蛋白质组数据分析鉴定出了几种参与肝葡萄糖脂代谢的蛋白质(ACC、FASN、SCD1、CPT1A、GLUT2、GK、GS、G6Pase、PEPCK)。此外,AC显示出抑制脂肪生成酶(ACC,FASN和SCD1)表达的趋势,同时***上调了GLUT2。与对照组相比,AC***增加了PEPCK的表达,两种化学物质对G6Pase均无***影响(图4A)。PRM蛋白靶向验证测定结果与蛋白质组变化相一致,这进一步证实了蛋白质组学数据中蛋白质的表达(图4B)。转录组学和蛋白质组学联合分析结果显示AC和AL***改善了线粒体功能。GSEA分析显示,处理组的氧化磷酸化(OXPHOS)通路***上调,AC组和AL组的富集得分分别为0.826和0.535。走近蛋白组学之蛋白组学常见问题答疑解惑。辽宁高通量蛋白组学
蛋白质是生命活动的主要执行者,而蛋白质磷酸化修饰是生物体内**重要的共价修饰方式之一,真核生物体内有超过三分之一的蛋白可以发生磷酸化修饰。蛋白质的磷酸化和去磷酸化这一可逆过程调节着包括细胞增殖、发育、分化、信号转导、细胞凋亡、神经活动、肌肉收缩及**发生等过程在内的所有生命活动。单一的磷酸化蛋白质组学只能解释蛋白磷酸化水平发生的变化,而[黄金搭档]——蛋白质组与磷酸化蛋白质组联合分析,则在揭示疾病相关特性、筛选疾病生物标志物、寻找药物靶点等方面发挥了更加重要的作用。天津蛋白组学测序大概要多少钱蛋白组学—精选文章推荐。
转录组学和蛋白质组学分析作者通过转录组学和蛋白质组学分析暴露于DON的C2C12细胞的差异基因(DEG)。转录组学鉴定了2387个DEG,其中72%被下调。蛋白质组学鉴定出402个DEG,其中74%被下调。GO和KEGG通路富集分析表明,转录组学DEGs参与了“男性主要性征的发育”、“骨骼肌肌球蛋白粗丝组装”和“骨骼肌收缩的调节”等生物学过程。**富集的通路是“ECM-受体相互作用”、“人**瘤病毒***”和“蛋白质消化吸收”。蛋白质组学分析中,富集到了“肌肉收缩”、“中间丝解聚”和“脂质转运”等生物学过程。细胞成分中富集到“细胞骨架”、“细胞外基质”和“整合素”。KEGG通路富集到“新霉素、卡那霉素和庆大霉素生物合成”、“系统性红斑狼疮”、“ECM-受体相互作用”和“蛋白质消化和吸收”。前两条通路与上调的DEG相关,而后两条通路与下调的DEG相关,这与转录组学结果一致。
为了更好地了解DON对C2C12细胞分化的影响,作者进行了转录组学和蛋白质组学的整合分析。共鉴定了149个共同的***差异基因(co-DEG),其中91%被共下调(图3A)。15%的co-DEG属于真核细胞骨架,其中大部分属于肌动蛋白丝,少数是中间丝和微管的成分。对co-DEG进行GO分析,生物学过程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗丝组装”和“快肌纤维收缩的正向调节”条目。细胞组分中富集的**个条目是“纤维蛋白原复合物”、“细胞外空间”、“细胞外基质”、“细胞外区域”和“蛋白质细胞外基质”,这些都是细胞外成分(图3B)。结果表明,DON主要影响肌肉成分的组成和功能以及多种细胞外成分的表达。通路富集分析富集到了“ECM-受体相互作用”、“蛋白质消化和吸收”、“人**瘤病毒***”和“粘着斑”等通路。蛋白质组学生物标志物&机制研究一站式服务。
通过蛋白质组学+转录组学研究方法,发现大黄素引发外泌体通过抑制代谢通路来减少肺泡巨噬细胞的活化和改善肺部炎症的特征,探究了外泌体在参与炎症相关***损伤中的重要作用,为大黄素可以通过减少胰腺外泌体介导的肺泡巨噬细胞活化来减轻严重急性胰腺炎相关的急性肺损伤提供依据。中文标题:大黄素通过抑制胰腺外泌体介导的肺泡巨噬细胞活化减轻严重急性胰腺炎相关的急性肺损伤研究对象:大鼠血浆外泌体发表期刊:ActaPharmaceuticaSinicaB影响因子:11.413发表时间:2021年10月合作单位:四川大学华西医院运用生物技术:TMT标记定量蛋白组学(由欧易/鹿明生物提供技术支持)、转录组学蛋白组学专业客服在线为您答疑 。辽宁蛋白组学定量
蛋白质组学的特点蛋白质组和蛋白质组学的概念。辽宁高通量蛋白组学
并通过蛋白质组学和时间序列分析在血管生成中发挥着关键作用(图3E)。时间序列分析表明,外出刺激后ICAM1表达增加(图3F)。此外,当ICAM1在HBMECs中时,血管形成容量***降低(图3I/j)。这些结果表明M-Exos通过增加HBMECs中的ICAM1的表达来调节血管生成。蛋白质组学分析发现的差异表达蛋白与多种神经退行性疾病相关,包括帕金森病、阿尔茨海默病和亨廷顿病(图6B)。本研究运用蛋白质组学,蛋白质印迹,免疫荧光、免疫组化等分析了源自MSCs的外泌体可以使人脑微血管内皮细胞(HBMECs)保持活跃状态,有利于血管生成。应用PD小鼠模型发现MSCs的外泌体可以促进PD的恢复。结果可以为MSCs衍生的外泌体在PD***方面提供可能性。辽宁高通量蛋白组学
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