由磷脂酸(PA)通过向3-磷酸甘油中添加两种FA形成,因此,PG诱导可以建立在MYC促进的FA增加的基础上。然而,在体内PGs相对于其他GPs的相对优先合成,这意味着MYC有除FA合成之外的其他方式调节脂肪生成。空间代谢组通过质谱成像技术。甘肃空间代谢组学与空间转录组空间代谢组学(AFADESI-MSI):中文标题:使用敞开式质...
研究表明,MYC对磷脂酰肌醇(PI)代谢具有组织特异性。作者通过空间代谢组学检测到RCC和T-ALL中,MYC可逆地降低了PI;但在LC和HCC中,MYC反而增加了这些物质(图 7)。可能是由于肺表面富含PG和PI,MYC才会增加了LC中的PI含量。作者推断,MYC通常能够增加PGs含量,但以组织特异性方式差异调节其他GPs,如PIs。***作者对脂肪生成在MYC诱导的**发生中的作用进行了探究,通过空间代谢组学、IHC和Western Blot等方法证明通过体外抑制FA合成可以抑制MYC诱导的脂肪生成,从而抑制了RCC、HCC和BCL的增殖(图 8)。质谱成像技术可以实现生物上千代谢物的定性...
空间代谢组学:质谱成像方法提供了一种直接获取代谢网络信息的途径,以系统地深入了解大脑的代谢活动。基于KEGG数据库的Metaboanalyst软件进行代谢网络分析。共找到20条KEGG代谢通路,包含126个具有微区信息的代谢物,图2显示了涉及丙氨酸-天冬氨酸和谷氨酸代谢、花生四烯酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、肌酸途径、GABA能突触、葡萄糖代谢、谷胱甘肽代谢、甘油磷脂代谢、甘氨酸-丝氨酸和苏氨酸的代谢、组氨酸代谢、赖氨酸代谢、苯丙氨酸代谢、多胺代谢途径、嘌呤代谢、嘧啶代谢和TCA循环、色氨酸代谢、酪氨酸代谢、缬氨酸-亮氨酸和异亮氨酸代谢和类固醇***合成途径。代谢组学分析、空间转录组测序价格、代...
空间代谢组学:中文标题:MYC*基因与固醇调节元件结合蛋白协同调节**生长所必需的脂肪生成研究对象:小鼠发表期刊:CellMetabolism影响因子:27.287合作单位:斯坦福大学运用生物技术:空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等MYC是一种原*基因,在细胞增殖、凋亡、分化等多种细胞生物学过程中发挥作用,其易位、扩增或表达异常常与多种**的发***展有关。本篇由斯坦福大学DeanW.Felsher课题组在CellMetabolism发表的研究成果,通过空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等技术研究*基因MYC促进**发生机制,发现MYC与胆固醇调节元件...
空间代谢组学助力医科院药物所蒋建东团队探究靶向纳米技术促进小檗碱肝脏吸收机制。中国医学科学院药物研究所蒋建东团队课题组在NatureCommunications发表了题为“Liver-targetnanotechnologyfacilitatesberberinetoamelioratecardio-metabolicdiseases"的研究成果,通过AFADESI-MSI空间代谢组学、WesternBlotting、RT-PCR、Flowcytometry和ELISA等技术研究BBR-CTA-Mic对高脂饮食小鼠的代谢紊乱和******效果,发现BBR-CTA-Mic不仅可有效促进肝脏沉积和...
分子成像技术是研究大脑中DNA、RNA、蛋白质和代谢产物的强大工具。质谱成像技术(MSI)是一种检测大脑中蛋白质、代谢物和脂质物质的高灵敏度和高通量分子成像技术,在**边缘诊断、**生物标志物发现、药物分布和机理阐述等领域有***的应用。本文作者开发了一种基于敞开式空气动力辅助解吸电喷雾离子化质谱成像(AFADESI-MSI)技术的代谢网络映射方法,对大鼠脑不同极性的小分子代谢物(m/z50-500Da)进行微区分布研究,不仅鉴定出脑部几乎所有重要的代谢物,还绘制了包含神经递质、嘌呤,有机酸,多胺,胆碱、碳水化合物和脂类等20条通路的代谢网络,并使用这种代谢网络映射质谱成像方法解析了东莨菪碱致...
