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蛋白组学基本参数
  • 品牌
  • 欧易生物
  • 公司名称
  • 上海欧易生物科技有限公司
  • 行业类型
  • 技术服务,科研服务,科学研究
  • 安全质量检测类型
  • 技术服务
  • 服务内容
  • 科研研究,报告检测,技术服务
  • 所在地
  • 上海,广东,山东,广西,广州,山西,深圳,海南,贵州,陕西,四川,中国台湾,河北,杭州,成都,西藏,河南,湖北,南京,天津,湖南,新疆,香港,吉林,武汉,重庆,江苏,安徽,江西,中国澳门,辽宁,甘肃,福建,宁夏,云南,浙江
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蛋白组学企业商机

通过蛋白质组学+转录组学研究方法,发现大黄素引发外泌体通过抑制代谢通路来减少肺泡巨噬细胞的活化和改善肺部炎症的特征,探究了外泌体在参与炎症相关***损伤中的重要作用,为大黄素可以通过减少胰腺外泌体介导的肺泡巨噬细胞活化来减轻严重急性胰腺炎相关的急性肺损伤提供依据。中文标题:大黄素通过抑制胰腺外泌体介导的肺泡巨噬细胞活化减轻严重急性胰腺炎相关的急性肺损伤研究对象:大鼠血浆外泌体发表期刊:ActaPharmaceuticaSinicaB影响因子:11.413发表时间:2021年10月合作单位:四川大学华西医院运用生物技术:TMT标记定量蛋白组学(由欧易/鹿明生物提供技术支持)、转录组学欧易生物鹿明生物蛋白组学联合分析。浙江靶向定量蛋白组学

蛋白质组定量到了10,529种蛋白质,磷酸化蛋白质组定量到了来自9,832个磷酸化蛋白的62,879个磷酸化位点。基因组确定了包括TP53、KRAS、FGFR2、IDH1/2、BAP1、ARID1A和PBRM1在内的16个***改变的**驱动基因(图1A)。与西方iCCA人群队列相比,本文队列显示出更高的KRAS突变频率和更低的IDH1、ARID1A和TERT突变频率(图1B)。在FU-iCCA队列中观察到黄曲霉***和马兜铃酸特征(图1C)。通过比较具有或不具有黄曲霉***特征的所有**的多组学数据,发现具有黄曲霉***特征的**显示出DNA修复和细胞周期通路的上调以及细胞凋亡、***炎症和免疫通路的下调(图1E)。进一步分析显示,TP53突变与黄曲霉***特征***相关(图1F和1G)。安徽蛋白组学课程蛋白组学研究组织,血液,植物,尿液,动物,细胞样品,酵母,微生物.。

随着质谱技术的飞速发展,特别是离子淌度的引入,增加了一个新的分离维度,将蛋白质组研究推进到全新的“4D蛋白质组”层面,打破了基于质谱的蛋白质组学研究的瓶颈,大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度,带来蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定量准确性等性能的***提升,可以更好的解决大队列、复杂体系以及微量样本的检测。相比于timsTOF Pro,timsTOF Pro 2 配备了***一代双TIMS分析器,离子容量可提高三倍。经过简化的离子透镜比较大限度地提高了离子传输效率和灵敏度,为4D-多组学建立了新的标准。CCS 值的加入让组学结果更精细,也使timsTOF Pro 2成为转化组学应用不可或缺的工具。timsTOF Pro 2 能够实现少量细胞群或生物穿刺样本等低样本量的蛋白组定量分析以及磷酸化蛋白质组学分析,在短梯度下实现蛋白深度覆盖。

使用TMT标记定量蛋白质组学分析,与GFP-群体相比,在GFP+细胞中TM处理后,线粒体复合物IV的多个亚基被特异性下调,对下调的蛋白质进行基因本体 (GO)分析,显示参与线粒体电子传递链 (ETC) 的通路富集。同时作者还分析了从人 LM2 细胞系中分选的 LM2 GFP+和 GFP- 细胞,在 TM 处理 48 小时后蛋白组学分析,揭示了GFP+细胞优先富集,同时揭示了线粒体 ETC 相关的通路。因此,TM 处理特别影响具有更高细胞内铜水平的 SOX2/OCT4+ 细胞中的线粒体 ETC 通路。蛋白质组学分析确定了富含线粒体功能的途径。细胞色素c氧化酶 (Complex IV) 是一种线粒体金属酶,是线粒体ETC的终末酶。蛋白质组学 找欧易生物-生物标志物、机制研究一站式服务。

作者通过iTRAQ蛋白质组学技术鉴定敲低NMT1后发生变化的蛋白质。结果鉴定到三种上调蛋白(LXN,RPL29andFAU)和六种下调蛋白(NMT1,MTPN,AHSG,ALB,GON7andTF)(图2A)。作者将这些蛋白质分别命名为N-豆蔻酰化下调蛋白(NDP)和上调蛋白(NUP)。有趣的是,敲低NMT1会减少NDP和NUP的N-豆蔻酰化,而过表达NMT1会诱导NDP和NUP的N-豆蔻酰化(图2B)。在小鼠模型中,敲除NMT1会导致NDP和NUP的去N-豆蔻酰化,这可以通过在肝脏中表达外源性NMT1来部分逆转(图2C)。这些发现表明,尽管NMT1对NDP和NUP的表达起着相反的作用,但NMT1同时刺激NDP和NUP的N-豆蔻酰化。定量蛋白质组学 蛋白质进行质谱检测未知蛋白进行全检测。江西全蛋白组学

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蛋白质组学研究方法研究案例:2021年10月,中国科学院上海营养与健康研究所武爱波研究员课题组在Ecotoxicology and Environmental Safety发表了题为“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通过转录组学和蛋白质组学研究方法,探究了脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)对成肌细胞分化的影响,发现了DON处理使得细胞骨架蛋白和细胞外基质蛋白表达下调,并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信号通路的机理,为食品和饲料污染的防治提供了理论依据。浙江靶向定量蛋白组学

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