采用RNA-Seq转录组学分析和DIA蛋白质组学分析，研究了AC和AL对db/db小鼠的影响。转录组分析共鉴定出16812种不同的蛋白质编码转录本。其中，2837个（约16.9%）在正常组和对照组之间有***差异，表明db/db小鼠在转录水平上与野生型小鼠***不同。与对照组相比，共有3749个基因因摄入AC而发生***改变（2201个下调，1548个上调），560个基因（430个下调，130个上调）因摄入AL而发生***改变（图3B）。DIA蛋白质组学分析鉴定出2729种蛋白质。正常组和对照组之间共发现1059个（约占总鉴定蛋白质的38.8%）DEPs，AC处理有230个蛋白质发生***变化（109个上调，121个下调），AL处理有211个蛋白质发生***变化（116个上调，95个下调）。蛋白质组学生物标志物&机制研究一站式服务。江苏蛋白组学火山图
蛋白质组数据分析鉴定出了几种参与肝葡萄糖脂代谢的蛋白质（ACC、FASN、SCD1、CPT1A、GLUT2、GK、GS、G6Pase、PEPCK）。此外，AC显示出抑制脂肪生成酶（ACC，FASN和SCD1）表达的趋势，同时***上调了GLUT2。与对照组相比，AC***增加了PEPCK的表达，两种化学物质对G6Pase均无***影响（图4A）。PRM蛋白靶向验证测定结果与蛋白质组变化相一致，这进一步证实了蛋白质组学数据中蛋白质的表达（图4B）。转录组学和蛋白质组学联合分析结果显示AC和AL***改善了线粒体功能。GSEA分析显示，处理组的氧化磷酸化（OXPHOS）通路***上调，AC组和AL组的富集得分分别为0.826和0.535。北京蛋白组学结果可靠吗欧易鹿明生物基于质谱技术,生物信息学方法,提供蛋白质组学。
为了验证TMT蛋白组学数据，作者选择了18个与莲种胚脱水保护功能密切相关的候选DEPs进行PRM蛋白靶向验证。PRM鉴定了18个候选DEPs。这些蛋白质的表达模式在PRM和TMT的定量结果之间显示出类似的趋势。然而，PRM检测到的蛋白丰度的倍数变化值要大于TMT数据。这一结果在很大程度上支持了TMT数据的可靠性。基于TMT标记定量蛋白质组学的生物信息学分析，对胁迫生理指标进行了测定，以验证莲种胚脱水的保护机制。在快速脱水阶段，REC和MDA含量的变化与RWC相反，它们的水平迅速增加（图6A，B）。ABA含量在快速脱水和脱水成熟阶段前略有增加（图6C）。上
本文为了探究其潜在的分子机制，作者运用RNA测序（RNA-seq）和iTRAQ标记定量蛋白组学，对不同成熟度水平的油脂种子进行了研究。不仅揭示了关键候选基因和蛋白质的时间特异性表达，而且为该树种的遗传改良提供了科学依据。中文标题：基于iTRAQ蛋白质组学和转录组学联合分析揭示油茶种子成熟过程中油质相关的关键代谢产物的积累研究对象：油茶种子发表期刊：HorticultureResearch影响因子：6.793发表时间：2021.07.01发表单位：海南大学园艺园林学院运用生物技术：RNA测序(RNA-seq)和iTRAQ标记定量蛋白组学、转录组学、蛋白组学文章中iTRAQ标记定量蛋白组学由欧易/鹿明生物提供技术支持4D-蛋白组+代谢组双平台知识干货带您。
2022年2月，亚特兰大埃默里大学医学院的Erik C. B. Johnson课题组在Nature neuroscience发表了题为 “Large-scale deep multi-layer analysis of Alzheimer’s disease brain reveals strong proteomic disease-related changes not observed at the RNA level”的研究成果，通过基因组学、转录组学、TMT标记定量蛋白质组学、代谢组学的研究方法，揭示了新的与AD相关的蛋白共表达模块，部分模块在RNA的网络中不存在。这为开发疾病***的潜在靶点提供依据，为临床的蛋白质组研究提供重要价值。蛋白组学技术对肾错构瘤尿液差异蛋白的研究。福建修饰蛋白组学
蛋白验证新技术-PRM,平行反应监视蛋白组学。江苏蛋白组学火山图
iTRAQ标记蛋白组学研究方法：2021年12月欧易/鹿明生物合作客户甘肃农业大学孙万仓教授课题组在Scientific Reports期刊发表的题为 “iTRAQ-Based Quantitative Proteome Analysis Insights into Cold Stress of Winter Turnip Rapa (Brassica rapa L.) Grown in the Field ”的研究成果，通过iTRAQ标记蛋白组学+转录组学研究方法，探究了茎尖分生组织的形态对冬油菜低温耐受性中的作用。中文标题：iTRAQ标记蛋白质组学分析揭示了低温胁迫对田间生长冬油菜的影响研究对象：白菜型冬油菜发表期刊：ScientificReports影响因子：4.17江苏蛋白组学火山图
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