空间代谢组学:绘制了不同代谢物在组织内浓度的图像,直观显示了代谢物在NCE细胞、基质细胞和**细胞的浓度差异。在正离子和负离子模式下检测到的质量分别用红色加号和蓝色减号表示。组织边缘用黑色边框勾勒出轮廓,但**区域还包含一些无法单独注释的*细胞与基质的区域。ADP=二磷酸腺苷,ATP=三磷酸腺苷,GPEA=甘油磷酰乙醇胺,HBCt=羟基丁酰肉碱,HE=苏木精和伊红,LPC=溶血磷脂酰胆碱,NAA=N-乙酰天冬氨酸,PE=磷脂酰乙醇胺,PI=磷脂酰肌醇空间代谢组学基本研究流程。甘肃玉米空间代谢组学空间代谢组学研究作者对P493-6B细胞淋巴瘤系(BCL)进行了全基因组表达谱、核突变和ChIP分析...
空间代谢组学:利用基质进行空间成像——MALDI质谱分子成像技术MALDI-MSI分析中非常关键的一点是需要添加基质来吸收激光能量,实现被测物的离子化,主要对脂质类化合物具有较好的分析效果, 空间分辨率比较高可以达到数个微米。其中,MALDI和DESI成像技术目前属于比较完善,使用范围较广的成像技术。这两种技术与质谱相连,使用范围有一定的互补性。二者结合使用,可实现“全谱图分子成像”,相信也有很多老师想要了解这二种成像方式有什么特点呢?欧易生物空间代谢组学适合整体方案,助力科研,。甘肃空间代谢组学和心脏空间代谢组学研究:一区 | IF:14.553多发性硬化症的相关空间代谢组学研究。本文为伦敦...
如空间代谢组。研究中开发了一种新的基于拉曼光谱和空间代谢组学分析的脂质组学(HSL)成像策略,用于分子表征和定量再髓鞘形成,并通过特定髓鞘蛋白的免疫标记进行了验证。利用拉曼和空间代谢组学数据生成了分子成像图谱,用于体外组织的生物分子结构和组成的关联。将相关脂质组成像方法应用于局灶性脱髓鞘小鼠模型和多发性硬化症死后脑标本的髓鞘再分化研究。发现不仅在脱髓鞘脑组织和正常脑组织之间,在有髓鞘组织和正常有髓组织之间,脂质成分皆存在差异。鹿明生物空间代谢组学。湖南质谱成像与空间代谢组学空间代谢组的成像。生成空间代谢组谱图和拉曼相关图,从而能够将振动光谱检测到的结构特征分配给通过质谱检测到的单个分子物种(图...
空间代谢组学:在大鼠脑绘制特定区域分布的极性代谢物图谱使用AFADESI-MSI在正离子和负离子模式下分别获得298个和372个微区轮廓清晰的代谢物离子图像。使用精确分子量并结合同位素丰度,通过人类代谢组数据库(HMDB)对离子图像进行识别,鉴定出多种内源极性代谢物,包括氨基酸、核苷酸或核苷、碳水化合物、脂肪酸和神经递质等。***系统(CNS)的特定功能和特定解剖区域相关。例如,乙酰胆碱在大脑皮层中高度表达;γ-氨基丁酸是一种抑制性神经递质,其在大脑皮层的信号强度较低,在中脑、嗅球和下丘脑中的浓度较高。什么是空间代谢组学?。上海空间代谢组学质谱质谱成像(Mass Spectrometry Im...
本篇为2021年8月,国家**中心中国医学院科学院**医院崔巍研究员与专业多组学技术团队合作在医学一区消化道领域国际期刊《GUT》期刊发表了题的研究成果,通过非靶向代谢组、靶向代谢组以及AFADESI-MSI空间代谢组学(研究方法,整合了宏基因组的数据,发现了可用于腺瘤及结直肠*诊断的代谢标志物,建立的相关预测模型显示出较高诊断准确性,为结直肠*早期诊断奠定坚实基础。在本研究中,作者对血清代谢组学和粪便宏基因组测序的结果进行整合分析,确定了一组与肠道微生物群密切相关的CRC和腺瘤患者的血清代谢物,并基于代谢物研发了肠道微生物组相关血清代谢物 (GMSM) 策略,可准确区分CRC和腺瘤患者(统称...
