1.样本准备Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射东莨菪碱后被杀死（处理组，3只），对照组大鼠（3只）也用同样方法杀死。获取大鼠整个大脑，在低温下将大脑切成连续的矢状切片（暴露出海马和纹状体），用于Nissl染色、H&E染色和质谱成像检测。2.空间代谢组实验使用AFADESI-MSI分析，代谢物质量数范围50-500Da，质谱分辨率70,000。3.数据处理和代谢网络分析原始数据经过转化，再使用自建MassImager软件获取成像结果；在获取差异代谢物的高分辨率质谱信息后，使用Metaboanalys在线数据挖掘软件以褐家鼠（rattusnorvegicus）为参考完成代谢物高通量定性，并输出代谢网络信息。大脑中复杂网络可视化使用Cyctoscope软件完成。空间代谢组通过质谱成像技术。河北软骨空间代谢组学
本文作者开发的一种基于敞开式空气动力辅助解吸电喷雾离子化质谱成像（AFADESI-MSI）的空间代谢组学技术，可以实现大脑功能区域小分子极性代谢物的检测，发掘微区特定代谢途径的变化；结合代谢网络映射方法，对大鼠脑的代谢网络作图，并用于东莨菪碱***的阿尔茨海默病模型大脑微区的病理过程解析。这篇文章证实了空间代谢组学技术在神经学发展、行为与认知、精神与退行性疾病以及脑**研究领域的广泛应用前景。大脑的结构极为复杂，且主要功能区域的调节机制与小分子代谢物密切相关。基于色谱-质谱联用的传统代谢组学方法无法满足大脑复杂微区代谢物的定性、定量和定位表征的需求。北京空间代谢组学商业应用空间代谢组学研究应用前景广阔。
空间代谢组学研究作者对P493-6B细胞淋巴瘤系（BCL）进行了全基因组表达谱、核突变和ChIP分析，发现MYC诱导增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相关蛋白在内的脂肪酸（FA）合成基因的mRNA表达，在MYC诱导的肝细胞*（HCC）、急性白血病（T-ALL）和肾细胞*（RCC）的三种体内转基因小鼠模型中也有类似表达。还发现MYC与这些FA合成基因的启动子结合并启动mRNA转录，如甲羟戊酸和胆固醇途径基因的启动子。为了了解MYC和SREBP1之间的相互作用，作者首先，对这两种蛋白进行ChIP和re-ChIP分析，证明MYC和SREBP1都可以发现与FA合成基因启动子中的相同DNA分子结合（图1）。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表达，但不降低MYC基因的表达。其次，ChIP的MYC与启动子结合，不仅调节FA合成基因的表达，还调节糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表达。因此，MYC似乎会依次调节参与脂质合成的基因：首先诱导葡萄糖和谷氨酰胺，然后诱导FA合成相关基因。通过RNA测序（RNA-seq）发现，增加MYC水平会引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。
AFADESI-MSI空间代谢组学：生物组织**能代谢物的空间分布可以更深层次的理解组织特异性分子组织学和病理学。问题的**在于开发一种非靶向、高灵敏度、高覆盖和高特异性的成像方法，能够可视化大量代谢产物在其自然状态下的空间分布。将功能代谢物的空间和时间变化与组织结构和生物功能联系起来，从根本上解释组织在分子水平上发生了什么。AFADESI-MSI 是一种高灵敏、高覆盖、宽动态范围、强特异性的组织代谢物成像分析技术，灵敏度可达到 pg 级，且代谢物含量动态范围跨越 3 个数量级，实现了组织微区的精确表征和质量数相近代谢物的准确识别，可对组织大小为 1 mm×1 mm~1.5 cm×3.5 cm 的样本进行代谢物空间成像分析。代谢组学分析、空间转录组测序价格、代谢组学分析。
鹿明生物空间代谢组学项目实测结果1、可实现代谢物定性数量：1000-3000个代谢物。2、定性代谢物类型：不喷涂基质，小分子物质检测不被基质抑制，定性物质约70%为700Da以下的小分子物质，30%为脂质大分子。空间多组学联合：空间代谢+空间转录2021年即拥有空间代谢组和空间转录组（欧易生物）两个平台，已执行空间代谢+空间转录联合项目10+。空间多组学检测平台2套AFADESI-MSI成像系统，分别连接QE或者QE-HF高分辨质谱仪。***套AFADESI成像系统（连接Thermo QE高分辨质谱仪）第二套AFADESI成像系统系统（连接Thermo QE-HF高分辨质谱仪）空间代谢组是基于质谱成像技术发展而来的，免标记、无需基质、周期短。重庆空间代谢组学图片
空间代谢组学:一种高灵敏、高覆盖质谱成像技术新技术。河北软骨空间代谢组学
空间代谢组学：食道腺*是全球第八大崔常见的恶性**发病率正在持续上升，但存活率仍然很低，目前急需新的工具来提高早期诊断和精确***。脂质代谢紊乱与**的发***展密切相关，大多数脂质以甘油磷脂（GPLs）的形式储存在双分子膜中，基于甘油磷脂具有较稳定的物理化学性质，因此将其作为疾病诊断的生物标志物具有重要意义。质谱成像(MSI)可在几分钟内对冷冻切片组织的**磷脂体量化并进行客观诊断。然而，MSI是否能客观识别原发性食管腺*目前尚不清楚，这是一个重大的挑战，因为该微环境复杂，组织类型的表型相似。河北软骨空间代谢组学
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