质谱成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作为一种新型的分子影像技术,能够直接从生物组织中获得大量已知或未知的内源性代谢物和外源***物等分子的结构、含量和空间分布信息。相对于其他成像方法(如荧光成像、放射性标记成像等),该技术无需化学或放射性标记、不需复杂样品前处理,具有高特异性、高通量和空间信息保留的突出优势。质谱成像技术可以实现生物组织中上千代谢物的定性、定量和定位分析,结合生物信息学分析,发展为空间代谢组学方法,可从生物组织原位发现差异代谢物,并识别其生物学功能。本篇小鹿盘点5篇空间代谢组学在科学研究中的经典应用~给您的组学研究提供更多支持~质谱成像技术可...
空间代谢组学:在大鼠脑绘制特定区域分布的极性代谢物图谱使用AFADESI-MSI在正离子和负离子模式下分别获得298个和372个微区轮廓清晰的代谢物离子图像。使用精确分子量并结合同位素丰度,通过人类代谢组数据库(HMDB)对离子图像进行识别,鉴定出多种内源极性代谢物,包括氨基酸、核苷酸或核苷、碳水化合物、脂肪酸和神经递质等。***系统(CNS)的特定功能和特定解剖区域相关。例如,乙酰胆碱在大脑皮层中高度表达;γ-氨基丁酸是一种抑制性神经递质,其在大脑皮层的信号强度较低,在中脑、嗅球和下丘脑中的浓度较高。《鹿明生物空间代谢组学千万医学支持计划。北京空间代谢组学技术鹿明生物AFADESI-MSI空...
空间代谢组学:伦敦帝国理工学院George B Hanna教授团队及合作者在《Cancer Research》发表了题为“De novo lipogenesis alters the phospholipidome of esophageal adenocarcinoma"的研究成果,该研究整合磷脂代谢组学、空间代谢组学和遗传学方法,旨在阐明食管腺*的磷脂代谢重编程,对探索与疾病诊断相关的磷脂生物标志物具有重要意义。中文标题:脂质从头合成改变食管腺*磷脂代谢研究对象:食管腺*发表期刊:CancerResearch影响因子:12.701发表单位:伦敦帝国理工学院运用生物技术:空间代谢组学鹿明生物...
AFADESI-MSI空间代谢组学分析了对照组和东莨菪碱***的大鼠矢状脑切片,将发现的代谢物***映射代谢网络,并通过代谢组学分析发现空间代谢变化。不仅可以对药物准确定量,还可以检测代谢网络相关的数百种内源性代谢物在大脑特定区域的分布。图5显示了代谢网络中检测到的各种代谢物,以及在不同大脑微区代谢物的明显改变。如图5A所示,找到三种代谢物(N-甲酰基尿氨酸、L-色氨酸和5-羟色氨酸),属于色氨酸代谢途径,意味着东莨菪碱会干扰色氨酸的代谢过程。作者分析了东莨菪碱***组大鼠脑的十个微区,发现脑桥中有16种表达异常的代谢产物,而在大脑皮层中发现了7种。表明在东莨菪碱***下,脑桥和大脑皮层可能是...
分子成像技术是研究大脑中DNA、RNA、蛋白质和代谢产物的强大工具。质谱成像技术(MSI)是一种检测大脑中蛋白质、代谢物和脂质物质的高灵敏度和高通量分子成像技术,在**边缘诊断、**生物标志物发现、药物分布和机理阐述等领域有***的应用。本文作者开发了一种基于敞开式空气动力辅助解吸电喷雾离子化质谱成像(AFADESI-MSI)技术的代谢网络映射方法,对大鼠脑不同极性的小分子代谢物(m/z50-500Da)进行微区分布研究,不仅鉴定出脑部几乎所有重要的代谢物,还绘制了包含神经递质、嘌呤,有机酸,多胺,胆碱、碳水化合物和脂类等20条通路的代谢网络,并使用这种代谢网络映射质谱成像方法解析了东莨菪碱致...