作者使用NMR对C原子进行示踪实验,发现MYC驱动葡萄糖和谷氨酰胺的C参与脂肪生成(图3)。采用空间代谢组学检测小鼠模型以及人BCL细胞中的FA,发现MYC**中不饱和脂肪酸(FA(18:1))的丰度增加。进一步发现13C-油酸酯在MYC诱导的BCL细胞未发生代谢,而13C-葡萄糖增加了不饱和FA中的标记碳。当MYC失活时,细胞中3H标记的棕榈酸酯氧化速率明显变高。MYC-ON和MYC-OFF的BCL细胞中的油酸酯均未被氧化。因此,MYC可能在抑制FA氧化的同时上调FA的合成。鹿明生物空间代谢组学。福建空间代谢组学药代动力学 空间代谢组学:a)小鼠脑冠状切片图像显示亮场图像和拉曼光谱图像(b...
本文作者开发的一种基于敞开式空气动力辅助解吸电喷雾离子化质谱成像(AFADESI-MSI)的空间代谢组学技术,可以实现大脑功能区域小分子极性代谢物的检测,发掘微区特定代谢途径的变化;结合代谢网络映射方法,对大鼠脑的代谢网络作图,并用于东莨菪碱***的阿尔茨海默病模型大脑微区的病理过程解析。这篇文章证实了空间代谢组学技术在神经学发展、行为与认知、精神与退行性疾病以及脑**研究领域的广泛应用前景。大脑的结构极为复杂,且主要功能区域的调节机制与小分子代谢物密切相关。基于色谱-质谱联用的传统代谢组学方法无法满足大脑复杂微区代谢物的定性、定量和定位表征的需求。空间代谢组通过质谱成像技术。浙江空间代谢组学...
空间代谢组学:中文标题:MYC*基因与固醇调节元件结合蛋白协同调节**生长所必需的脂肪生成研究对象:小鼠发表期刊:CellMetabolism影响因子:27.287合作单位:斯坦福大学运用生物技术:空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等MYC是一种原*基因,在细胞增殖、凋亡、分化等多种细胞生物学过程中发挥作用,其易位、扩增或表达异常常与多种**的发***展有关。近年来关于MYC在脂质代谢中的研究很多,据了解MYC与脂肪酸合成相关酶密切相关;致*基因MYC刺激细胞生长需要脂质来组装新的细胞膜,但是否*由MYC调节还是与其他因素协同调节尚不清楚。因此本文主要是揭示MYC诱导的**...
空间代谢组学:比较了NCE细胞、基质细胞和**细胞的代谢差异。柠檬酸盐、天冬氨酸盐、锌和多胺精胺在正常前列腺上皮细胞中含量较高,在**细胞中则水平较低。牛磺酸、葡萄糖、肌酸、AMP、ADP和ATP水平较高,与正常前列腺上皮功能相关联的代谢物(柠檬酸盐,天冬氨酸盐,锌和精胺)水平较低。**组织中肉碱、乙酰肉碱、N-乙酰天冬氨酸、甘油磷酸乙醇胺这些与脂质合成和脂质重排相关的几种代谢物含量上调,导致磷脂酰乙醇胺(PE)和磷脂酰肌醇(PI)含量上升。空间代谢组学 技术咨询中心。广西空间代谢组学 英语2021年9月30日,国家自然科学基金委员会发布的《关于发布生命科学部2021年度指南引导类原创探索计划...