鹿明生物引入Thermo ScientificTM Q Exactive HFTM将会在2022年对空间代谢组学研究带来更高效的产能及更多的探索。截止2022年1月10日,鹿明生物已拥有2台空间代谢组学**研究设备(见下方图片)。相信鹿明生物的2022将帮助各位科研学者提供更加快速、质量的研究。请期待鹿明生物2022给您带来的"极速"体验~基于AFADESI-MSI平台代谢物广覆盖度的优点,在临床样本以及动物样本中同时检测到胆碱类、多胺类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类、有机酸类、碳水化合物类、胆固醇类、胆酸类、脂质类等多种类代谢物,真正意义上满足了“空间代谢组学”的研究需求。欧易生物空间...
空间代谢组学探究MYC、SREBP1与**发生的能量机制探索。斯坦福大学Dean W. Felsher课题组在Cell Metabolism发表的题为“The MYC Oncogene Cooperates with SterolRegulated Element-Binding Protein to Regulate Lipogenesis Essential for Neoplastic Growth”的研究成果,通过空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等技术研究*基因MYC促进**发生机制,发现MYC与胆固醇调节元件结合蛋白(SREBP1)协同调节脂质生成,从而促进疾病...
鹿明生物引入Thermo ScientificTM Q Exactive HFTM将会在2022年对空间代谢组学研究带来更高效的产能及更多的探索。截止2022年1月10日,鹿明生物已拥有2台空间代谢组学**研究设备(见下方图片)。相信鹿明生物的2022将帮助各位科研学者提供更加快速、质量的研究。请期待鹿明生物2022给您带来的"极速"体验~基于AFADESI-MSI平台代谢物广覆盖度的优点,在临床样本以及动物样本中同时检测到胆碱类、多胺类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类、有机酸类、碳水化合物类、胆固醇类、胆酸类、脂质类等多种类代谢物,真正意义上满足了“空间代谢组学”的研究需求。空间代谢组具...
空间代谢组学:中文标题:MYC*基因与固醇调节元件结合蛋白协同调节**生长所必需的脂肪生成研究对象:小鼠发表期刊:CellMetabolism影响因子:27.287合作单位:斯坦福大学运用生物技术:空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等MYC是一种原*基因,在细胞增殖、凋亡、分化等多种细胞生物学过程中发挥作用,其易位、扩增或表达异常常与多种**的发***展有关。近年来关于MYC在脂质代谢中的研究很多,据了解MYC与脂肪酸合成相关酶密切相关;致*基因MYC刺激细胞生长需要脂质来组装新的细胞膜,但是否*由MYC调节还是与其他因素协同调节尚不清楚。因此本文主要是揭示MYC诱导的**...
AFADESI-MSI空间代谢组学:1、已落地执行项目100+,其中包括药物在组织中的分布、多种疾病类型和不同处理手段下组织中代谢物的空间成像检测。2、检测组织样本类型20+。高准性的定性算法通过物质表达空间情况、加和离子及同位素峰表达强度相似性、同位素表达空间分布相似性进行初步代谢物注释,并可基于专属物种组织类型数据库或非靶质谱数据基础上在初步注释结果基础上进一步获得更加准确定性的结果。已形成心、肝、脑等多个组织的空间代谢组专属数据库。空间代谢组学 技术咨询中心。广东空间代谢组学 中药活性成分空间代谢组学:前列腺*组织的分子表征对于寻找新的生物标志物、验证临床生物标志物和确定潜在的***靶点...
