蛋白质组定量到了10,529种蛋白质,磷酸化蛋白质组定量到了来自9,832个磷酸化蛋白的62,879个磷酸化位点。基因组确定了包括TP53、KRAS、FGFR2、IDH1/2、BAP1、ARID1A和PBRM1在内的16个***改变的**驱动基因(图1A)。与西方iCCA人群队列相比,本文队列显示出更高的KRAS突变频率和更低的IDH1、ARID1A和TERT突变频率(图1B)。在FU-iCCA队列中观察到黄曲霉***和马兜铃酸特征(图1C)。通过比较具有或不具有黄曲霉***特征的所有**的多组学数据,发现具有黄曲霉***特征的**显示出DNA修复和细胞周期通路的上调以及细胞凋亡、***炎症和免疫通路的下调(图1E)。进一步分析显示,TP53突变与黄曲霉***特征***相关(图1F和1G)。欧易生物鹿明生物蛋白组学联合分析。福建上清可以做蛋白组学吗
TMTpro-16plex等标记试剂已经发布一年,广受科研工作者喜爱。但是,对于6组3重复、3组6重复的实验设计,16plex却难以满足。TMTpro™ 18-plex标记蛋白组会是更好的选择方式。其中基于质谱仪平台的蛋白组学近年来备受青睐,稳定同位素标记策略也被广泛应用于多重定量蛋白质组学中。鹿明生物推出Thermo Scientific™ TMTpro™ 18-plex标记蛋白组,18个样本以内,可实现一次标记和分级,避免了多批次标记引入的批次效应,能***提升样本的数据质量。同时对更多蛋白质鉴定和定量,提供了样本的多通路处理水平。这个技术可谓是2021年的又一创新技术。江苏差异蛋白组学与基因相结合一文了解DIA、TMT/iTRAQ、传统Label free蛋白组学区别在哪。
并通过蛋白质组学和时间序列分析在血管生成中发挥着关键作用(图3E)。时间序列分析表明,外出刺激后ICAM1表达增加(图3F)。此外,当ICAM1在HBMECs中时,血管形成容量***降低(图3I/j)。这些结果表明M-Exos通过增加HBMECs中的ICAM1的表达来调节血管生成。蛋白质组学分析发现的差异表达蛋白与多种神经退行性疾病相关,包括帕金森病、阿尔茨海默病和亨廷顿病(图6B)。本研究运用蛋白质组学,蛋白质印迹,免疫荧光、免疫组化等分析了源自MSCs的外泌体可以使人脑微血管内皮细胞(HBMECs)保持活跃状态,有利于血管生成。应用PD小鼠模型发现MSCs的外泌体可以促进PD的恢复。结果可以为MSCs衍生的外泌体在PD***方面提供可能性。
2022年2月,亚特兰大埃默里大学医学院的Erik C. B. Johnson课题组在Nature neuroscience发表了题为 “Large-scale deep multi-layer analysis of Alzheimer’s disease brain reveals strong proteomic disease-related changes not observed at the RNA level”的研究成果,通过基因组学、转录组学、TMT标记定量蛋白质组学、代谢组学的研究方法,揭示了新的与AD相关的蛋白共表达模块,部分模块在RNA的网络中不存在。这为开发疾病***的潜在靶点提供依据,为临床的蛋白质组研究提供重要价值。蛋白组学近期研究进展的盘点。
作者进行了综合分析,将蛋白组学和代谢组学中的***生物标志物合并到通路分析中,并确定了半乳糖代谢、戊糖和葡萄糖醛酸盐相互转化、柠檬酸盐循环和**酸代谢这几种途径。然后结合蛋白质和代谢标志物来预测DKD状态。五种机器学习模型表明,组合模型提高了DKD预测的准确性和稳定性。图中展示了RF的结果。总的来说,组合多组学标志物模型是一种强有力的提高DKD诊断的方法。1.蛋白组学结果表明,α2-巨球蛋白、组织蛋白酶D和CD324可作为检测DKD进展的潜在生物标志物。2.代谢组学结果表明,半乳糖代谢和甘油脂代谢是DKD的主要代谢途径,此外甘油-3-半乳糖苷可作为预测DKD的**标志物。3.蛋白组学和代谢组学的组合可以提高预测和诊断DKD的准确性和稳定性。血清综合组学的生物标志物可用于DKD的预警和诊断。该研究为优化DKD的管理提供了数据资源。单细胞蛋白组学之质谱流式细胞技术。江苏营养蛋白组学
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通过蛋白质组学+转录组学研究方法,发现大黄素引发外泌体通过抑制代谢通路来减少肺泡巨噬细胞的活化和改善肺部炎症的特征,探究了外泌体在参与炎症相关***损伤中的重要作用,为大黄素可以通过减少胰腺外泌体介导的肺泡巨噬细胞活化来减轻严重急性胰腺炎相关的急性肺损伤提供依据。中文标题:大黄素通过抑制胰腺外泌体介导的肺泡巨噬细胞活化减轻严重急性胰腺炎相关的急性肺损伤研究对象:大鼠血浆外泌体发表期刊:ActaPharmaceuticaSinicaB影响因子:11.413发表时间:2021年10月合作单位:四川大学华西医院运用生物技术:TMT标记定量蛋白组学(由欧易/鹿明生物提供技术支持)、转录组学福建上清可以做蛋白组学吗
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