TMT蛋白质组学探究案例：2021年9月，安徽农业大学张照亮教授课题组在Journal of Agricultural and Food Chemistry期刊发表了题为“Nitrogen-Regulated Theanine and Flavonoid Biosynthesis in Tea Plant Roots: Protein-Level Regulation Revealed by Multiomics Analyses”的研究成果，通过TMT蛋白质组学和泛素化蛋白质组学研究方法，发现了氮缺乏条件下茶树根部响应的差异表达蛋白和泛素化蛋白质，为茶氨酸和黄酮类生物合成的调控提供了新的见解，为茶树翻译后修饰调控次生代谢的研究提供了理论依据。蛋白组学常见研究模式 | 蛋白质组专题_鹿明生物。福建蛋白组学研究杂志
采用TMT标记定量蛋白质组学技术对三个脱水特殊阶段（21、27和40DAP）的新鲜莲种胎进行了蛋白质组学分析，共鉴定了5,477个蛋白质。对测试样本进行了PCA分析，结果显示，不同组间样品具有很好的区分，每组的三个重复样本被聚集在一起。PCA的前两个成分占总方差的70％以上（图2A）。三个试验组之间共有815个差异表达蛋白。其中，198个（32%）和198个（26%）蛋白质丰度增加，而420个（68%）和558个（74%）蛋白质丰度在27DAP和40DAP组分别下降（图2B）。只有30个蛋白质的丰度在27DAP和40DAP组之间具有***变化（图2C）。江西蛋白组学平台建设蛋白组学专业客服在线为您答疑 。
随着质谱技术的飞速发展，特别是离子淌度的引入，增加了一个新的分离维度，将蛋白质组研究推进到全新的“4D蛋白质组”层面，打破了基于质谱的蛋白质组学研究的瓶颈，大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度，带来蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定量准确性等性能的***提升，可以更好的解决大队列、复杂体系以及微量样本的检测。相比于timsTOF Pro，timsTOF Pro 2 配备了***一代双TIMS分析器，离子容量可提高三倍。经过简化的离子透镜比较大限度地提高了离子传输效率和灵敏度，为4D-多组学建立了新的标准。CCS 值的加入让组学结果更精细，也使timsTOF Pro 2成为转化组学应用不可或缺的工具。timsTOF Pro 2 能够实现少量细胞群或生物穿刺样本等低样本量的蛋白组定量分析以及磷酸化蛋白质组学分析，在短梯度下实现蛋白深度覆盖。
本研究采用串联质量标签（TMT）标记的蛋白质组学和平行反应监测（PRM）技术，对莲子脱水过程中的生理调控网络进行了深入研究表明，碳水化合物代谢（包括糖酵解/糖异成、半乳糖代谢、淀粉和蔗糖代谢、磷酸戊糖途径和细胞壁组织）、ER中的蛋白质加工、DNA修复和抗氧化事件对莲种胎脱水有积极的反应。在莲种胚脱水过程中，非酶促抗氧化剂和戊糖磷酸和维生素E作为主要的抗氧化剂，在脱水过程中维持荷花胚胎的REDOX平衡。这些结果为揭示荷花胚胎脱水保护机制的生理学调控网络提供了酶途径在抗氧化保护中起着主要作用。应激生理学检测表明，H2O2是诱发氧化应激损伤的主要活性氧（ROS）成分，谷胱甘肽新的见解。修饰蛋白质组试剂及服务，蛋白质组学解决方案。
蛋白质组数据分析鉴定出了几种参与肝葡萄糖脂代谢的蛋白质（ACC、FASN、SCD1、CPT1A、GLUT2、GK、GS、G6Pase、PEPCK）。此外，AC显示出抑制脂肪生成酶（ACC，FASN和SCD1）表达的趋势，同时***上调了GLUT2。与对照组相比，AC***增加了PEPCK的表达，两种化学物质对G6Pase均无***影响（图4A）。PRM蛋白靶向验证测定结果与蛋白质组变化相一致，这进一步证实了蛋白质组学数据中蛋白质的表达（图4B）。转录组学和蛋白质组学联合分析结果显示AC和AL***改善了线粒体功能。GSEA分析显示，处理组的氧化磷酸化（OXPHOS）通路***上调，AC组和AL组的富集得分分别为0.826和0.535。蛋白组学研究组织,血液,植物,尿液,动物,细胞样品,酵母,微生物.。江西蛋白组学研究是什么
蛋白质组学基本策略 研究基础 研究内容 研究意义背景。福建蛋白组学研究杂志
通过蛋白质组学分析检测了经M-Exos处理的HBMECs的改变。外泌体***了HBMECs，在0、24和48小时各种基因的表达增加(图2A)。此外，热图分析揭示了不同表达的功能基因，包括与炎症、细胞增殖、免疫调节和血管生成相关的因素(图2B-E)。时序分析表明，HBMECs中标记基因的上调与炎症因子IL3RA有关，增殖相关蛋白CD40和免疫调节因子TNFRSF10C(图2F-H)。作者主要研究外泌体是否促进人脑微血管内皮细胞的血管生成能力，因此初步验证了M-Exos***后血管生成相关基因的表达。蛋白质印迹结果显示血管生成相关基因FlK1和ANGPT1的表达明显增强(图2I)。综上所述，结果证实了M-Exos诱导了人脑微血管内皮细胞的功能改变。福建蛋白组学研究杂志
上海欧易生物医学科技有限公司致力于医药健康，是一家服务型的公司。公司自成立以来，以质量为发展，让匠心弥散在每个细节，公司旗下科研服务，科研检测，学术研究，技术咨询深受客户的喜爱。公司从事医药健康多年，有着创新的设计、强大的技术，还有一批专业化的队伍，确保为客户提供良好的产品及服务。在社会各界的鼎力支持下，持续创新，不断铸造***服务体验，为客户成功提供坚实有力的支持。