AFADESI空间代谢组技术:免标记、无需基质喷涂、周期短、定位准是AFADESI空间代谢组技术的主要特点。该技术作为一种新型的分子影像技术,能够获得组织***中1000Da以下代谢物和药物的定性、定量、定位三个维度的信息。在获得AFADESI平台原创团队全力支持下,经过2021年一整年的研发及项目运营落地,鹿明生物积赞了如下优势。一、**支持AFADESI-MSI原创团队****-贺玖明教授(中国医学科学院北京协和医学院药物研究所PI)全力支持,参与的基于AFADESI平台发表的方法学及应用文章篇已在Gut、PNAS、Theranostics、AdvancedScience、Analytic...
空间代谢组学:中文标题:粪便宏基因组和血清代谢组的整合分析揭示肠道微生物组相关代谢物在结直肠*和腺瘤检测的作用研究对象:人粪便、血清、组织发表期刊:Gut影响因子:23.059发表时间:2021年8月发表单位:国家**中心中国医学院科学院**医院运用生物技术:AFADESI-MSI空间代谢组学、LC-MS非靶代谢组、宏基因组、靶向代谢组学空间代谢组学由贺玖明教授团队提供技术支持。结直肠*(CRC)的早期诊断是提高患者生存率的有效方式。目前临床常用的非侵入性和入侵式检测方法因其准确率低或对患者造成伤害,大规模使用仍受限制。因此,发展无创且准确的检测方法变得尤为重要。空间代谢组通过质谱成像技术。云...
空间代谢组学探究MYC、SREBP1与**发生的能量机制探索。斯坦福大学Dean W. Felsher课题组在Cell Metabolism发表的题为“The MYC Oncogene Cooperates with SterolRegulated Element-Binding Protein to Regulate Lipogenesis Essential for Neoplastic Growth”的研究成果,通过空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等技术研究*基因MYC促进**发生机制,发现MYC与胆固醇调节元件结合蛋白(SREBP1)协同调节脂质生成,从而促进疾病...
在空间上的代谢变化表明,在东莨菪碱***后,大鼠脑微区的代谢网络发生紊乱。但是代谢物和代谢酶是代谢网络的关键因素,基于空间分辨的代谢组学信息为发现酶或基因异常提供了线索,但若要完成完整的代谢网络分析必须进一步验证蛋白质和基因表达水平。本文作者开发了一种空间分辨代谢网络作图方法,通过无需衍生化、特定标记或复杂样品预处理的高通量AFADESI-MSI方法和代谢组学策略,在具有复杂结构化脑组织中发现代谢分子变化。能检测出多种极性内源性代谢物,并绘制相关代谢网络,提供组织微区分布的图谱。还将多种功能性小分子(例如核苷酸、多胺、肌酸、神经酰胺代谢物)含量分布可视化。空间分辨代谢组学进展和挑战。吉林植物冷...
空间代谢组学助力医科院药物所蒋建东团队探究靶向纳米技术促进小檗碱肝脏吸收机制。中国医学科学院药物研究所蒋建东团队课题组在NatureCommunications发表了题为“Liver-targetnanotechnologyfacilitatesberberinetoamelioratecardio-metabolicdiseases"的研究成果,通过AFADESI-MSI空间代谢组学、WesternBlotting、RT-PCR、Flowcytometry和ELISA等技术研究BBR-CTA-Mic对高脂饮食小鼠的代谢紊乱和******效果,发现BBR-CTA-Mic不仅可有效促进肝脏沉积和...
结果表明,原*基因MYC与SERBP蛋白共同调节**生长所必需的脂肪生成,MYC诱导SREBP1,然后二者共同***脂肪酸合成并利用葡萄糖和谷氨酰胺促进脂肪链的延伸。小鹿推荐通过空间代谢组学技术,能够观察到MYC诱导后不同**的体内脂质组学变化,准确地绘制MYC特异性脂质代谢的位置,因此可以利用这一**的致命弱点,用于新的抗脂质药物研究开发。在获得空间代谢组学AFADESI平台原创团队全力支持下,截止2021年9月,鹿明生物已经完成共计近千例样本经验,包括心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等十几种组织样本空间代谢组学检测及分析,检测物质涵盖胆碱类、多胺类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类...