空间代谢组学:质谱成像技术近二十年来,随着质谱离子化技术的不断发展,质谱成像技术因其能够直观、快速、简便地呈现出分子在细胞或组织中的结构、空间与时间分布等信息,越来越受到大家的关注。并且质谱成像技术也被***的用在**疾病研究、药物前期发现等各领域的高质量文章中,为生物标志物的高灵敏度探测和药物代谢精确成像研究奠定了基础,下面进入到质谱“画”时代~是什么?有多少?在哪里?回答以上“灵魂”3问,首先需要了解他们之间的关系。质谱是通过采集化合物的质荷比,获得定性和定量的信息,进而去探究物质本身包含的化合物“是什么?”和“有多少?”这两个根本性问题。空间代谢组学-靶向代谢组学服务-擅长多组学联合分析...
获取空间代谢组学图像。计算了负离子和正离子模式下的平均空间代谢质谱(图5D,G)以及平均差谱,以突出不同样品的空间代谢质谱之间的差异(图5E,H)。制作的图像显示了属于注射侧(红色)或非注射侧(绿色)的后验概率。该分析基本证实了拉曼光谱特征,与对侧正常侧(非注射侧)相比,再髓鞘损伤(注射侧)发生了高度特异性的分子变化,尤其是正离子模式(图5F,I)。随后通过串联质谱法确认了区分胼胝体再髓鞘化和正常髓鞘化区域的*****峰,并在表1中报告。拉曼光谱和空间代谢组学表明,再髓鞘化区域的脂质成分不同于原始髓鞘的脂质成分。从小鼠模型获得的结果证明了HSL成像可以有效地研究再髓鞘化病变的脂质分布,这是脱髓...
空间代谢组学:a)小鼠脑冠状切片图像显示亮场图像和拉曼光谱图像(b)脂质,蛋白质和DNA的拉曼光谱覆盖层(c)髓鞘结合蛋白(MBP)、Tuj1(III类β-微管蛋白)和4',6-二氨基-2-苯基吲哚(DAPI)的代表性染色(d)小鼠大脑感兴趣区域的高分辨率显微拉曼图像(200×200μm),显示与脂类(2885cm−1)、蛋白质(2940cm−1)和DNA(3000cm−1)相关的拉曼光谱峰(e)K-means聚类(n=2个聚类)显示不同的脑组织特征(f)与twok-means团簇相关的**平均拉曼光谱(g)根据m/z848.63和m/z844.52,主要髓鞘的空间代谢组成像显示灰质和白质...
在获得AFADESI平台原创团队全力支持下,截止2021年9月,鹿明生物已经完成共计近千例样本经验,包括心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等十几种组织样本空间代谢组学检测及分析,检测物质涵盖胆碱类、多胺类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类、有机酸类、碳水化合物类、胆固醇类、胆酸类、脂质类等多种类代谢物。欢迎各老师咨询~空间多组学检测平台2套AFADESI-MSI成像系统,分别连接QE或者QE-HF高分辨质谱仪。欧易生物、鹿明生物2021年即拥有空间代谢组和空间转录组(欧易生物)两个平台,已执行空间代谢+空间转录联合项目10+。《空间代谢组科研应用手册》是一本集聚空间代谢组学的由来、发展、...
质谱成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作为一种新型的分子影像技术,能够直接从生物组织中获得大量已知或未知的内源性代谢物和外源***物等分子的结构、含量和空间分布信息。相对于其他成像方法(如荧光成像、放射性标记成像等),该技术无需化学或放射性标记、不需复杂样品前处理,具有高特异性、高通量和空间信息保留的突出优势。质谱成像技术可以实现生物组织中上千代谢物的定性、定量和定位分析,结合生物信息学分析,发展为空间代谢组学方法,可从生物组织原位发现差异代谢物,并识别其生物学功能。本篇小鹿盘点5篇空间代谢组学在科学研究中的经典应用~给您的组学研究提供更多支持~空间代谢组学基...
AFADESI-MSI空间代谢组学:生物组织**能代谢物的空间分布可以更深层次的理解组织特异性分子组织学和病理学。问题的**在于开发一种非靶向、高灵敏度、高覆盖和高特异性的成像方法,能够可视化大量代谢产物在其自然状态下的空间分布。将功能代谢物的空间和时间变化与组织结构和生物功能联系起来,从根本上解释组织在分子水平上发生了什么。AFADESI-MSI 是一种高灵敏、高覆盖、宽动态范围、强特异性的组织代谢物成像分析技术,灵敏度可达到 pg 级,且代谢物含量动态范围跨越 3 个数量级,实现了组织微区的精确表征和质量数相近代谢物的准确识别,可对组织大小为 1 mm×1 mm~1.5 cm×3.5 cm...
