空间代谢组学：前列腺*组织的分子表征对于寻找新的生物标志物、验证临床生物标志物和确定潜在的***靶点非常重要。然而，前列腺*组织样本包含正常上皮、增生、基质和**区域，具有高度异质性，组织间固有的功能和分子差异导致常规的批量检测方法有不同程度的信息丢失。质谱成像（MSI）可以对组织切片不同区域中的潜在**标志物进行空间检测，有利于分析和比较不同组织类型的代谢组和脂质组学特征。鹿明生物已形成心、肝、脑等多个组织的空间代谢组专属数据库。质谱成像空间代谢组学方法及其应用研究进展。江苏空间代谢组学技术
鹿明生物AFADESI-MSI空间代谢组技术作为一种新型的分子影像技术，能够获得组织***中1000Da以下代谢物和药物的定性、定量、定位三个维度的信息。具有免标记、无需基质、周期短、定位准的特点。在获得AFADESI-MSI平台原创团队全力支持下，经过前期的研发以及1年时间的技术服务积累，鹿明生物已经完成了心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等二十几种临床/动物/植物组织样本的空间代谢组学检测及分析，积累了丰富的样本前处理经验。湖南空间代谢组学研究意义空间分辨代谢组学代谢组相关材料。
本篇为2021年8月，国家**中心中国医学院科学院**医院崔巍研究员与专业多组学技术团队合作在医学一区消化道领域国际期刊《GUT》期刊发表了题的研究成果，通过非靶向代谢组、靶向代谢组以及AFADESI-MSI空间代谢组学(研究方法，整合了宏基因组的数据，发现了可用于腺瘤及结直肠*诊断的代谢标志物，建立的相关预测模型显示出较高诊断准确性，为结直肠*早期诊断奠定坚实基础。在本研究中，作者对血清代谢组学和粪便宏基因组测序的结果进行整合分析，确定了一组与肠道微生物群密切相关的CRC和腺瘤患者的血清代谢物，并基于代谢物研发了肠道微生物组相关血清代谢物 (GMSM) 策略，可准确区分CRC和腺瘤患者（统称为结直肠异常）与正常健康个体。
质谱成像（Mass Spectrometry Imaging, MSI）作为一种新型的分子影像技术，能够直接从生物组织中获得大量已知或未知的内源性代谢物和外源***物等分子的结构、含量和空间分布信息。相对于其他成像方法（如荧光成像、放射性标记成像等），该技术无需化学或放射性标记、不需复杂样品前处理，具有高特异性、高通量和空间信息保留的突出优势。质谱成像技术可以实现生物组织中上千代谢物的定性、定量和定位分析，结合生物信息学分析，发展为空间代谢组学方法，可从生物组织原位发现差异代谢物，并识别其生物学功能。空间代谢组学研究应用前景广阔。
空间代谢组学研究作者对P493-6B细胞淋巴瘤系（BCL）进行了全基因组表达谱、核突变和ChIP分析，发现MYC诱导增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相关蛋白在内的脂肪酸（FA）合成基因的mRNA表达，在MYC诱导的肝细胞*（HCC）、急性白血病（T-ALL）和肾细胞*（RCC）的三种体内转基因小鼠模型中也有类似表达。还发现MYC与这些FA合成基因的启动子结合并启动mRNA转录，如甲羟戊酸和胆固醇途径基因的启动子。为了了解MYC和SREBP1之间的相互作用，作者首先，对这两种蛋白进行ChIP和re-ChIP分析，证明MYC和SREBP1都可以发现与FA合成基因启动子中的相同DNA分子结合（图1）。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表达，但不降低MYC基因的表达。其次，ChIP的MYC与启动子结合，不仅调节FA合成基因的表达，还调节糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表达。因此，MYC似乎会依次调节参与脂质合成的基因：首先诱导葡萄糖和谷氨酰胺，然后诱导FA合成相关基因。通过RNA测序（RNA-seq）发现，增加MYC水平会引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。空间代谢组学所解决的科研问题。北京空间代谢组学翻译
空间代谢组学二维乃至三维的水平,极大拓展了对组学样品信息的认知。江苏空间代谢组学技术
进行了相关的空间代谢组学研究来自同一患者的正常白质组织，旨在获得与患者再髓鞘病变相关的特定脂质谱（图6D−1）。通过串联质谱法确认鉴定的脂质，并在表2中报告。正如在小鼠组织分析中所观察到的，再髓鞘化区域主要在PC和PE脂质群的组成上不同。结果表明，HSL成像可以有效地用于多发性硬化患者死后病变的脂质谱分析，并表明多发性硬化患者再髓鞘化过程中产生的髓鞘与附近正常出现的白质相比具有改变的脂质谱。（a）正常白质(NAWM)和有髓鞘病变的平均拉曼光谱±1标准差(SD)。（b）平均差谱±1SD(NAWM−再髓鞘损伤)在结构水平显示再髓鞘过程。（c）基于有髓损伤的拉曼光谱的P***A后验概率图像突出NAWM(绿色)和有髓组织(红色)。江苏空间代谢组学技术
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