空间代谢组学:质谱成像方法提供了一种直接获取代谢网络信息的途径,以系统地深入了解大脑的代谢活动。基于KEGG数据库的Metaboanalyst软件进行代谢网络分析。共找到20条KEGG代谢通路,包含126个具有微区信息的代谢物,图2显示了涉及丙氨酸-天冬氨酸和谷氨酸代谢、花生四烯酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、肌酸途径、GABA能突触、葡萄糖代谢、谷胱甘肽代谢、甘油磷脂代谢、甘氨酸-丝氨酸和苏氨酸的代谢、组氨酸代谢、赖氨酸代谢、苯丙氨酸代谢、多胺代谢途径、嘌呤代谢、嘧啶代谢和TCA循环、色氨酸代谢、酪氨酸代谢、缬氨酸-亮氨酸和异亮氨酸代谢和类固醇***合成途径。空间代谢组学又有什么用呢?。重庆空间...
空间代谢组学:在大鼠脑绘制特定区域分布的极性代谢物图谱使用AFADESI-MSI在正离子和负离子模式下分别获得298个和372个微区轮廓清晰的代谢物离子图像。使用精确分子量并结合同位素丰度,通过人类代谢组数据库(HMDB)对离子图像进行识别,鉴定出多种内源极性代谢物,包括氨基酸、核苷酸或核苷、碳水化合物、脂肪酸和神经递质等。***系统(CNS)的特定功能和特定解剖区域相关。例如,乙酰胆碱在大脑皮层中高度表达;γ-氨基丁酸是一种抑制性神经递质,其在大脑皮层的信号强度较低,在中脑、嗅球和下丘脑中的浓度较高。空间分辨代谢组学进展和挑战。山西空间代谢组学优势进行了相关的空间代谢组学研究来自同一患者的正...
空间代谢组学:中文标题:MYC*基因与固醇调节元件结合蛋白协同调节**生长所必需的脂肪生成研究对象:小鼠发表期刊:CellMetabolism影响因子:27.287合作单位:斯坦福大学运用生物技术:空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等MYC是一种原*基因,在细胞增殖、凋亡、分化等多种细胞生物学过程中发挥作用,其易位、扩增或表达异常常与多种**的发***展有关。近年来关于MYC在脂质代谢中的研究很多,据了解MYC与脂肪酸合成相关酶密切相关;致*基因MYC刺激细胞生长需要脂质来组装新的细胞膜,但是否*由MYC调节还是与其他因素协同调节尚不清楚。因此本文主要是揭示MYC诱导的**...
本篇为2021年8月,国家**中心中国医学院科学院**医院崔巍研究员与专业多组学技术团队合作在医学一区消化道领域国际期刊《GUT》期刊发表了题的研究成果,通过非靶向代谢组、靶向代谢组以及AFADESI-MSI空间代谢组学(研究方法,整合了宏基因组的数据,发现了可用于腺瘤及结直肠*诊断的代谢标志物,建立的相关预测模型显示出较高诊断准确性,为结直肠*早期诊断奠定坚实基础。在本研究中,作者对血清代谢组学和粪便宏基因组测序的结果进行整合分析,确定了一组与肠道微生物群密切相关的CRC和腺瘤患者的血清代谢物,并基于代谢物研发了肠道微生物组相关血清代谢物 (GMSM) 策略,可准确区分CRC和腺瘤患者(统称...
1.样本准备Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射东莨菪碱后被杀死(处理组,3只),对照组大鼠(3只)也用同样方法杀死。获取大鼠整个大脑,在低温下将大脑切成连续的矢状切片(暴露出海马和纹状体),用于Nissl染色、H&E染色和质谱成像检测。2.空间代谢组实验使用AFADESI-MSI分析,代谢物质量数范围50-500Da,质谱分辨率70,000。3.数据处理和代谢网络分析原始数据经过转化,再使用自建MassImager软件获取成像结果;在获取差异代谢物的高分辨率质谱信息后,使用Metaboanalys在线数据挖掘软件以褐家鼠(rattusnorvegicus)为参考完成代谢物高通量定性,...
