文章使用TMT标记定量蛋白质组学的方法，分析鉴定了差异表达的蛋白质，对下调的蛋白质进行基因本体论(GO)分析，显示下调参与线粒体电子传递链（ETC）的途径富集，证明了TM处理特别影响了具有较高细胞内铜水平的SOX2/OCT4+细胞中的线粒体ETC途径。确定TM介导的铜依赖性线粒体复合物IV失活是SOX2/OCT4+群体中的主要代谢缺陷。研究结果确定了铜-代谢-转移轴，并强调了其作为高危TNBC患者的下一代治疗方法的潜力。蛋白质组学分析确定了富含线粒体功能的途径。细胞色素c氧化酶 (Complex IV) 是一种线粒体金属酶，是线粒体ETC的终末酶。蛋白组学研究必看的经典综述。福建蛋白组学高通量
4D蛋白质组学分析发现，不同的病因和疾病的严重程度中蛋白表达存在差异。严重的疾病同急性期的蛋白的增加，补体系统蛋白及功能相关的蛋白相关；通过COVID-19和健康组对比，发现了49%的差异分析物；和脓毒症相比，G-CSF，IL-8等在严重的COVID-19患者中含量更低；蛋白和临床相关性分析则发现临床特征和某些蛋白呈强相关性。本研究通过4D蛋白组学技术结合其他组学技术及免疫技术，确定了COVID-19免疫特征和宿主反应等相关因素，并为进一步COVID-19的***打下了良好的基础。广东蛋白组学和代谢组学的区别蛋白质组学质谱分析蛋白质组学三大基本技术。
iTRAQ标记定量蛋白组学技术鉴定AHSG和RPL29分别是上调和下调*****的蛋白。301份肝*标本的统计分析表明AHSG与NMT1呈正相关，而RPL29与NMT1呈负相关（图8A）。此外，NMT1和AHSG均与**分期正相关，而RPL29与肝*的**分期呈负相关（图8B）。值得注意的是，NMT1和AHSG水平较高的肝*患者的生存率低于水平较低的肝*患者（图8C）。而较高水平的RPL29表明存活率较高（图8C）。这些数据表明NMT1、NUP和NDP与肝*的临床结果密切相关。iTRAQ蛋白质组学技术鉴定NMT1敲除时发生变化的蛋白质；
蛋白组学研究案例：2022年1月，欧易/鹿明生物合作客户北京中医药大学教育部中医养生学重点实验室刘铜华教授课题组在Frontiers in Nutrition期刊发表了题为 “Mechanisms for Improving Hepatic Glucolipid Metabolism by Cinnamic Acid and Cinnamic Aldehyde: An Insight Provided by Multi-Omics ”的研究成果，通过转录组学和蛋白质组学研究方法，发现了肉桂酸（AC）和肉桂醛（AL）在改善葡萄糖脂代谢中的特征，探究了其代谢作用机理。为预防和***代谢紊乱等疾病提供了理论依据。蛋白组学技术对肾错构瘤尿液差异蛋白的研究。
作者通过泛素化蛋白组学分析鉴定了茶树作根中的泛素化蛋白质。中文标题：氮调节茶树根中茶氨酸和黄酮类化合物的生物合成：多组学分析揭示的蛋白质水平调节研究对象：茶树根发表期刊：JournalofAgriculturalandFoodChemistry影响因子：5.279发表时间：2021年9月1日发表单位：安徽农业大学运用生物技术：TMT蛋白质组学、泛素化蛋白质组学(其中部分数据分析由鹿明生物提供技术支持)。本文分析了氮缺乏下茶树根部的茶氨酸和黄酮类代谢，通过蛋白质组和泛素化蛋白质组结合转录组数据探索了调节机制。本文的多组学数据整合分析思路值得借鉴。蛋白质组学 找欧易生物-生物标志物、机制研究一站式服务。江苏蛋白组学tmt报告解读
质谱技术,生物信息学方法,提供蛋白质组学 。福建蛋白组学高通量
并通过蛋白质组学和时间序列分析在血管生成中发挥着关键作用（图3E）。时间序列分析表明，外出刺激后ICAM1表达增加（图3F）。此外，当ICAM1在HBMECs中时，血管形成容量***降低（图3I/j）。这些结果表明M-Exos通过增加HBMECs中的ICAM1的表达来调节血管生成。蛋白质组学分析发现的差异表达蛋白与多种神经退行性疾病相关，包括帕金森病、阿尔茨海默病和亨廷顿病(图6B)。本研究运用蛋白质组学，蛋白质印迹，免疫荧光、免疫组化等分析了源自MSCs的外泌体可以使人脑微血管内皮细胞(HBMECs)保持活跃状态，有利于血管生成。应用PD小鼠模型发现MSCs的外泌体可以促进PD的恢复。结果可以为MSCs衍生的外泌体在PD***方面提供可能性。福建蛋白组学高通量
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