空间代谢组学:伦敦帝国理工学院George B Hanna教授团队及合作者在《Cancer Research》发表了题为“De novo lipogenesis alters the phospholipidome of esophageal adenocarcinoma"的研究成果,该研究整合磷脂代谢组学、空间代谢组学和遗传学方法,旨在阐明食管腺*的磷脂代谢重编程,对探索与疾病诊断相关的磷脂生物标志物具有重要意义。中文标题:脂质从头合成改变食管腺*磷脂代谢研究对象:食管腺*发表期刊:CancerResearch影响因子:12.701发表单位:伦敦帝国理工学院运用生物技术:空间代谢组学代谢组学...
空间代谢组学:中文标题:粪便宏基因组和血清代谢组的整合分析揭示肠道微生物组相关代谢物在结直肠*和腺瘤检测的作用研究对象:人粪便、血清、组织发表期刊:Gut影响因子:23.059发表时间:2021年8月发表单位:国家**中心中国医学院科学院**医院运用生物技术:AFADESI-MSI空间代谢组学、LC-MS非靶代谢组、宏基因组、靶向代谢组学空间代谢组学由贺玖明教授团队提供技术支持。结直肠*(CRC)的早期诊断是提高患者生存率的有效方式。目前临床常用的非侵入性和入侵式检测方法因其准确率低或对患者造成伤害,大规模使用仍受限制。因此,发展无创且准确的检测方法变得尤为重要。空间代谢组学二维乃至三维的水平...
研究表明,MYC对磷脂酰肌醇(PI)代谢具有组织特异性。作者通过空间代谢组学检测到RCC和T-ALL中,MYC可逆地降低了PI;但在LC和HCC中,MYC反而增加了这些物质(图 7)。可能是由于肺表面富含PG和PI,MYC才会增加了LC中的PI含量。作者推断,MYC通常能够增加PGs含量,但以组织特异性方式差异调节其他GPs,如PIs。***作者对脂肪生成在MYC诱导的**发生中的作用进行了探究,通过空间代谢组学、IHC和Western Blot等方法证明通过体外抑制FA合成可以抑制MYC诱导的脂肪生成,从而抑制了RCC、HCC和BCL的增殖(图 8)。空间代谢组学所解决的科研问题。辽宁质谱成...
分子成像技术是研究大脑中DNA、RNA、蛋白质和代谢产物的强大工具。质谱成像技术(MSI)是一种检测大脑中蛋白质、代谢物和脂质物质的高灵敏度和高通量分子成像技术,在**边缘诊断、**生物标志物发现、药物分布和机理阐述等领域有***的应用。本文作者开发了一种基于敞开式空气动力辅助解吸电喷雾离子化质谱成像(AFADESI-MSI)技术的代谢网络映射方法,对大鼠脑不同极性的小分子代谢物(m/z50-500Da)进行微区分布研究,不仅鉴定出脑部几乎所有重要的代谢物,还绘制了包含神经递质、嘌呤,有机酸,多胺,胆碱、碳水化合物和脂类等20条通路的代谢网络,并使用这种代谢网络映射质谱成像方法解析了东莨菪碱致...
空间代谢组学:中文标题:MYC*基因与固醇调节元件结合蛋白协同调节**生长所必需的脂肪生成研究对象:小鼠发表期刊:CellMetabolism影响因子:27.287合作单位:斯坦福大学运用生物技术:空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等MYC是一种原*基因,在细胞增殖、凋亡、分化等多种细胞生物学过程中发挥作用,其易位、扩增或表达异常常与多种**的发***展有关。本篇由斯坦福大学DeanW.Felsher课题组在CellMetabolism发表的研究成果,通过空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等技术研究*基因MYC促进**发生机制,发现MYC与胆固醇调节元件...