在空间上的代谢变化表明,在东莨菪碱***后,大鼠脑微区的代谢网络发生紊乱。但是代谢物和代谢酶是代谢网络的关键因素,基于空间分辨的代谢组学信息为发现酶或基因异常提供了线索,但若要完成完整的代谢网络分析必须进一步验证蛋白质和基因表达水平。本文作者开发了一种空间分辨代谢网络作图方法,通过无需衍生化、特定标记或复杂样品预处理的高通量AFADESI-MSI方法和代谢组学策略,在具有复杂结构化脑组织中发现代谢分子变化。能检测出多种极性内源性代谢物,并绘制相关代谢网络,提供组织微区分布的图谱。还将多种功能性小分子(例如核苷酸、多胺、肌酸、神经酰胺代谢物)含量分布可视化。鹿明生物是国内早期推出AFADESI-...
空间代谢组学:前列腺*组织的分子表征对于寻找新的生物标志物、验证临床生物标志物和确定潜在的***靶点非常重要。然而,前列腺*组织样本包含正常上皮、增生、基质和**区域,具有高度异质性,组织间固有的功能和分子差异导致常规的批量检测方法有不同程度的信息丢失。质谱成像(MSI)可以对组织切片不同区域中的潜在**标志物进行空间检测,有利于分析和比较不同组织类型的代谢组和脂质组学特征。鹿明生物已形成心、肝、脑等多个组织的空间代谢组专属数据库。欧易生物空间代谢组学。贵州空间代谢组学优势空间代谢组学:比较了NCE细胞、基质细胞和**细胞的代谢差异。柠檬酸盐、天冬氨酸盐、锌和多胺精胺在正常前列腺上皮细胞中含量...
通过空间代谢组学检测到正常肾脏与MYC诱导的**之间的GPs丰度(m/z:700–1000),发现两组存在***差异,尤其是m/z在865的***增加。酰基侧链较短(18个碳或更少)的PG在MYC***的前15天呈现增加趋势,然后开始减少,但酰基侧链较长的PG含量持续增加(图 5)。MYC失活后,这些差异在很大程度上是可逆的。通过体外实验证明,MYC的诱导和MYC失活能够增加和降低了PG合成基因的mRNA(图6C)。并且MYC活化还上调了FA延长酶ELOVL2和ELOVL6的mRNA表达丰度(图6D)。结果显示,MYC参与调节FA生成和相关基因的表达。空间代谢组学-代谢组学服务-擅长多组学联合...
本文作者开发的一种基于敞开式空气动力辅助解吸电喷雾离子化质谱成像(AFADESI-MSI)的空间代谢组学技术,可以实现大脑功能区域小分子极性代谢物的检测,发掘微区特定代谢途径的变化;结合代谢网络映射方法,对大鼠脑的代谢网络作图,并用于东莨菪碱***的阿尔茨海默病模型大脑微区的病理过程解析。这篇文章证实了空间代谢组学技术在神经学发展、行为与认知、精神与退行性疾病以及脑**研究领域的广泛应用前景。大脑的结构极为复杂,且主要功能区域的调节机制与小分子代谢物密切相关。基于色谱-质谱联用的传统代谢组学方法无法满足大脑复杂微区代谢物的定性、定量和定位表征的需求。鹿明生物空间代谢组学。广东质谱成像空间代谢组...
空间代谢组学探究MYC、SREBP1与**发生的能量机制探索。斯坦福大学Dean W. Felsher课题组在Cell Metabolism发表的题为“The MYC Oncogene Cooperates with SterolRegulated Element-Binding Protein to Regulate Lipogenesis Essential for Neoplastic Growth”的研究成果,通过空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等技术研究*基因MYC促进**发生机制,发现MYC与胆固醇调节元件结合蛋白(SREBP1)协同调节脂质生成,从而促进疾病...
