空间代谢组学:利用基质进行空间成像——MALDI质谱分子成像技术MALDI-MSI分析中非常关键的一点是需要添加基质来吸收激光能量,实现被测物的离子化,主要对脂质类化合物具有较好的分析效果, 空间分辨率比较高可以达到数个微米。其中,MALDI和DESI成像技术目前属于比较完善,使用范围较广的成像技术。这两种技术与质谱相连,使用范围有一定的互补性。二者结合使用,可实现“全谱图分子成像”,相信也有很多老师想要了解这二种成像方式有什么特点呢?空间代谢组三个维度的分析。河南空间代谢组学商业应用
空间代谢组学研究作者对P493-6B细胞淋巴瘤系(BCL)进行了全基因组表达谱、核突变和ChIP分析,发现MYC诱导增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相关蛋白在内的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表达,在MYC诱导的肝细胞*(HCC)、急性白血病(T-ALL)和肾细胞*(RCC)的三种体内转基因小鼠模型中也有类似表达。还发现MYC与这些FA合成基因的启动子结合并启动mRNA转录,如甲羟戊酸和胆固醇途径基因的启动子。为了了解MYC和SREBP1之间的相互作用,作者首先,对这两种蛋白进行ChIP和re-ChIP分析,证明MYC和SREBP1都可以发现与FA合成基因启动子中的相同DNA分子结合(图1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表达,但不降低MYC基因的表达。其次,ChIP的MYC与启动子结合,不仅调节FA合成基因的表达,还调节糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表达。因此,MYC似乎会依次调节参与脂质合成的基因:首先诱导葡萄糖和谷氨酰胺,然后诱导FA合成相关基因。通过RNA测序(RNA-seq)发现,增加MYC水平会引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。湖北质谱成像与空间代谢组学欧易生物空间代谢组学。
空间代谢组学:比较了NCE细胞、基质细胞和**细胞的代谢差异。柠檬酸盐、天冬氨酸盐、锌和多胺精胺在正常前列腺上皮细胞中含量较高,在**细胞中则水平较低。牛磺酸、葡萄糖、肌酸、AMP、ADP和ATP水平较高,与正常前列腺上皮功能相关联的代谢物(柠檬酸盐,天冬氨酸盐,锌和精胺)水平较低。**组织中肉碱、乙酰肉碱、N-乙酰天冬氨酸、甘油磷酸乙醇胺这些与脂质合成和脂质重排相关的几种代谢物含量上调,导致磷脂酰乙醇胺(PE)和磷脂酰肌醇(PI)含量上升。
作者使用NMR对C原子进行示踪实验,发现MYC驱动葡萄糖和谷氨酰胺的C参与脂肪生成(图3)。采用空间代谢组学检测小鼠模型以及人BCL细胞中的FA,发现MYC**中不饱和脂肪酸(FA(18:1))的丰度增加。进一步发现13C-油酸酯在MYC诱导的BCL细胞未发生代谢,而13C-葡萄糖增加了不饱和FA中的标记碳。当MYC失活时,细胞中3H标记的棕榈酸酯氧化速率明显变高。MYC-ON和MYC-OFF的BCL细胞中的油酸酯均未被氧化。因此,MYC可能在抑制FA氧化的同时上调FA的合成。空间代谢组是基于质谱成像技术发展而来的,免标记、无需基质、周期短。
空间代谢组学能够在复杂的EA微环境中区分组织类型,本文作者使用两个队列对食管腺*的甘油磷脂特征进行了表征。**初运用空间代谢组学对连续患者的成对手术切除活检(EA和MHEE)进行甘油磷脂差异分析;(样本策略)选择这种取样方法的目的是为了进行手术切缘分析,并通过取样更大的样本来克服**的区域代谢组学差异。接下来,采用内窥镜活检对第二组人群进行采样。这样就可以从健康的志愿者和Barrett化***育不良的患者身上获得标本。这样还使作者能够验证***个队列的发现,调查该技术在小样本上的表现,并演示在内镜套件中促进诊断的第二次临床应用。空间代谢组学 技术咨询中心。辽宁空间代谢组学图片
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空间代谢组学探究靶向纳米技术促进肝脏吸收机制研究。中文标题:肝脏靶向纳米技术促进小檗碱改善心脏代谢疾病研究对象:小檗碱、小鼠发表期刊:NatureCommunications影响因子:14.919发表单位:中国医学科学院药物研究所运用生物技术:AFADESI-MSI空间代谢组学、WesternBlotting、RT-PCR、Flowcytometry和ELISA等,心血管和代谢疾病(CMD)是引起全世界人口过早死的主要原因。CMD有较高的发病率和死亡率,且医疗成本越来越高。本篇由中国医学科学院药物研究所蒋建东团队课题组在Nature Communications发表的研究成果,通过AFADESI-MSI空间代谢组学、Western Blotting、RT-PCR、Flow cytometry和ELISA等技术研究BBR-CTA-Mic对高脂饮食小鼠的代谢紊乱和******效果,发现BBR-CTA-Mic不仅可有效促进肝脏沉积和肝细胞摄取BBR,还能降低血浆中的脂质和促炎细胞因子。河南空间代谢组学商业应用
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