空间代谢组学助力医科院药物所蒋建东团队探究靶向纳米技术促进小檗碱肝脏吸收机制。中国医学科学院药物研究所蒋建东团队课题组在NatureCommunications发表了题为“Liver-targetnanotechnologyfacilitatesberberinetoamelioratecardio-metabolicdiseases"的研究成果,通过AFADESI-MSI空间代谢组学、WesternBlotting、RT-PCR、Flowcytometry和ELISA等技术研究BBR-CTA-Mic对高脂饮食小鼠的代谢紊乱和******效果,发现BBR-CTA-Mic不仅可有效促进肝脏沉积和...
本篇小鹿分享一篇空间代谢组学专业应用技术文章,探究空间代谢组学如何进行前列腺*诊断和预后生物标志物的差异研究?该研究发现了前列腺*样本中的特定组织区室的不同代谢特征,确定了几种可能被进一步开发为前列腺*的诊断和预后生物标志物的差异代谢物和脂质。空间代谢组学能够快速提供代谢物的水平差异和空间信息,是临床上有潜力的创新诊断工具。免标记、无需基质喷涂、周期短、定位准是AFADESI空间代谢组技术的主要特点。该技术作为一种新型的分子影像技术,能够获得组织***中1000Da以下代谢物和药物的定性、定量、定位三个维度的信息。欧易生物空间代谢组学适合整体方案,助力科研,。海南空间代谢组学公司队列1:收集手...
获取空间代谢组学图像。计算了负离子和正离子模式下的平均空间代谢质谱(图5D,G)以及平均差谱,以突出不同样品的空间代谢质谱之间的差异(图5E,H)。制作的图像显示了属于注射侧(红色)或非注射侧(绿色)的后验概率。该分析基本证实了拉曼光谱特征,与对侧正常侧(非注射侧)相比,再髓鞘损伤(注射侧)发生了高度特异性的分子变化,尤其是正离子模式(图5F,I)。随后通过串联质谱法确认了区分胼胝体再髓鞘化和正常髓鞘化区域的*****峰,并在表1中报告。拉曼光谱和空间代谢组学表明,再髓鞘化区域的脂质成分不同于原始髓鞘的脂质成分。从小鼠模型获得的结果证明了HSL成像可以有效地研究再髓鞘化病变的脂质分布,这是脱髓...
通过空间代谢组学测量了四种转基因小鼠模型(肺*(LC)、RCC、HCC和T-ALL)中甘油磷脂(GPs)的含量,发现在不同的**中,MYC诱导改变了磷酸酰甘油(PGs)的丰度(图 4A),能够增加了大多数PG物质。MYC失活后,PG丰度恢复到基础水平(图 4B)。PGs由磷脂酸(PA)通过向3-磷酸甘油中添加两种FA形成,因此,PG诱导可以建立在MYC促进的FA增加的基础上。然而,在体内PGs相对于其他GPs的相对优先合成,这意味着MYC有除FA合成之外的其他方式调节脂肪生成。曾经错过热潮—空间转录组,别再错过新秀—空间代谢组。浙江植物冷冻切片与空间代谢组学空间代谢组学主要从事质谱成像新技术、...
本篇小鹿分享一篇空间代谢组学专业应用技术文章,探究空间代谢组学如何进行前列腺*诊断和预后生物标志物的差异研究?该研究发现了前列腺*样本中的特定组织区室的不同代谢特征,确定了几种可能被进一步开发为前列腺*的诊断和预后生物标志物的差异代谢物和脂质。空间代谢组学能够快速提供代谢物的水平差异和空间信息,是临床上有潜力的创新诊断工具。免标记、无需基质喷涂、周期短、定位准是AFADESI空间代谢组技术的主要特点。该技术作为一种新型的分子影像技术,能够获得组织***中1000Da以下代谢物和药物的定性、定量、定位三个维度的信息。空间代谢组相关技术服务,经验丰富。山西空间代谢组学公司空间代谢组学(AFADES...