空间代谢组学:该技术解决了生物组织中低含量代谢物难检测、覆盖种类少和成像质量差等技术难题,可实现生物组织中约1500个代谢物的成像分析,包括胆碱类、多胺类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类、有机酸类、碳水化合物类、胆固醇类、胆酸类和脂质类等,并精确表征与识别功能代谢物在组织亚区域的分布特征。在获得AFADESI-MSI平台原创团队全力支持下,经过前期的研发以及1年时间的技术服务积累,鹿明生物已经完成了心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等二十几种临床/动物/植物组织样本的空间代谢组学检测及分析,积累了丰富的样本前处理经验。空间代谢组特异性强等优点。陕西质谱成像与空间代谢组学AFADESI-...
空间代谢组学:中文标题:MYC*基因与固醇调节元件结合蛋白协同调节**生长所必需的脂肪生成研究对象:小鼠发表期刊:CellMetabolism影响因子:27.287合作单位:斯坦福大学运用生物技术:空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等MYC是一种原*基因,在细胞增殖、凋亡、分化等多种细胞生物学过程中发挥作用,其易位、扩增或表达异常常与多种**的发***展有关。本篇由斯坦福大学DeanW.Felsher课题组在CellMetabolism发表的研究成果,通过空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等技术研究*基因MYC促进**发生机制,发现MYC与胆固醇调节元件...
进行了相关的空间代谢组学研究来自同一患者的正常白质组织,旨在获得与患者再髓鞘病变相关的特定脂质谱(图6D−1)。通过串联质谱法确认鉴定的脂质,并在表2中报告。正如在小鼠组织分析中所观察到的,再髓鞘化区域主要在PC和PE脂质群的组成上不同。结果表明,HSL成像可以有效地用于多发性硬化患者死后病变的脂质谱分析,并表明多发性硬化患者再髓鞘化过程中产生的髓鞘与附近正常出现的白质相比具有改变的脂质谱。(a)正常白质(NAWM)和有髓鞘病变的平均拉曼光谱±1标准差(SD)。(b)平均差谱±1SD(NAWM−再髓鞘损伤)在结构水平显示再髓鞘过程。(c)基于有髓损伤的拉曼光谱的P***A后验概率图像突出NAW...
空间代谢组学能够在复杂的EA微环境中区分组织类型,本文作者使用两个队列对食管腺*的甘油磷脂特征进行了表征。**初运用空间代谢组学对连续患者的成对手术切除活检(EA和MHEE)进行甘油磷脂差异分析;(样本策略)选择这种取样方法的目的是为了进行手术切缘分析,并通过取样更大的样本来克服**的区域代谢组学差异。接下来,采用内窥镜活检对第二组人群进行采样。这样就可以从健康的志愿者和Barrett化***育不良的患者身上获得标本。这样还使作者能够验证***个队列的发现,调查该技术在小样本上的表现,并演示在内镜套件中促进诊断的第二次临床应用。空间代谢组支持个性化定制。浙江尿液空间代谢组学如空间代谢组。研究中...
通过空间代谢组学检测到正常肾脏与MYC诱导的**之间的GPs丰度(m/z:700–1000),发现两组存在***差异,尤其是m/z在865的***增加。酰基侧链较短(18个碳或更少)的PG在MYC***的前15天呈现增加趋势,然后开始减少,但酰基侧链较长的PG含量持续增加(图 5)。MYC失活后,这些差异在很大程度上是可逆的。通过体外实验证明,MYC的诱导和MYC失活能够增加和降低了PG合成基因的mRNA(图6C)。并且MYC活化还上调了FA延长酶ELOVL2和ELOVL6的mRNA表达丰度(图6D)。结果显示,MYC参与调节FA生成和相关基因的表达。空间代谢组学找出其代谢物的差异,提供定量检...