在获得AFADESI平台原创团队全力支持下,截止2021年9月,鹿明生物已经完成共计近千例样本经验,包括心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等十几种组织样本空间代谢组学检测及分析,检测物质涵盖胆碱类、多胺类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类、有机酸类、碳水化合物类、胆固醇类、胆酸类、脂质类等多种类代谢物。欢迎各老师咨询~空间多组学检测平台2套AFADESI-MSI成像系统,分别连接QE或者QE-HF高分辨质谱仪。欧易生物、鹿明生物2021年即拥有空间代谢组和空间转录组(欧易生物)两个平台,已执行空间代谢+空间转录联合项目10+。空间代谢组学研究应用前景广阔。河南空间代谢组学概念空间代谢组学...
AFADESI空间代谢组技术:免标记、无需基质喷涂、周期短、定位准是AFADESI空间代谢组技术的主要特点。该技术作为一种新型的分子影像技术,能够获得组织***中1000Da以下代谢物和药物的定性、定量、定位三个维度的信息。在获得AFADESI平台原创团队全力支持下,经过2021年一整年的研发及项目运营落地,鹿明生物积赞了如下优势。一、**支持AFADESI-MSI原创团队****-贺玖明教授(中国医学科学院北京协和医学院药物研究所PI)全力支持,参与的基于AFADESI平台发表的方法学及应用文章篇已在Gut、PNAS、Theranostics、AdvancedScience、Analytic...
空间代谢组学:中文标题:粪便宏基因组和血清代谢组的整合分析揭示肠道微生物组相关代谢物在结直肠*和腺瘤检测的作用研究对象:人粪便、血清、组织发表期刊:Gut影响因子:23.059发表时间:2021年8月发表单位:国家**中心中国医学院科学院**医院运用生物技术:AFADESI-MSI空间代谢组学、LC-MS非靶代谢组、宏基因组、靶向代谢组学空间代谢组学由贺玖明教授团队提供技术支持。结直肠*(CRC)的早期诊断是提高患者生存率的有效方式。目前临床常用的非侵入性和入侵式检测方法因其准确率低或对患者造成伤害,大规模使用仍受限制。因此,发展无创且准确的检测方法变得尤为重要。蛋白质组学的研究方法。海南空间...
本文作者开发的一种基于敞开式空气动力辅助解吸电喷雾离子化质谱成像(AFADESI-MSI)的空间代谢组学技术,可以实现大脑功能区域小分子极性代谢物的检测,发掘微区特定代谢途径的变化;结合代谢网络映射方法,对大鼠脑的代谢网络作图,并用于东莨菪碱***的阿尔茨海默病模型大脑微区的病理过程解析。这篇文章证实了空间代谢组学技术在神经学发展、行为与认知、精神与退行性疾病以及脑**研究领域的广泛应用前景。大脑的结构极为复杂,且主要功能区域的调节机制与小分子代谢物密切相关。基于色谱-质谱联用的传统代谢组学方法无法满足大脑复杂微区代谢物的定性、定量和定位表征的需求。空间分辨代谢组学进展和挑战。四川空间代谢组学...
1.AFADESI-MSI用于大脑中极性代谢物的定位如图1所示,将大鼠大脑连续矢状切面通过ESI探针对逐个像素进行扫描,并将解吸的代谢物离子传输到高分辨率质量分析仪进行分析。图1E是大鼠脑部某个像素点的一个代表性质谱图,在该图中可以观察到数千个代谢物的峰。AFADESI-MSI图像还表明脑部不同功能性区域中代谢物浓度的变化。图1A-D显示了代表性代谢产物图像,在松果体、纹状体、海马、胼胝体和嗅球等亚区域具有特定分布。这些异质代谢分布与大鼠脑的功能和结构复杂性高度一致。实验结果表明,AFADESI-MSI的空间分辨率小于100μm,代谢物质量比较大差异为0.001Da,同一物质的检测动态范围高达...