以上结果表明,AFADESI-MSI方法可以直接检测极性代谢产物,并具有高特异性,能呈现其在大脑微区分布的图像。3.在大鼠脑中绘制微区代谢网络图要了解大脑的结构区域发生的复杂代谢过程,不仅应准确表征代谢物,还要研究其相关性。从大鼠脑微区中提取代谢谱进行代谢网络重建。从15个微区提取的MSI数据进行峰挑选和峰对齐(图1F),包括松果体、中脑导水管、脑桥、梨状皮质、延髓、丘脑、纹状体、海马、胼胝体、嗅球、大脑皮层、小脑皮层、穹窿、小脑延髓和丘脑。鹿明生物空间代谢组学。江苏花瓣空间代谢组学空间代谢组学能够在复杂的EA微环境中区分组织类型,本文作者使用两个队列对食管腺*的甘油磷脂特征进行了表征。**初...
1.样本准备Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射东莨菪碱后被杀死(处理组,3只),对照组大鼠(3只)也用同样方法杀死。获取大鼠整个大脑,在低温下将大脑切成连续的矢状切片(暴露出海马和纹状体),用于Nissl染色、H&E染色和质谱成像检测。2.空间代谢组实验使用AFADESI-MSI分析,代谢物质量数范围50-500Da,质谱分辨率70,000。3.数据处理和代谢网络分析原始数据经过转化,再使用自建MassImager软件获取成像结果;在获取差异代谢物的高分辨率质谱信息后,使用Metaboanalys在线数据挖掘软件以褐家鼠(rattusnorvegicus)为参考完成代谢物高通量定性,...
空间代谢组学探究MYC、SREBP1与**发生的能量机制探索。斯坦福大学Dean W. Felsher课题组在Cell Metabolism发表的题为“The MYC Oncogene Cooperates with SterolRegulated Element-Binding Protein to Regulate Lipogenesis Essential for Neoplastic Growth”的研究成果,通过空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等技术研究*基因MYC促进**发生机制,发现MYC与胆固醇调节元件结合蛋白(SREBP1)协同调节脂质生成,从而促进疾病...
空间代谢组学:利用基质进行空间成像——MALDI质谱分子成像技术MALDI-MSI分析中非常关键的一点是需要添加基质来吸收激光能量,实现被测物的离子化,主要对脂质类化合物具有较好的分析效果, 空间分辨率比较高可以达到数个微米。其中,MALDI和DESI成像技术目前属于比较完善,使用范围较广的成像技术。这两种技术与质谱相连,使用范围有一定的互补性。二者结合使用,可实现“全谱图分子成像”,相信也有很多老师想要了解这二种成像方式有什么特点呢?空间代谢组支持个性化定制。山西空间代谢组学药代动力学AFADESI-MSI空间代谢组学:中文标题:肝脏靶向纳米技术促进小檗碱改善心脏代谢疾病研究对象:小檗碱、小...
分子成像技术是研究大脑中DNA、RNA、蛋白质和代谢产物的强大工具。质谱成像技术(MSI)是一种检测大脑中蛋白质、代谢物和脂质物质的高灵敏度和高通量分子成像技术,在**边缘诊断、**生物标志物发现、药物分布和机理阐述等领域有***的应用。本文作者开发了一种基于敞开式空气动力辅助解吸电喷雾离子化质谱成像(AFADESI-MSI)技术的代谢网络映射方法,对大鼠脑不同极性的小分子代谢物(m/z50-500Da)进行微区分布研究,不仅鉴定出脑部几乎所有重要的代谢物,还绘制了包含神经递质、嘌呤,有机酸,多胺,胆碱、碳水化合物和脂类等20条通路的代谢网络,并使用这种代谢网络映射质谱成像方法解析了东莨菪碱致...
