蛋白质组学技术研究案例:作为一种常见的******,脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)在田间或加工和储存过程中会污染谷物和饲料。DON在动物中会引起厌食和生长迟缓在内的一系列不良反应。本文作者使用转录组学和蛋白质组学技术对鼠C2C12细胞进行了研究,分析DON对成肌细胞分化的影响。研究结果表明,DON通过下调细胞骨架和ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信号通路来影响成肌细胞的分化。本文研究体现了组学技术在机制研究中的重要作用。中文标题:霉菌***脱氧雪腐镰刀菌烯醇通过下调细胞骨架和ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信号通路影响成肌细胞分化研究对象:脱氧雪腐镰刀菌烯醇、C2C12细胞发表期刊:EcotoxicologyandEnvironmentalSafety影响因子:6.291发表时间:2021年10月发表单位:中国科学院上海营养与健康研究所运用生物技术:转录组学和蛋白质组学(由欧易/鹿明生物提供技术支持)、免疫荧光、免疫印迹、PCR欧易鹿明生物蛋白质研究技术。江苏swath定量蛋白组学
iTRAQ标记定量蛋白组学技术研究方法:2021年7月,海南大学园艺园林学院吴友根教授课题组等在《Horticulture Research》期刊发表了题为“Integrative iTRAQ-based proteomic and transcriptomic analysis reveals the accumulation patterns of key metabolites associated with oilquality during seed ripening of Camellia oleifera”的研究成果,通过RNA测序(RNA-seq)和iTRAQ标记定量蛋白组学技术研究方法,发现了油茶种子成熟过程中与油质相关关键代谢产物的积累模式特征,探究了不同成熟度油茶转录组和蛋白质组谱机理,描绘了海南油茶种子成熟过程的动态变化图谱。为该树种的遗传改良提供了理论依据。辽宁蛋白组学疏水性分析蛋白质组学的特点蛋白质组和蛋白质组学的概念。
iTRAQ标记蛋白组学研究方法:2021年12月欧易/鹿明生物合作客户甘肃农业大学孙万仓教授课题组在Scientific Reports期刊发表的题为 “iTRAQ-Based Quantitative Proteome Analysis Insights into Cold Stress of Winter Turnip Rapa (Brassica rapa L.) Grown in the Field ”的研究成果,通过iTRAQ标记蛋白组学+转录组学研究方法,探究了茎尖分生组织的形态对冬油菜低温耐受性中的作用。中文标题:iTRAQ标记蛋白质组学分析揭示了低温胁迫对田间生长冬油菜的影响研究对象:白菜型冬油菜发表期刊:ScientificReports影响因子:4.17
单细胞蛋白组学研究方法:2020年9月,加州大学的MinnieM.Sarwal课题组在FrontiersinMedicine发表的题为“Near-Single-CellProteomicsProfilingoftheProximalTubularandGlomerulusoftheNormalHumanKidney”的研究成果,通过单细胞蛋白组学研究方法,分析正常人近端肾小管和肾小球区域的肾脏细胞,研究为解开急性和慢性肾脏疾病病因和肾脏亚细胞功能扰动提供依据。中文标题:正常人肾脏近端肾小管和肾小球的单细胞蛋白质组学分析研究对象:人体肾脏组织发表期刊:FrontiersinMedicine影响因子:5.091发表时间:2020年9月运用重点组学技术:单细胞蛋白质组学技术蛋白组学问题解答知乎都做不到哦。
为了更好地了解DON对C2C12细胞分化的影响,作者进行了转录组学和蛋白质组学的整合分析。共鉴定了149个共同的***差异基因(co-DEG),其中91%被共下调(图3A)。15%的co-DEG属于真核细胞骨架,其中大部分属于肌动蛋白丝,少数是中间丝和微管的成分。对co-DEG进行GO分析,生物学过程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗丝组装”和“快肌纤维收缩的正向调节”条目。细胞组分中富集的**个条目是“纤维蛋白原复合物”、“细胞外空间”、“细胞外基质”、“细胞外区域”和“蛋白质细胞外基质”,这些都是细胞外成分(图3B)。结果表明,DON主要影响肌肉成分的组成和功能以及多种细胞外成分的表达。通路富集分析富集到了“ECM-受体相互作用”、“蛋白质消化和吸收”、“人**瘤病毒***”和“粘着斑”等通路。蛋白组学技术对肾错构瘤尿液差异蛋白的研究。江苏swath定量蛋白组学
单细胞蛋白组学之质谱流式细胞技术。江苏swath定量蛋白组学
转录组学和蛋白质组学分析作者通过转录组学和蛋白质组学分析暴露于DON的C2C12细胞的差异基因(DEG)。转录组学鉴定了2387个DEG,其中72%被下调。蛋白质组学鉴定出402个DEG,其中74%被下调。GO和KEGG通路富集分析表明,转录组学DEGs参与了“男性主要性征的发育”、“骨骼肌肌球蛋白粗丝组装”和“骨骼肌收缩的调节”等生物学过程。**富集的通路是“ECM-受体相互作用”、“人**瘤病毒***”和“蛋白质消化吸收”。蛋白质组学分析中,富集到了“肌肉收缩”、“中间丝解聚”和“脂质转运”等生物学过程。细胞成分中富集到“细胞骨架”、“细胞外基质”和“整合素”。KEGG通路富集到“新霉素、卡那霉素和庆大霉素生物合成”、“系统性红斑狼疮”、“ECM-受体相互作用”和“蛋白质消化和吸收”。前两条通路与上调的DEG相关,而后两条通路与下调的DEG相关,这与转录组学结果一致。江苏swath定量蛋白组学
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