空间代谢组学:伦敦帝国理工学院George B Hanna教授团队及合作者在《Cancer Research》发表了题为“De novo lipogenesis alters the phospholipidome of esophageal adenocarcinoma"的研究成果,该研究整合磷脂代谢组学、空间代谢组学和遗传学方法,旨在阐明食管腺*的磷脂代谢重编程,对探索与疾病诊断相关的磷脂生物标志物具有重要意义。中文标题:脂质从头合成改变食管腺*磷脂代谢研究对象:食管腺*发表期刊:CancerResearch影响因子:12.701发表单位:伦敦帝国理工学院运用生物技术:空间代谢组学空间代谢...
AFADESI-MSI空间代谢组学:中文标题:一种基于分子组织学的高灵敏高覆盖质谱成像方法用于检测功能性代谢物研究对象:大鼠肾脏,大鼠脑和人食道*组织发表期刊:AdvancedScience影响因子:16.806运用生物技术:AFADESI-MSI空间代谢组学2018年11月中国医学科学院药物研究所再帕尔·阿不力孜教授、贺玖明研究员课题组在Advanced Science发表的研究论文,通过优化的空气动力辅助解吸电喷雾质谱成像(AFADESI-MSI)技术,绘制了生物样本中超过1500种代谢物的空间分布图谱,将功能代谢物的时空变化与组织结构和生物功能联系起来。本研究开发了一种灵敏且覆盖度广的A...
分子成像技术是研究大脑中DNA、RNA、蛋白质和代谢产物的强大工具。质谱成像技术(MSI)是一种检测大脑中蛋白质、代谢物和脂质物质的高灵敏度和高通量分子成像技术,在**边缘诊断、**生物标志物发现、药物分布和机理阐述等领域有***的应用。本文作者开发了一种基于敞开式空气动力辅助解吸电喷雾离子化质谱成像(AFADESI-MSI)技术的代谢网络映射方法,对大鼠脑不同极性的小分子代谢物(m/z50-500Da)进行微区分布研究,不仅鉴定出脑部几乎所有重要的代谢物,还绘制了包含神经递质、嘌呤,有机酸,多胺,胆碱、碳水化合物和脂类等20条通路的代谢网络,并使用这种代谢网络映射质谱成像方法解析了东莨菪碱致...
质谱成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作为一种新型的分子影像技术,能够直接从生物组织中获得大量已知或未知的内源性代谢物和外源***物等分子的结构、含量和空间分布信息。相对于其他成像方法(如荧光成像、放射性标记成像等),该技术无需化学或放射性标记、不需复杂样品前处理,具有高特异性、高通量和空间信息保留的突出优势。质谱成像技术可以实现生物组织中上千代谢物的定性、定量和定位分析,结合生物信息学分析,发展为空间代谢组学方法,可从生物组织原位发现差异代谢物,并识别其生物学功能。本篇小鹿盘点5篇空间代谢组学在科学研究中的经典应用~给您的组学研究提供更多支持~欧易生物空间代...
空间代谢组学:绘制了不同代谢物在组织内浓度的图像,直观显示了代谢物在NCE细胞、基质细胞和**细胞的浓度差异。在正离子和负离子模式下检测到的质量分别用红色加号和蓝色减号表示。组织边缘用黑色边框勾勒出轮廓,但**区域还包含一些无法单独注释的*细胞与基质的区域。ADP=二磷酸腺苷,ATP=三磷酸腺苷,GPEA=甘油磷酰乙醇胺,HBCt=羟基丁酰肉碱,HE=苏木精和伊红,LPC=溶血磷脂酰胆碱,NAA=N-乙酰天冬氨酸,PE=磷脂酰乙醇胺,PI=磷脂酰肌醇空间代谢组学二维乃至三维的水平,极大拓展了对组学样品信息的认知。河北软骨空间代谢组学AFADESI-MSI空间代谢组学:中文标题:一种基于分子组织...
