作者运用iTRAQ标记定量蛋白组学对种子发育过程中蛋白质表达的定量比较，同时进行GO和KEGG通路富集分析。结果表明所有鉴定的蛋白被分为29类，主要涉及翻译和碳水化合物代谢。并且作者绘制了p值小于0.01的前20条KEGG通路的气泡图。在三对比较中，普遍富集的途径包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代谢。其中，参与α-亚麻酸代谢的DAPs在S3 vs. S1组和S4 vs. S1组中都非常活跃。为了评估转录组和蛋白质组之间的一致性，以及了解转录后的mRNA在蛋白质水平上是如何表现的，作者进行了RNA-seq和iTRAQ分析的联合分析。证明DEGs和DAPs参与类黄酮的生物合成和脂肪酸代谢。蛋白组学翻译后修饰筛选,检测,鉴定,定性,定量。江西尿液蛋白组学
为了验证TMT蛋白组学数据，作者选择了18个与莲种胚脱水保护功能密切相关的候选DEPs进行PRM蛋白靶向验证。PRM鉴定了18个候选DEPs。这些蛋白质的表达模式在PRM和TMT的定量结果之间显示出类似的趋势。然而，PRM检测到的蛋白丰度的倍数变化值要大于TMT数据。这一结果在很大程度上支持了TMT数据的可靠性。基于TMT标记定量蛋白质组学的生物信息学分析，对胁迫生理指标进行了测定，以验证莲种胚脱水的保护机制。在快速脱水阶段，REC和MDA含量的变化与RWC相反，它们的水平迅速增加（图6A，B）。ABA含量在快速脱水和脱水成熟阶段前略有增加（图6C）。上江苏外泌体蛋白组学蛋白质组学生物标志物&机制研究一站式服务。
3篇经典的蛋白组学和代谢组学在水产动物中的研究。水产动物的研究不仅是保障我国海水养殖业的健康可持续发展，同时可为良种创制、海洋环境研究、生态研究等提供重要理论基础和技术支撑~因此在水产生物研究方面蛋白组学、代谢组学在其中起到什么作用呢？期望这3篇经典文章能给您思路~中文标题：CO2诱导的海洋酸化损害了太平洋牡蛎对金氏弧菌的免疫功能:细胞和蛋白质组学的综合研究研究对象：牡蛎发表期刊：ScienceoftheTotalEnvironment影响因子：6.551合作单位：中国科学院海岸带研究所运用欧易/鹿明生物技术：iTRAQ标记定量蛋白质组学（由鹿明生物提供技术支持）
本研究通过生理和蛋白质组学分析在冬油菜中鉴定了大量的冷胁迫响应蛋白。探讨了冬油菜耐冻性增强的机理和低温胁迫对冬油菜形态和生理生化变化的影响。文章以耐冻型Longyou 7和冷敏感型Lenox为材料，通过iTRAQ标记蛋白组学和转录组学分析，揭示了谷胱甘肽转移酶活性、碳水化合物结合和谷胱甘肽结合、代谢过程及IAA反应与冷应激反应密切相关，鉴定出了Longyou 7和Lenox之间的DAPs，这些DAPs参与氨基酸、碳水化合物、脂质和能量代谢，对提高冬油菜的耐冻性发挥了重要作用。单细胞蛋白质组学，极微量样本检测。
在本研究中，利用iTRAQ标记定量蛋白组学方法对东京野茉莉种子发育的4个时间点采样进行蛋白质组学分析。获得了2338个蛋白和1473个DEPs。Mfuzz聚类分析显示，在种子发育过程中，转录本和蛋白质组之间存在相当大的时序一致性。在四个发育时期中，花后70天（种子发育活跃期）是视为东京野茉莉种仁发育的关键时期：在该阶段与脂肪酸生物合成相关的功能基因和酶蛋白均达到表达峰值，同时种仁内部大部分营养物质开始迅速积累。通过转录组数据和蛋白质组数据综合分析油脂合成的调控网络，乙酰CoA羧化酶和**酸脱氢酶两个酶体系处于中心位置，在脂肪酸的合成过程中具有主导作用。label free蛋白组学蛋白质组学原理。江西尿液蛋白组学
蛋白质组学-鹿明生物丨欧易生物。江西尿液蛋白组学
iTRAQ标记定量蛋白组学技术研究方法：2021年7月，海南大学园艺园林学院吴友根教授课题组等在《Horticulture Research》期刊发表了题为“Integrative iTRAQ-based proteomic and transcriptomic analysis reveals the accumulation patterns of key metabolites associated with oilquality during seed ripening of Camellia oleifera”的研究成果，通过RNA测序(RNA-seq)和iTRAQ标记定量蛋白组学技术研究方法，发现了油茶种子成熟过程中与油质相关关键代谢产物的积累模式特征，探究了不同成熟度油茶转录组和蛋白质组谱机理，描绘了海南油茶种子成熟过程的动态变化图谱。为该树种的遗传改良提供了理论依据。江西尿液蛋白组学
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