AFADESI-MSI空间代谢组学:生物组织**能代谢物的空间分布可以更深层次的理解组织特异性分子组织学和病理学。问题的**在于开发一种非靶向、高灵敏度、高覆盖和高特异性的成像方法,能够可视化大量代谢产物在其自然状态下的空间分布。将功能代谢物的空间和时间变化与组织结构和生物功能联系起来,从根本上解释组织在分子水平上发生了什么。AFADESI-MSI 是一种高灵敏、高覆盖、宽动态范围、强特异性的组织代谢物成像分析技术,灵敏度可达到 pg 级,且代谢物含量动态范围跨越 3 个数量级,实现了组织微区的精确表征和质量数相近代谢物的准确识别,可对组织大小为 1 mm×1 mm~1.5 cm×3.5 cm...
AFADESI-MSI空间代谢组学分析了对照组和东莨菪碱***的大鼠矢状脑切片,将发现的代谢物***映射代谢网络,并通过代谢组学分析发现空间代谢变化。不仅可以对药物准确定量,还可以检测代谢网络相关的数百种内源性代谢物在大脑特定区域的分布。图5显示了代谢网络中检测到的各种代谢物,以及在不同大脑微区代谢物的明显改变。如图5A所示,找到三种代谢物(N-甲酰基尿氨酸、L-色氨酸和5-羟色氨酸),属于色氨酸代谢途径,意味着东莨菪碱会干扰色氨酸的代谢过程。作者分析了东莨菪碱***组大鼠脑的十个微区,发现脑桥中有16种表达异常的代谢产物,而在大脑皮层中发现了7种。表明在东莨菪碱***下,脑桥和大脑皮层可能是...
质谱成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作为一种新型的分子影像技术,能够直接从生物组织中获得大量已知或未知的内源性代谢物和外源***物等分子的结构、含量和空间分布信息。相对于其他成像方法(如荧光成像、放射性标记成像等),该技术无需化学或放射性标记、不需复杂样品前处理,具有高特异性、高通量和空间信息保留的突出优势。质谱成像技术可以实现生物组织中上千代谢物的定性、定量和定位分析,结合生物信息学分析,发展为空间代谢组学方法,可从生物组织原位发现差异代谢物,并识别其生物学功能。本篇小鹿盘点5篇空间代谢组学在科学研究中的经典应用~给您的组学研究提供更多支持~质谱成像空间代...
如空间代谢组。研究中开发了一种新的基于拉曼光谱和空间代谢组学分析的脂质组学(HSL)成像策略,用于分子表征和定量再髓鞘形成,并通过特定髓鞘蛋白的免疫标记进行了验证。利用拉曼和空间代谢组学数据生成了分子成像图谱,用于体外组织的生物分子结构和组成的关联。将相关脂质组成像方法应用于局灶性脱髓鞘小鼠模型和多发性硬化症死后脑标本的髓鞘再分化研究。发现不仅在脱髓鞘脑组织和正常脑组织之间,在有髓鞘组织和正常有髓组织之间,脂质成分皆存在差异。空间代谢组学所解决的科研问题。云南空间代谢组学 英语空间代谢组学探究靶向纳米技术促进肝脏吸收机制研究。中文标题:肝脏靶向纳米技术促进小檗碱改善心脏代谢疾病研究对象:小檗碱...
质谱成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作为一种新型的分子影像技术,能够直接从生物组织中获得大量已知或未知的内源性代谢物和外源***物等分子的结构、含量和空间分布信息。相对于其他成像方法(如荧光成像、放射性标记成像等),该技术无需化学或放射性标记、不需复杂样品前处理,具有高特异性、高通量和空间信息保留的突出优势。质谱成像技术可以实现生物组织中上千代谢物的定性、定量和定位分析,结合生物信息学分析,发展为空间代谢组学方法,可从生物组织原位发现差异代谢物,并识别其生物学功能。空间代谢组学研究应用前景广阔。天津空间代谢组学概念本文作者开发的一种基于敞开式空气动力辅助解吸...