空间代谢组学:伦敦帝国理工学院George B Hanna教授团队及合作者在《Cancer Research》发表了题为“De novo lipogenesis alters the phospholipidome of esophageal adenocarcinoma"的研究成果,该研究整合磷脂代谢组学、空间代谢组学和遗传学方法,旨在阐明食管腺*的磷脂代谢重编程,对探索与疾病诊断相关的磷脂生物标志物具有重要意义。中文标题:脂质从头合成改变食管腺*磷脂代谢研究对象:食管腺*发表期刊:CancerResearch影响因子:12.701发表单位:伦敦帝国理工学院运用生物技术:空间代谢组学鹿明生物...
鹿明生物AFADESI-MSI空间代谢组技术作为一种新型的分子影像技术,能够获得组织***中1000Da以下代谢物和药物的定性、定量、定位三个维度的信息。具有免标记、无需基质、周期短、定位准的特点。在获得AFADESI-MSI平台原创团队全力支持下,经过前期的研发以及1年时间的技术服务积累,鹿明生物已经完成了心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等二十几种临床/动物/植物组织样本的空间代谢组学检测及分析,积累了丰富的样本前处理经验。空间代谢组技术原理 。上海玉米空间代谢组学AFADESI-MSI空间代谢组学:中文标题:肝脏靶向纳米技术促进小檗碱改善心脏代谢疾病研究对象:小檗碱、小鼠发表期刊:N...
空间代谢组学:前列腺*组织样本中的不同组织区域具有不同的代谢特征。使用空间代谢组学确定了关键分子过程中的代谢差异,例如NCE、基质和**之间的脂质代谢和前列腺分泌功能。在不同组织结构中观察到的代谢物水平差异,表明了空间信息及其测量方法的重要性。本实验仍然存在一定的局限性,质谱成像过程中存在分子离域,可能导致结果假阴性。欧易生物、鹿明生物五、软著及**1、实验检测**1项2、空间代谢组定性及分析软著5项3、空间代谢组与空间转录组联合分析软著3项空间代谢组学,代谢组数据如何分析。云南空间代谢组学图片在获得AFADESI平台原创团队全力支持下,截止2021年9月,鹿明生物已经完成共计近千例样本经验,...
空间代谢组学:质谱成像技术近二十年来,随着质谱离子化技术的不断发展,质谱成像技术因其能够直观、快速、简便地呈现出分子在细胞或组织中的结构、空间与时间分布等信息,越来越受到大家的关注。并且质谱成像技术也被***的用在**疾病研究、药物前期发现等各领域的高质量文章中,为生物标志物的高灵敏度探测和药物代谢精确成像研究奠定了基础,下面进入到质谱“画”时代~是什么?有多少?在哪里?回答以上“灵魂”3问,首先需要了解他们之间的关系。质谱是通过采集化合物的质荷比,获得定性和定量的信息,进而去探究物质本身包含的化合物“是什么?”和“有多少?”这两个根本性问题。空间代谢组学又有什么用呢?。重庆空间代谢组学和心脏...
空间代谢组学:前列腺*组织的分子表征对于寻找新的生物标志物、验证临床生物标志物和确定潜在的***靶点非常重要。然而,前列腺*组织样本包含正常上皮、增生、基质和**区域,具有高度异质性,组织间固有的功能和分子差异导致常规的批量检测方法有不同程度的信息丢失。质谱成像(MSI)可以对组织切片不同区域中的潜在**标志物进行空间检测,有利于分析和比较不同组织类型的代谢组和脂质组学特征。鹿明生物已形成心、肝、脑等多个组织的空间代谢组专属数据库。质谱成像空间代谢组学方法及其应用研究进展。江苏空间代谢组学技术鹿明生物AFADESI-MSI空间代谢组技术作为一种新型的分子影像技术,能够获得组织***中1000D...
