1.样本准备Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射东莨菪碱后被杀死(处理组,3只),对照组大鼠(3只)也用同样方法杀死。获取大鼠整个大脑,在低温下将大脑切成连续的矢状切片(暴露出海马和纹状体),用于Nissl染色、H&E染色和质谱成像检测。2.空间代谢组实验使用AFADESI-MSI分析,代谢物质量数范围50-500Da,质谱分辨率70,000。3.数据处理和代谢网络分析原始数据经过转化,再使用自建MassImager软件获取成像结果;在获取差异代谢物的高分辨率质谱信息后,使用Metaboanalys在线数据挖掘软件以褐家鼠(rattusnorvegicus)为参考完成代谢物高通量定性,并输出代谢网络信息。大脑中复杂网络可视化使用Cyctoscope软件完成。空间代谢组特异性强等优点。云南植物空间代谢组学
空间代谢组的成像。生成空间代谢组谱图和拉曼相关图,从而能够将振动光谱检测到的结构特征分配给通过质谱检测到的单个分子物种(图3D,E)。一般说来,数据显示了与多种不同脂质相关的拉曼振动峰之间的高度相关性。由于可以获得很好的相关性,作者随后对拉曼光谱和质谱进行了PLS多元回归。用作为例子,作者回归了m/z844.52pC(38:6)的拉曼光谱。回归载体显示高度特异的脂峰,表明对磷脂酰胆碱具有特异性(图3F)。回归分析表明,可建立高度线性关系(校正R2=0.825)(图3G)。假设在一级近似下质谱与浓度的线性关系,这个基于拉曼的模型可以作为复杂组织中特定脂质种类的预测因子。这些结果**了使用基于结构和生物分子信息的互补光谱模式的脂肪组谱的新证明。云南植物空间代谢组学空间代谢组学-代谢组学服务-擅长多组学联合分析。
空间代谢组学:比较了NCE细胞、基质细胞和**细胞的代谢差异。柠檬酸盐、天冬氨酸盐、锌和多胺精胺在正常前列腺上皮细胞中含量较高,在**细胞中则水平较低。牛磺酸、葡萄糖、肌酸、AMP、ADP和ATP水平较高,与正常前列腺上皮功能相关联的代谢物(柠檬酸盐,天冬氨酸盐,锌和精胺)水平较低。**组织中肉碱、乙酰肉碱、N-乙酰天冬氨酸、甘油磷酸乙醇胺这些与脂质合成和脂质重排相关的几种代谢物含量上调,导致磷脂酰乙醇胺(PE)和磷脂酰肌醇(PI)含量上升。
研究表明,MYC对磷脂酰肌醇(PI)代谢具有组织特异性。作者通过空间代谢组学检测到RCC和T-ALL中,MYC可逆地降低了PI;但在LC和HCC中,MYC反而增加了这些物质(图 7)。可能是由于肺表面富含PG和PI,MYC才会增加了LC中的PI含量。作者推断,MYC通常能够增加PGs含量,但以组织特异性方式差异调节其他GPs,如PIs。***作者对脂肪生成在MYC诱导的**发生中的作用进行了探究,通过空间代谢组学、IHC和Western Blot等方法证明通过体外抑制FA合成可以抑制MYC诱导的脂肪生成,从而抑制了RCC、HCC和BCL的增殖(图 8)。空间代谢组产品齐全,价格低,高效专业。
本篇为2021年8月,国家**中心中国医学院科学院**医院崔巍研究员与专业多组学技术团队合作在医学一区消化道领域国际期刊《GUT》期刊发表了题的研究成果,通过非靶向代谢组、靶向代谢组以及AFADESI-MSI空间代谢组学(研究方法,整合了宏基因组的数据,发现了可用于腺瘤及结直肠*诊断的代谢标志物,建立的相关预测模型显示出较高诊断准确性,为结直肠*早期诊断奠定坚实基础。在本研究中,作者对血清代谢组学和粪便宏基因组测序的结果进行整合分析,确定了一组与肠道微生物群密切相关的CRC和腺瘤患者的血清代谢物,并基于代谢物研发了肠道微生物组相关血清代谢物 (GMSM) 策略,可准确区分CRC和腺瘤患者(统称为结直肠异常)与正常健康个体。空间代谢组技术特点。海南质谱成像空间代谢组学
空间代谢组学-靶向代谢组学服务-擅长多组学联合分析。云南植物空间代谢组学
在空间上的代谢变化表明,在东莨菪碱***后,大鼠脑微区的代谢网络发生紊乱。但是代谢物和代谢酶是代谢网络的关键因素,基于空间分辨的代谢组学信息为发现酶或基因异常提供了线索,但若要完成完整的代谢网络分析必须进一步验证蛋白质和基因表达水平。本文作者开发了一种空间分辨代谢网络作图方法,通过无需衍生化、特定标记或复杂样品预处理的高通量AFADESI-MSI方法和代谢组学策略,在具有复杂结构化脑组织中发现代谢分子变化。能检测出多种极性内源性代谢物,并绘制相关代谢网络,提供组织微区分布的图谱。还将多种功能性小分子(例如核苷酸、多胺、肌酸、神经酰胺代谢物)含量分布可视化。云南植物空间代谢组学
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