2021 年 1 月,山东大学齐鲁医院泌尿外科李岩老师发表了小鼠膀胱尿路上皮细胞图谱和上皮亚群分化特征的相关成果,文章的 10x Genomics 单细胞转录组测序实验和分析工作由欧易生物提供。该研究对小鼠的膀胱上皮进行了高通量单细胞转录组测序,绘制了小鼠膀胱尿路上皮细胞图谱,发现了一种可能与宿主反应和伤口愈合有关的新型 Plxna4+ 膀胱尿路上皮细胞,以及一群由 ASPM 标记的基底样细胞,可能是膀胱尿路上皮祖细胞。通过 SCENIC 分析确定了调控尿路上皮细胞分化的关键转录因子,发现了膀胱疾病相关调控基因在不同尿路上皮细胞亚群中存在差异表达。该研究解析了小鼠膀胱尿路上皮细胞的特征,为膀胱尿路上皮和膀胱疾病的相关研究提供生物学基础。2.作为国内首批引入Chromium X平台的公司,欧易生物的百万级单细胞研究Chromium X 仪器正式落地。广西介绍单细胞测序电话多少
由于每个单细胞都是独特的,不可能开展重复实验并评估噪音。因此,必须采取一些质量控制手段,以确保数据的可靠性。**建议,向每个细胞裂解液中加入已知序列和数量的合成mRNA,如外源RNA对照联盟(ERCC)开发的加标RNA。这些RNA的读数将提供样本间差异的信息。总的来说,单细胞水平的转录组分析可以揭示细胞群体中的细胞异质性,强调了个别细胞的与众不同。此外,同时分析多种分子(如DNA、RNA和蛋白质)的方法也不断被开发出来。这种更***的单细胞组图有望进一步加深我们对生物学过程的了解,对未来的科研及临床研究大有裨益。内蒙古推荐单细胞测序欧易生物也在单细胞研发上投入精力,目前在研的多组合标签技术,力争让单细胞降至千元级别。
单细胞悬液制备难于标准化。
基于酶学的样本处理方法,大都会存在一定程度的解离偏好性,即不同的酶处理不同的组织往往会有不太一样的「效果」,而这种效果不仅*反应在细胞得率,细胞活性和细胞碎片等参数上,往往也会在**终细胞类型有所反映,比如可能会导致部分稀有细胞的丢失,细胞比例的失真等,从而偏离组织的真实状态。另外,细胞悬液的制备过程较长,通常需要3-5小时,这个过程会导致细胞处于「应激状态」中,转录的过程可能已经发生变化,偏离临床实验的终点设计,会对结果的判断造成一定的影响。针对如上问题,欧易团队从已发表的高影响力的文献中,汇总出针对不同类型组织的处理方法,确保实验结果与文献并轨(同频)。对于应激问题,我们也开发出了低温解离方法,使样本始终处于「休眠」状态,从而保证了样本符合临床取样终点,还原其生物学的真实状态。另外细胞核测序也是一个替代的选择,对样本的要求较低,可以解锁大量临床信息明确、低温冷冻的标本。细胞核制备也不依赖于酶学,全程在低温环境,也能真实还原样本的临床状态。欧易在细胞核测序的核悬液准备上积累了很多经验。
2021年第四季度,欧易生物单细胞测序客户文章持续井喷,据不完全统计,第四季度目前已经接受了10+篇客户文章。在这些客户文章中,***为大家带来的这篇尤为特殊,该研究使用了单细胞RNA与单细胞ATAC双平台深度解析了小鼠胸腺、脾脏和淋巴结γ δ T细胞的异质性图谱特征。该研究是由暨南大学医学部生物医学转化研究院/珠海市人民医院尹芝南教授课题组(李振华博士后、杨全利博士后和唐欣博士后为论文***作者,尹芝南教授和曹广超副研究员为论文共同通讯作者)在Science Bulletin上在线发表的题为“Single-cell RNA-seq and chromatin accessibility profiling decipher the heterogeneity of mouse γ δ T cells”的研究论文,欧易生物***技术支持经理巴永兵为本篇文章的署名作者。24.简单构建某个组织细胞图谱就能发高分文章”的技术红利时代,已经一去不复返了。
inferCNV 是一款 R 包,用来探索**单细胞转录组数据中体细胞大规模染色体拷贝数变异,例如整个染色体或大片段染色体的扩增(gain)或缺失(loss)。通过与一组参考的“正常”细胞比较,探索**基因组不同位置的基因表达强度来实现。通过热图显示每条染色体上的相对表达强度,在以正常细胞作为参考的情况下可以直观地判断**基因组上的哪些区域是过表达和低表达。为了提高推断结果的可靠性,inferCNV 采用几种 residual expression 过滤方法减少数据中噪声信号,从而发现真正的 CNV 的信号。单细胞测序未来在基础科研乃至医学、农学等各个应用研究领域具有无限的潜力,将是未来科学发展的重要方向。云南介绍单细胞测序收费
在单细胞测序方向,欧易生物运行多套10x Genomics Chromium和BD Rhapsody平台,已完成数千例样本的项目。广西介绍单细胞测序电话多少
欧易BD平台单细胞客户文章来了!单细胞测序持续发力!近日,复旦大学周祥、吴小华教授为共同通讯作者,在ClinicalandTranslationalMedicine(IF:11.492)期刊发表了关于高级别浆液性卵巢*的单细胞转录组测序相关成果,揭示了高级别浆液性卵巢*的异质性和潜在***靶点。欧易生物提供了该项目单细胞转录组测序和分析相关工。
材料:2个病人原发和转移配对的HGSOC
样本期刊:ClinicalandTranslationalMedicine
发表时间:2021年7月30日
方法:欧易生物BDRhapsodyscRNA-seq 广西介绍单细胞测序电话多少
上海欧易生物医学科技有限公司主要经营范围是医药健康,拥有一支专业技术团队和良好的市场口碑。公司业务涵盖科研服务,科研检测,学术研究,技术咨询等,价格合理,品质有保证。公司秉持诚信为本的经营理念,在医药健康深耕多年,以技术为先导,以自主产品为重点,发挥人才优势,打造医药健康良好品牌。欧易生物秉承“客户为尊、服务为荣、创意为先、技术为实”的经营理念,全力打造公司的重点竞争力。