空间代谢组学:比较了NCE细胞、基质细胞和**细胞的代谢差异。柠檬酸盐、天冬氨酸盐、锌和多胺精胺在正常前列腺上皮细胞中含量较高,在**细胞中则水平较低。牛磺酸、葡萄糖、肌酸、AMP、ADP和ATP水平较高,与正常前列腺上皮功能相关联的代谢物(柠檬酸盐,天冬氨酸盐,锌和精胺)水平较低。**组织中肉碱、乙酰肉碱、N-乙酰天冬氨酸、甘油磷酸乙醇胺这些与脂质合成和脂质重排相关的几种代谢物含量上调,导致磷脂酰乙醇胺(PE)和磷脂酰肌醇(PI)含量上升。空间代谢组学又有什么用呢?。湖南空间代谢组学和心脏1.样本准备Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射东莨菪碱后被杀死(处理组,3只),对照组大鼠(3...
本篇为2021年8月,国家**中心中国医学院科学院**医院崔巍研究员与专业多组学技术团队合作在医学一区消化道领域国际期刊《GUT》期刊发表了题的研究成果,通过非靶向代谢组、靶向代谢组以及AFADESI-MSI空间代谢组学(研究方法,整合了宏基因组的数据,发现了可用于腺瘤及结直肠*诊断的代谢标志物,建立的相关预测模型显示出较高诊断准确性,为结直肠*早期诊断奠定坚实基础。在本研究中,作者对血清代谢组学和粪便宏基因组测序的结果进行整合分析,确定了一组与肠道微生物群密切相关的CRC和腺瘤患者的血清代谢物,并基于代谢物研发了肠道微生物组相关血清代谢物 (GMSM) 策略,可准确区分CRC和腺瘤患者(统称...
空间代谢组学助力医科院药物所蒋建东团队探究靶向纳米技术促进小檗碱肝脏吸收机制。中国医学科学院药物研究所蒋建东团队课题组在NatureCommunications发表了题为“Liver-targetnanotechnologyfacilitatesberberinetoamelioratecardio-metabolicdiseases"的研究成果,通过AFADESI-MSI空间代谢组学、WesternBlotting、RT-PCR、Flowcytometry和ELISA等技术研究BBR-CTA-Mic对高脂饮食小鼠的代谢紊乱和******效果,发现BBR-CTA-Mic不仅可有效促进肝脏沉积和...
空间代谢组学:在大鼠脑绘制特定区域分布的极性代谢物图谱使用AFADESI-MSI在正离子和负离子模式下分别获得298个和372个微区轮廓清晰的代谢物离子图像。使用精确分子量并结合同位素丰度,通过人类代谢组数据库(HMDB)对离子图像进行识别,鉴定出多种内源极性代谢物,包括氨基酸、核苷酸或核苷、碳水化合物、脂肪酸和神经递质等。***系统(CNS)的特定功能和特定解剖区域相关。例如,乙酰胆碱在大脑皮层中高度表达;γ-氨基丁酸是一种抑制性神经递质,其在大脑皮层的信号强度较低,在中脑、嗅球和下丘脑中的浓度较高。空间代谢组是基于质谱成像技术发展而来的,免标记、无需基质、周期短。重庆空间代谢组学鹿明 空...
鹿明生物空间代谢组学项目实测结果1、可实现代谢物定性数量:1000-3000个代谢物。2、定性代谢物类型:不喷涂基质,小分子物质检测不被基质抑制,定性物质约70%为700Da以下的小分子物质,30%为脂质大分子。空间多组学联合:空间代谢+空间转录2021年即拥有空间代谢组和空间转录组(欧易生物)两个平台,已执行空间代谢+空间转录联合项目10+。空间多组学检测平台2套AFADESI-MSI成像系统,分别连接QE或者QE-HF高分辨质谱仪。***套AFADESI成像系统(连接Thermo QE高分辨质谱仪)第二套AFADESI成像系统系统(连接Thermo QE-HF高分辨质谱仪)空间代谢组特异性...
