随着质谱技术的飞速发展，特别是离子淌度的引入，增加了一个新的分离维度，将蛋白质组研究推进到全新的“4D蛋白质组”层面，打破了基于质谱的蛋白质组学研究的瓶颈，大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度，带来蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定量准确性等性能的***提升，可以更好的解决大队列、复杂体系以及微量样本的检测。相比于timsTOF Pro，timsTOF Pro 2 配备了***一代双TIMS分析器，离子容量可提高三倍。经过简化的离子透镜比较大限度地提高了离子传输效率和灵敏度，为4D-多组学建立了新的标准。CCS 值的加入让组学结果更精细，也使timsTOF Pro 2成为转化组学应用不可或缺的工具。timsTOF Pro 2 能够实现少量细胞群或生物穿刺样本等低样本量的蛋白组定量分析以及磷酸化蛋白质组学分析，在短梯度下实现蛋白深度覆盖。蛋白质组学-鹿明生物丨欧易生物。江苏修饰蛋白组学
本研究通过生理和蛋白质组学分析在冬油菜中鉴定了大量的冷胁迫响应蛋白。探讨了冬油菜耐冻性增强的机理和低温胁迫对冬油菜形态和生理生化变化的影响。文章以耐冻型Longyou 7和冷敏感型Lenox为材料，通过iTRAQ标记蛋白组学和转录组学分析，揭示了谷胱甘肽转移酶活性、碳水化合物结合和谷胱甘肽结合、代谢过程及IAA反应与冷应激反应密切相关，鉴定出了Longyou 7和Lenox之间的DAPs，这些DAPs参与氨基酸、碳水化合物、脂质和能量代谢，对提高冬油菜的耐冻性发挥了重要作用。江苏修饰蛋白组学蛋白质组学多组学分析蛋白质组学研究进展。
使用TMT标记定量蛋白质组学分析，与GFP-群体相比，在GFP+细胞中TM处理后，线粒体复合物IV的多个亚基被特异性下调，对下调的蛋白质进行基因本体 (GO)分析，显示参与线粒体电子传递链 (ETC) 的通路富集。同时作者还分析了从人 LM2 细胞系中分选的 LM2 GFP+和 GFP- 细胞，在 TM 处理 48 小时后蛋白组学分析，揭示了GFP+细胞优先富集，同时揭示了线粒体 ETC 相关的通路。因此，TM 处理特别影响具有更高细胞内铜水平的 SOX2/OCT4+ 细胞中的线粒体 ETC 通路。蛋白质组学分析确定了富含线粒体功能的途径。细胞色素c氧化酶 (Complex IV) 是一种线粒体金属酶，是线粒体ETC的终末酶。
运用生物技术：TMT标记定量蛋白质组学、PRM蛋白靶向验证由鹿明生物提供技术支持：2021年12月，上海交通大学张荻课题组在Frontiers in Plant Science发表题为 TMT-Based Quantitative Proteomic Analysis Reveals the Physiological Regulatory Networks of Embryo Dehydration Protection in Lotus(Nelumbo nucifera)的研究成果，通过TMT标记蛋白质组学和平行反应监测蛋白靶向验证(PRM)技术研究方法，构建了莲花胚胎脱水保护的生理调控网络。为揭示荷花种子长寿的脱水保护机制提供了新的见解。蛋白组学研究组织,血液,植物,尿液,动物,细胞样品,酵母,微生物.。
蛋白质组数据分析鉴定出了几种参与肝葡萄糖脂代谢的蛋白质（ACC、FASN、SCD1、CPT1A、GLUT2、GK、GS、G6Pase、PEPCK）。此外，AC显示出抑制脂肪生成酶（ACC，FASN和SCD1）表达的趋势，同时***上调了GLUT2。与对照组相比，AC***增加了PEPCK的表达，两种化学物质对G6Pase均无***影响（图4A）。PRM蛋白靶向验证测定结果与蛋白质组变化相一致，这进一步证实了蛋白质组学数据中蛋白质的表达（图4B）。转录组学和蛋白质组学联合分析结果显示AC和AL***改善了线粒体功能。GSEA分析显示，处理组的氧化磷酸化（OXPHOS）通路***上调，AC组和AL组的富集得分分别为0.826和0.535。质谱技术,生物信息学方法,提供蛋白质组学 。江苏修饰蛋白组学
一站式服务,蛋白组学研究不同生物体在不同时刻/状态下蛋白质表达的变化。江苏修饰蛋白组学
作者通过泛素化蛋白组学分析鉴定了茶树作根中的泛素化蛋白质。中文标题：氮调节茶树根中茶氨酸和黄酮类化合物的生物合成：多组学分析揭示的蛋白质水平调节研究对象：茶树根发表期刊：JournalofAgriculturalandFoodChemistry影响因子：5.279发表时间：2021年9月1日发表单位：安徽农业大学运用生物技术：TMT蛋白质组学、泛素化蛋白质组学(其中部分数据分析由鹿明生物提供技术支持)。本文分析了氮缺乏下茶树根部的茶氨酸和黄酮类代谢，通过蛋白质组和泛素化蛋白质组结合转录组数据探索了调节机制。本文的多组学数据整合分析思路值得借鉴。江苏修饰蛋白组学
上海欧易生物医学科技有限公司致力于医药健康，是一家服务型公司。公司自成立以来，以质量为发展，让匠心弥散在每个细节，公司旗下科研服务，科研检测，学术研究，技术咨询深受客户的喜爱。公司注重以质量为中心，以服务为理念，秉持诚信为本的理念，打造医药健康良好品牌。在社会各界的鼎力支持下，持续创新，不断铸造高质量服务体验，为客户成功提供坚实有力的支持。