空间代谢组学:绘制了不同代谢物在组织内浓度的图像,直观显示了代谢物在NCE细胞、基质细胞和**细胞的浓度差异。在正离子和负离子模式下检测到的质量分别用红色加号和蓝色减号表示。组织边缘用黑色边框勾勒出轮廓,但**区域还包含一些无法单独注释的*细胞与基质的区域。ADP=二磷酸腺苷,ATP=三磷酸腺苷,GPEA=甘油磷酰乙醇胺,HBCt=羟基丁酰肉碱,HE=苏木精和伊红,LPC=溶血磷脂酰胆碱,NAA=N-乙酰天冬氨酸,PE=磷脂酰乙醇胺,PI=磷脂酰肌醇空间代谢组学是广大客户的选择,认准鹿明生物。江苏质谱成像与空间代谢组学再帕尔·阿不力孜、贺玖明研究团队运用空间代谢组学绘制大鼠脑代谢网络图。202...
基于AFADESI-MSI平台代谢物广覆盖度的优点,在临床样本以及动物样本中同时检测到胆碱类、多胺类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类、有机酸类、碳水化合物类、胆固醇类、胆酸类、脂质类等多种类代谢物,真正意义上满足了“空间代谢组学”的研究需求。相关研究成果发表在Gut、PNAS、APSB、Theranostics、AdvancedScience、Analyticalchemistry、AnalyticaChimicaActa等期刊上。目前鹿明生物已建立了特定组织专属的空间代谢组数据库鹿明生物2022给您带来的"极速"体验~空间代谢组性价比高.拥有专业技术团队。海南空间代谢组学的质谱成像空间代...
鹿明生物空间代谢组学项目实测结果1、可实现代谢物定性数量:1000-3000个代谢物。2、定性代谢物类型:不喷涂基质,小分子物质检测不被基质抑制,定性物质约70%为700Da以下的小分子物质,30%为脂质大分子。空间多组学联合:空间代谢+空间转录2021年即拥有空间代谢组和空间转录组(欧易生物)两个平台,已执行空间代谢+空间转录联合项目10+。空间多组学检测平台2套AFADESI-MSI成像系统,分别连接QE或者QE-HF高分辨质谱仪。***套AFADESI成像系统(连接Thermo QE高分辨质谱仪)第二套AFADESI成像系统系统(连接Thermo QE-HF高分辨质谱仪)空间代谢组突破传...
AFADESI-MSI空间代谢组学:中文标题:一种基于分子组织学的高灵敏高覆盖质谱成像方法用于检测功能性代谢物研究对象:大鼠肾脏,大鼠脑和人食道*组织发表期刊:AdvancedScience影响因子:16.806运用生物技术:AFADESI-MSI空间代谢组学2018年11月中国医学科学院药物研究所再帕尔·阿不力孜教授、贺玖明研究员课题组在Advanced Science发表的研究论文,通过优化的空气动力辅助解吸电喷雾质谱成像(AFADESI-MSI)技术,绘制了生物样本中超过1500种代谢物的空间分布图谱,将功能代谢物的时空变化与组织结构和生物功能联系起来。本研究开发了一种灵敏且覆盖度广的A...
空间代谢组学:伦敦帝国理工学院George B Hanna教授团队及合作者在《Cancer Research》发表了题为“De novo lipogenesis alters the phospholipidome of esophageal adenocarcinoma"的研究成果,该研究整合磷脂代谢组学、空间代谢组学和遗传学方法,旨在阐明食管腺*的磷脂代谢重编程,对探索与疾病诊断相关的磷脂生物标志物具有重要意义。中文标题:脂质从头合成改变食管腺*磷脂代谢研究对象:食管腺*发表期刊:CancerResearch影响因子:12.701发表单位:伦敦帝国理工学院运用生物技术:空间代谢组学欧易生物...