分子成像技术是研究大脑中DNA、RNA、蛋白质和代谢产物的强大工具。质谱成像技术(MSI)是一种检测大脑中蛋白质、代谢物和脂质物质的高灵敏度和高通量分子成像技术,在**边缘诊断、**生物标志物发现、药物分布和机理阐述等领域有***的应用。本文作者开发了一种基于敞开式空气动力辅助解吸电喷雾离子化质谱成像(AFADESI-MSI)技术的代谢网络映射方法,对大鼠脑不同极性的小分子代谢物(m/z50-500Da)进行微区分布研究,不仅鉴定出脑部几乎所有重要的代谢物,还绘制了包含神经递质、嘌呤,有机酸,多胺,胆碱、碳水化合物和脂类等20条通路的代谢网络,并使用这种代谢网络映射质谱成像方法解析了东莨菪碱致...
质谱成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作为一种新型的分子影像技术,能够直接从生物组织中获得大量已知或未知的内源性代谢物和外源***物等分子的结构、含量和空间分布信息。相对于其他成像方法(如荧光成像、放射性标记成像等),该技术无需化学或放射性标记、不需复杂样品前处理,具有高特异性、高通量和空间信息保留的突出优势。质谱成像技术可以实现生物组织中上千代谢物的定性、定量和定位分析,结合生物信息学分析,发展为空间代谢组学方法,可从生物组织原位发现差异代谢物,并识别其生物学功能。空间代谢组是基于质谱成像技术发展而来的,免标记、无需基质、周期短。江苏空间代谢组学 英语空间代...
通过空间代谢组学检测到正常肾脏与MYC诱导的**之间的GPs丰度(m/z:700–1000),发现两组存在***差异,尤其是m/z在865的***增加。酰基侧链较短(18个碳或更少)的PG在MYC***的前15天呈现增加趋势,然后开始减少,但酰基侧链较长的PG含量持续增加(图 5)。MYC失活后,这些差异在很大程度上是可逆的。通过体外实验证明,MYC的诱导和MYC失活能够增加和降低了PG合成基因的mRNA(图6C)。并且MYC活化还上调了FA延长酶ELOVL2和ELOVL6的mRNA表达丰度(图6D)。结果显示,MYC参与调节FA生成和相关基因的表达。空间代谢组学基本研究流程。广东空间代谢组学...
空间代谢组学主要从事质谱成像新技术、空间分辨代谢组学新方法及其在生物医药应用研究和临床前新药代谢研究。近年来在质谱成像空间分辨代谢组学领域取得重要突破,并**国际前沿发展。目前,承担着国家自然科学基金、医科院创新工程等多项课题,科研经费充足;拥有先进的液质联用仪器和质谱成像仪器数台,建立了新药研发质量管理规范体系,实验条件完备。具有分析化学、或药物分析、或生物学等相关专业的博士学位。2、具有以下研究经验或能力之一:质谱分析;代谢组学研究;与新药或疾病相关的分子生物学研究;生物信息学等。空间代谢组学的力量探究前列腺*。贵州深度空间代谢组学是靶向代谢组吗空间代谢组学:中文标题:粪便宏基因组和血清代...
空间代谢组学成像技术则是通过一些原位电离源,如DESI(解吸电喷雾电离源)、MALDI(基质辅助激光解吸电离源),与质谱相联,通过可视化的成像软件,使得被检测到的质荷比根据含量不同通过不同强度的色彩呈现,进而提供化合物“在哪里?”的信息。无需样品处理实时成像——电喷雾电离技术DESI系列比较大的优势就在于无需样品处理,DESI-MSI作为新型敞开式质谱成像技术,其突出的优势是在大气压条件且敞开式环境下,不需要进行复杂的样品前处理和基质辅助,可更真实反映样品表面分子分布特征。空间代谢组技术特点。上海植物空间代谢组学空间代谢组学:中文标题:MYC*基因与固醇调节元件结合蛋白协同调节**生长所必需的...