空间代谢组学成像技术则是通过一些原位电离源,如DESI(解吸电喷雾电离源)、MALDI(基质辅助激光解吸电离源),与质谱相联,通过可视化的成像软件,使得被检测到的质荷比根据含量不同通过不同强度的色彩呈现,进而提供化合物“在哪里?”的信息。无需样品处理实时成像——电喷雾电离技术DESI系列比较大的优势就在于无需样品处理,DESI-MSI作为新型敞开式质谱成像技术,其突出的优势是在大气压条件且敞开式环境下,不需要进行复杂的样品前处理和基质辅助,可更真实反映样品表面分子分布特征。质谱成像空间代谢组学方法及其应用研究进展。河北空间代谢组学的n要多少空间代谢组学研究作者对P493-6B细胞淋巴瘤系(BC...
分子成像技术是研究大脑中DNA、RNA、蛋白质和代谢产物的强大工具。质谱成像技术(MSI)是一种检测大脑中蛋白质、代谢物和脂质物质的高灵敏度和高通量分子成像技术,在**边缘诊断、**生物标志物发现、药物分布和机理阐述等领域有***的应用。本文作者开发了一种基于敞开式空气动力辅助解吸电喷雾离子化质谱成像(AFADESI-MSI)技术的代谢网络映射方法,对大鼠脑不同极性的小分子代谢物(m/z50-500Da)进行微区分布研究,不仅鉴定出脑部几乎所有重要的代谢物,还绘制了包含神经递质、嘌呤,有机酸,多胺,胆碱、碳水化合物和脂类等20条通路的代谢网络,并使用这种代谢网络映射质谱成像方法解析了东莨菪碱致...
空间代谢组学:中文标题:粪便宏基因组和血清代谢组的整合分析揭示肠道微生物组相关代谢物在结直肠*和腺瘤检测的作用研究对象:人粪便、血清、组织发表期刊:Gut影响因子:23.059发表时间:2021年8月发表单位:国家**中心中国医学院科学院**医院运用生物技术:AFADESI-MSI空间代谢组学、LC-MS非靶代谢组、宏基因组、靶向代谢组学空间代谢组学由贺玖明教授团队提供技术支持。结直肠*(CRC)的早期诊断是提高患者生存率的有效方式。目前临床常用的非侵入性和入侵式检测方法因其准确率低或对患者造成伤害,大规模使用仍受限制。因此,发展无创且准确的检测方法变得尤为重要。空间代谢组技术原理 。吉林植物...
在空间上的代谢变化表明,在东莨菪碱***后,大鼠脑微区的代谢网络发生紊乱。但是代谢物和代谢酶是代谢网络的关键因素,基于空间分辨的代谢组学信息为发现酶或基因异常提供了线索,但若要完成完整的代谢网络分析必须进一步验证蛋白质和基因表达水平。本文作者开发了一种空间分辨代谢网络作图方法,通过无需衍生化、特定标记或复杂样品预处理的高通量AFADESI-MSI方法和代谢组学策略,在具有复杂结构化脑组织中发现代谢分子变化。能检测出多种极性内源性代谢物,并绘制相关代谢网络,提供组织微区分布的图谱。还将多种功能性小分子(例如核苷酸、多胺、肌酸、神经酰胺代谢物)含量分布可视化。空间代谢组技术特点。黑龙江深度空间代谢...
鹿明生物AFADESI-MSI空间代谢组技术作为一种新型的分子影像技术,能够获得组织***中1000Da以下代谢物和药物的定性、定量、定位三个维度的信息。具有免标记、无需基质、周期短、定位准的特点。在获得AFADESI-MSI平台原创团队全力支持下,经过前期的研发以及1年时间的技术服务积累,鹿明生物已经完成了心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等二十几种临床/动物/植物组织样本的空间代谢组学检测及分析,积累了丰富的样本前处理经验。专业空间代谢组学 技术团队,欢迎咨询。浙江空间代谢组学 书籍2021年9月30日,国家自然科学基金委员会发布的《关于发布生命科学部2021年度指南引导类原创探索计划...