本篇为2021年8月,国家**中心中国医学院科学院**医院崔巍研究员与专业多组学技术团队合作在医学一区消化道领域国际期刊《GUT》期刊发表了题的研究成果,通过非靶向代谢组、靶向代谢组以及AFADESI-MSI空间代谢组学(研究方法,整合了宏基因组的数据,发现了可用于腺瘤及结直肠*诊断的代谢标志物,建立的相关预测模型显示出较高诊断准确性,为结直肠*早期诊断奠定坚实基础。在本研究中,作者对血清代谢组学和粪便宏基因组测序的结果进行整合分析,确定了一组与肠道微生物群密切相关的CRC和腺瘤患者的血清代谢物,并基于代谢物研发了肠道微生物组相关血清代谢物 (GMSM) 策略,可准确区分CRC和腺瘤患者(统称...
空间代谢组学:a)小鼠脑冠状切片图像显示亮场图像和拉曼光谱图像(b)脂质,蛋白质和DNA的拉曼光谱覆盖层(c)髓鞘结合蛋白(MBP)、Tuj1(III类β-微管蛋白)和4',6-二氨基-2-苯基吲哚(DAPI)的代表性染色(d)小鼠大脑感兴趣区域的高分辨率显微拉曼图像(200×200μm),显示与脂类(2885cm−1)、蛋白质(2940cm−1)和DNA(3000cm−1)相关的拉曼光谱峰(e)K-means聚类(n=2个聚类)显示不同的脑组织特征(f)与twok-means团簇相关的**平均拉曼光谱(g)根据m/z848.63和m/z844.52,主要髓鞘的空间代谢组成像显示灰质和白质...
鹿明生物引入Thermo ScientificTM Q Exactive HFTM将会在2022年对空间代谢组学研究带来更高效的产能及更多的探索。截止2022年1月10日,鹿明生物已拥有2台空间代谢组学**研究设备(见下方图片)。相信鹿明生物的2022将帮助各位科研学者提供更加快速、质量的研究。请期待鹿明生物2022给您带来的"极速"体验~基于AFADESI-MSI平台代谢物广覆盖度的优点,在临床样本以及动物样本中同时检测到胆碱类、多胺类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类、有机酸类、碳水化合物类、胆固醇类、胆酸类、脂质类等多种类代谢物,真正意义上满足了“空间代谢组学”的研究需求。鹿明生物购入...
空间代谢组学:前列腺*组织的分子表征对于寻找新的生物标志物、验证临床生物标志物和确定潜在的***靶点非常重要。然而,前列腺*组织样本包含正常上皮、增生、基质和**区域,具有高度异质性,组织间固有的功能和分子差异导致常规的批量检测方法有不同程度的信息丢失。质谱成像(MSI)可以对组织切片不同区域中的潜在**标志物进行空间检测,有利于分析和比较不同组织类型的代谢组和脂质组学特征。鹿明生物已形成心、肝、脑等多个组织的空间代谢组专属数据库。空间代谢组学是广大客户的选择,认准鹿明生物。陕西空间代谢组学技术怎么应用本篇小鹿分享一篇空间代谢组学专业应用技术文章,探究空间代谢组学如何进行前列腺*诊断和预后生物...
在空间上的代谢变化表明,在东莨菪碱***后,大鼠脑微区的代谢网络发生紊乱。但是代谢物和代谢酶是代谢网络的关键因素,基于空间分辨的代谢组学信息为发现酶或基因异常提供了线索,但若要完成完整的代谢网络分析必须进一步验证蛋白质和基因表达水平。本文作者开发了一种空间分辨代谢网络作图方法,通过无需衍生化、特定标记或复杂样品预处理的高通量AFADESI-MSI方法和代谢组学策略,在具有复杂结构化脑组织中发现代谢分子变化。能检测出多种极性内源性代谢物,并绘制相关代谢网络,提供组织微区分布的图谱。还将多种功能性小分子(例如核苷酸、多胺、肌酸、神经酰胺代谢物)含量分布可视化。空间代谢组学-代谢组学服务-擅长多组学...