空间代谢组学:食道腺*是全球第八大崔常见的恶性**发病率正在持续上升,但存活率仍然很低,目前急需新的工具来提高早期诊断和精确***。脂质代谢紊乱与**的发***展密切相关,大多数脂质以甘油磷脂(GPLs)的形式储存在双分子膜中,基于甘油磷脂具有较稳定的物理化学性质,因此将其作为疾病诊断的生物标志物具有重要意义。质谱成像(MSI)可在几分钟内对冷冻切片组织的**磷脂体量化并进行客观诊断。然而,MSI是否能客观识别原发性食管腺*目前尚不清楚,这是一个重大的挑战,因为该微环境复杂,组织类型的表型相似。蛋白质组学的研究方法。天津空间代谢组学和普通代谢组学本篇为2021年8月,国家**中心中国医学院科学...
本篇小鹿分享一篇空间代谢组学专业应用技术文章,探究空间代谢组学如何进行前列腺*诊断和预后生物标志物的差异研究?该研究发现了前列腺*样本中的特定组织区室的不同代谢特征,确定了几种可能被进一步开发为前列腺*的诊断和预后生物标志物的差异代谢物和脂质。空间代谢组学能够快速提供代谢物的水平差异和空间信息,是临床上有潜力的创新诊断工具。免标记、无需基质喷涂、周期短、定位准是AFADESI空间代谢组技术的主要特点。该技术作为一种新型的分子影像技术,能够获得组织***中1000Da以下代谢物和药物的定性、定量、定位三个维度的信息。空间代谢组学二维乃至三维的水平,极大拓展了对组学样品信息的认知。广东空间代谢组学...
通过空间代谢组学测量了四种转基因小鼠模型(肺*(LC)、RCC、HCC和T-ALL)中甘油磷脂(GPs)的含量,发现在不同的**中,MYC诱导改变了磷酸酰甘油(PGs)的丰度(图 4A),能够增加了大多数PG物质。MYC失活后,PG丰度恢复到基础水平(图 4B)。PGs由磷脂酸(PA)通过向3-磷酸甘油中添加两种FA形成,因此,PG诱导可以建立在MYC促进的FA增加的基础上。然而,在体内PGs相对于其他GPs的相对优先合成,这意味着MYC有除FA合成之外的其他方式调节脂肪生成。空间代谢组技术特点。辽宁玉米空间代谢组学基于AFADESI-MSI平台代谢物广覆盖度的优点,在临床样本以及动物样本中同...
空间代谢组学研究:一区 | IF:14.553多发性硬化症的相关空间代谢组学研究。本文为伦敦帝国理工学院Zoltan Takats教授课题组在ACS central science期刊发表的题为“Correlated Heterospectral Lipidomics for Biomolecular Profiling of Remyelination in Multiple Sclerosis"的研究成果,通过拉曼+空间代谢组学+IHC研究方法,发现了新形成的髓鞘与正常髓鞘具有不同的脂质成分,探究了多发性硬化中再髓鞘化形成的机理,描绘了用于关联生物分子结构和髓鞘成分的分子成像图谱,为评估再...
以上结果表明,AFADESI-MSI方法可以直接检测极性代谢产物,并具有高特异性,能呈现其在大脑微区分布的图像。3.在大鼠脑中绘制微区代谢网络图要了解大脑的结构区域发生的复杂代谢过程,不仅应准确表征代谢物,还要研究其相关性。从大鼠脑微区中提取代谢谱进行代谢网络重建。从15个微区提取的MSI数据进行峰挑选和峰对齐(图1F),包括松果体、中脑导水管、脑桥、梨状皮质、延髓、丘脑、纹状体、海马、胼胝体、嗅球、大脑皮层、小脑皮层、穹窿、小脑延髓和丘脑。空间代谢组学又有什么用呢?。贵州3d空间代谢组学2021年9月30日,国家自然科学基金委员会发布的《关于发布生命科学部2021年度指南引导类原创探索计划项...